54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2255 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_2255  hypothetical protein  100 
 
 
198 aa  393  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0302471  normal  0.290455 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2574  hypothetical protein  91.41 
 
 
198 aa  316  1e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0806322 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2299  hypothetical protein  92.42 
 
 
198 aa  313  9.999999999999999e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00163404  hitchhiker  0.00316574 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4778  hypothetical protein  77.7 
 
 
187 aa  234  7e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.241672  normal  0.311551 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2698  hypothetical protein  74.64 
 
 
196 aa  224  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703285  normal  0.0769934 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4668  hypothetical protein  71.94 
 
 
180 aa  222  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0121  hypothetical protein  48.2 
 
 
184 aa  135  4e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0880  hypothetical protein  42.07 
 
 
191 aa  131  7.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.574184  normal  0.149249 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3222  hypothetical protein  40.29 
 
 
181 aa  100  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1222  hypothetical protein  30.94 
 
 
174 aa  78.2  0.00000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3484  hypothetical protein  30.22 
 
 
175 aa  73.6  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.807247  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1481  hypothetical protein  27.61 
 
 
169 aa  68.6  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2077  hypothetical protein  26.15 
 
 
173 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.759836  normal  0.201615 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2056  hypothetical protein  32.99 
 
 
169 aa  61.6  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2195  hypothetical protein  29.87 
 
 
169 aa  61.6  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3385  hypothetical protein  31.96 
 
 
169 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.139305 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0977  hypothetical protein  30.33 
 
 
178 aa  61.2  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0492338  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1011  hypothetical protein  30.33 
 
 
178 aa  61.2  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.578847  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0603  hypothetical protein  27.01 
 
 
180 aa  56.6  0.0000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.376516  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1572  hypothetical protein  29.51 
 
 
180 aa  54.7  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0621324  normal  0.847942 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0969  hypothetical protein  25.76 
 
 
156 aa  53.5  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2093  hypothetical protein  27.87 
 
 
178 aa  53.1  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2762  hypothetical protein  28.92 
 
 
159 aa  50.4  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1460  hypothetical protein  24.83 
 
 
187 aa  49.3  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2269  hypothetical protein  32.95 
 
 
184 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.277988  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1992  hypothetical protein  32.95 
 
 
184 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1947  hypothetical protein  33.33 
 
 
184 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.26145  normal  0.161033 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0067  hypothetical protein  26.8 
 
 
203 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.68024  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0085  hypothetical protein  27.27 
 
 
201 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0635336  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0073  hypothetical protein  27.27 
 
 
201 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.260835  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2012  hypothetical protein  25.35 
 
 
189 aa  45.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0921  hypothetical protein  38.64 
 
 
199 aa  45.4  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.189751 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0975  hypothetical protein  38.64 
 
 
200 aa  45.1  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.792265  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3008  hypothetical protein  38.64 
 
 
200 aa  45.4  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.439263  normal  0.0175775 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1633  hypothetical protein  38.64 
 
 
198 aa  45.1  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4154  hypothetical protein  38.64 
 
 
199 aa  45.1  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2999  hypothetical protein  38.64 
 
 
198 aa  45.4  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.796901  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0434  hypothetical protein  38.64 
 
 
198 aa  45.4  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.733468  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0952  hypothetical protein  38.64 
 
 
200 aa  45.1  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1000  hypothetical protein  38.64 
 
 
200 aa  45.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240362  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0562  hypothetical protein  38.64 
 
 
199 aa  45.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.034618  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2263  hypothetical protein  38.64 
 
 
199 aa  45.1  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.123196  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0917  hypothetical protein  38.64 
 
 
200 aa  45.4  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0981814  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1041  hypothetical protein  38.64 
 
 
199 aa  45.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2577  hypothetical protein  38.64 
 
 
198 aa  45.4  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0196  hypothetical protein  38.64 
 
 
198 aa  45.4  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2950  hypothetical protein  38.64 
 
 
200 aa  45.1  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.149218  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2887  hypothetical protein  38.64 
 
 
198 aa  45.4  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0739  hypothetical protein  40.91 
 
 
202 aa  45.1  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0225  hypothetical protein  25.53 
 
 
166 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.112746 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1988  hypothetical protein  34.25 
 
 
158 aa  43.9  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.830663  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4092  hypothetical protein  47.06 
 
 
172 aa  43.9  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784057  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2231  hypothetical protein  24.65 
 
 
187 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.647185 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2525  hypothetical protein  26.92 
 
 
152 aa  42.4  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0188206  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>