More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0771 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_0771  CDP-glucose 4,6-dehydratase  100 
 
 
372 aa  743    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0223168 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0847  CDP-glucose 4,6-dehydratase  91.55 
 
 
368 aa  638    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.307113  normal  0.210188 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0806  CDP-glucose 4,6-dehydratase  92.03 
 
 
364 aa  647    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0841534  normal  0.289555 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4010  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.34 
 
 
358 aa  427  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal  0.168772 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2291  CDP-glucose 4,6-dehydratase  62.68 
 
 
361 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.966324  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1880  CDP-glucose 4,6-dehydratase  59.22 
 
 
358 aa  417  9.999999999999999e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.457819 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3050  CDP-glucose 4,6-dehydratase  56.53 
 
 
391 aa  412  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3190  CDP-glucose 4,6-dehydratase  56.53 
 
 
357 aa  412  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.170575  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0783  CDP-glucose 4,6-dehydratase  57.91 
 
 
357 aa  413  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0774  CDP-glucose 4,6-dehydratase  55.86 
 
 
362 aa  405  1.0000000000000001e-112  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0920711 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3789  CDP-glucose 4,6-dehydratase  57.14 
 
 
361 aa  403  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0332  CDP-glucose 4,6-dehydratase  57.22 
 
 
364 aa  402  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.106161  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3401  CDP-glucose 4,6-dehydratase  58.68 
 
 
372 aa  402  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2324  CDP-glucose 4,6-dehydratase  54.55 
 
 
359 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00566999 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2273  CDP-glucose 4,6-dehydratase  54.55 
 
 
359 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000124958 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2216  CDP-glucose 4,6-dehydratase  54.55 
 
 
359 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.776521  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2317  CDP-glucose 4,6-dehydratase  54.26 
 
 
359 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0156634 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0709  CDP-glucose 4,6-dehydratase  54.21 
 
 
356 aa  388  1e-107  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1962  CDP-glucose 4,6-dehydratase  56.58 
 
 
357 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0663  CDP-glucose 4,6-dehydratase  56.58 
 
 
361 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2431  CDP-glucose 4,6-dehydratase  54.55 
 
 
359 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.310419  hitchhiker  0.0000678484 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0569  CDP-glucose 4,6-dehydratase  56.58 
 
 
361 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.76383  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3349  CDP-glucose 4,6-dehydratase  55.84 
 
 
358 aa  386  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1689  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.86 
 
 
357 aa  383  1e-105  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1131  CDP-glucose 4,6-dehydratase  55.9 
 
 
367 aa  378  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1983  CDP-glucose 4,6-dehydratase (O-antigen-related)  55.21 
 
 
357 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1960  CDP-glucose 4,6-dehydratase  55.39 
 
 
362 aa  375  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0856  CDP-glucose 4,6-dehydratase  55.52 
 
 
367 aa  373  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3718  CDP-glucose 4,6-dehydratase  50.97 
 
 
360 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.316077  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2876  CDP-glucose 4,6-dehydratase  56.29 
 
 
355 aa  354  1e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4735  CDP-glucose 4,6-dehydratase  53.82 
 
 
363 aa  347  2e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  0.159125 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4510  CDP-glucose 4,6-dehydratase  53.03 
 
 
354 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0220164  normal  0.0184859 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3658  CDP-glucose 4,6-dehydratase  53.82 
 
 
363 aa  347  2e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.758357  normal  0.169877 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1424  hypothetical protein  48.29 
 
 
361 aa  343  2e-93  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0353322  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4218  CDP-glucose 4,6-dehydratase  52.45 
 
 
354 aa  344  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.527744  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.03 
 
 
360 aa  341  1e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1480  CDP-glucose 4,6-dehydratase  50.29 
 
 
353 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.988255 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27770  CDP-glucose 4,6-dehydratase  52.74 
 
 
358 aa  335  5.999999999999999e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0592  CDP-glucose 4,6-dehydratase  52.26 
 
 
358 aa  333  3e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0777  CDP-glucose 4,6-dehydratase  44 
 
 
358 aa  326  3e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0627  CDP-glucose 4,6-dehydratase  50.28 
 
 
366 aa  326  5e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3529  CDP-glucose 4,6-dehydratase  45.36 
 
 
362 aa  323  3e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1702  CDP-glucose 4,6-dehydratase  45.21 
 
 
362 aa  323  3e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.412551  hitchhiker  0.000000000000117345 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0061  CDP-glucose 4,6-dehydratase  48.27 
 
