More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3235 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3235  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  100 
 
 		 368 aa  734    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1654  A/G-specific adenine glycosylase  60.35 
 
 		 344 aa  393  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.342935  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0905  A/G-specific adenine glycosylase  59.59 
 
 		 384 aa  391  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1299  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  57.75 
 
 		 357 aa  382  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.360149  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0901  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  58.99 
 
 		 357 aa  382  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4339  A/G-specific adenine glycosylase  58.31 
 
 		 353 aa  382  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00948332  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0830  A/G-specific adenine glycosylase  58.99 
 
 		 357 aa  378  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.19342  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3492  A/G-specific adenine glycosylase  57.67 
 
 		 384 aa  375  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000130303 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1054  A/G-specific adenine glycosylase  58.76 
 
 		 370 aa  378  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5427  A/G-specific adenine glycosylase  59.6 
 
 		 356 aa  374  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3604  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  60.12 
 
 		 363 aa  371  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211751  hitchhiker  0.00640648 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0480  A/G-specific adenine glycosylase  56.42 
 
 		 368 aa  370  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  54.42 
 
 		 375 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  55.62 
 
 		 368 aa  362  4e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2183  A/G-specific adenine glycosylase  55.91 
 
 		 368 aa  362  4e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602702  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2797  A/G-specific adenine glycosylase  55.91 
 
 		 368 aa  362  4e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0518  A/G-specific adenine glycosylase  55.01 
 
 		 370 aa  361  1e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  55.62 
 
 		 368 aa  361  1e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0590  A/G-specific adenine glycosylase  55.81 
 
 		 353 aa  358  9e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.123434  decreased coverage  0.000793491 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  56.57 
 
 		 368 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  56.57 
 
 		 368 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  56.57 
 
 		 368 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  56.29 
 
 		 368 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  56.29 
 
 		 368 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  56.29 
 
 		 368 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  56.29 
 