 
368 aa  322  6e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0769235  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4602  CDP-glucose 4,6-dehydratase  47.56 
 
 
359 aa  322  7e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0921242  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3352  CDP-glucose 4,6-dehydratase  50 
 
 
362 aa  318  7e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.45248 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3374  CDP-glucose 4,6-dehydratase  43.59 
 
 
351 aa  318  1e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3400  CDP-glucose 4,6-dehydratase  43.87 
 
 
351 aa  317  2e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2715  CDP-glucose 4,6-dehydratase  51.93 
 
 
366 aa  316  3e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.525402  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3396  CDP-glucose 4,6-dehydratase  43.87 
 
 
351 aa  316  4e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2191  CDP-glucose 4,6-dehydratase  47.72 
 
 
365 aa  315  6e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00831743  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3070  CDP-glucose 4,6-dehydratase  43.87 
 
 
351 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3062  CDP-glucose 4,6-dehydratase  47.28 
 
 
352 aa  311  9e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1909  CDP-glucose 4,6-dehydratase  48.86 
 
 
369 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3695  CDP-glucose-4,6-dehydratase, putative  49.72 
 
 
368 aa  306  3e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1257  NAD-dependent epimerase/dehydratase:polysaccharide biosynthesis protein CapD  47.32 
 
 
365 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2768  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.77 
 
 
357 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2888  CDP-glucose 4,6-dehydratase  48.72 
 
 
368 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0387  CDP-glucose 4,6-dehydratase  45.01 
 
 
367 aa  302  8.000000000000001e-81  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3401  CDP-glucose 4,6-dehydratase  42.22 
 
 
366 aa  301  9e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000773514 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0876  CDP-glucose 4,6-dehydratase  48.81 
 
 
371 aa  300  2e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2561  CDP-glucose 4,6-dehydratase  42.27 
 
 
379 aa  300  2e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4419  CDP-glucose 4,6-dehydratase  50.28 
 
 
361 aa  300  2e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.67049 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07611  CDP-glucose 4,6-dehydratase  41.05 
 
 
360 aa  299  6e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12911  CDP-glucose 4,6-dehydratase  42.78 
 
 
366 aa  298  7e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.253167  hitchhiker  0.00798919 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.13 
 
 
367 aa  296  4e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.295037  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2656  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.17 
 
 
366 aa  296  5e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01401  CDP-glucose 4,6-dehydratase  44.51 
 
 
365 aa  292  8e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1258  CDP-glucose 4,6-dehydratase  52.44 
 
 
364 aa  290  2e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0130  CDP-glucose 4,6-dehydratase  39.19 
 
 
353 aa  290  4e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.837916  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1603  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.1 
 
 
371 aa  289  6e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2783  CDP-glucose 4,6-dehydratase  42.38 
 
 
386 aa  276  5e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.824232 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3334  CDP-glucose 4,6-dehydratase  42.11 
 
 
386 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10410  CDP-glucose 4,6-dehydratase  42.09 
 
 
395 aa  265  8e-70  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1872  CDP-glucose 4,6-dehydratase  44.35 
 
 
357 aa  232  8.000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.986998  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2838  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.93 
 
 
324 aa  157  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.904735  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1896  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.63 
 
 
331 aa  157  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3176  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.03 
 
 
331 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.759181  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.03 
 
 
406 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.42 
 
 
413 aa  101  2e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.245536  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.15 
 
 
411 aa  99  1e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000639635 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3176  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.04 
 
 
329 aa  96.7  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2779  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.88 
 
 
367 aa  83.2  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4443  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.73 
 
 
336 aa  82.8  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1237  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.6 
 
 
354 aa  80.9  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2858  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.67 
 
 
417 aa  80.5  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0350628  normal  0.478432 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4288  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.73 
 
 
336 aa  80.1  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3491  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.78 
 
 
354 aa  80.5  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.370229 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1785  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.08 
 
 
366 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00820304 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.91 
 
 
345 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1380  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.49 
 
 
356 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.724349  hitchhiker  0.000724393 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4820  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.44 
 
 
342 aa  78.2  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.503744  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1298  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  23.19 
 
 
322 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895742 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4425  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.43 
 
 
336 aa  77  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1117  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  22.89 
 
 
322 aa  77  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0565824  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4022  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.22 
 
 
360 aa  77  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.535733 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2679  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.54 
 
 
332 aa  76.3  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0614199  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1063  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.09 
 
 
409 aa  76.3  0.0000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0896944  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1137  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  22.89 
 
 
322 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.58 
 
 
335 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>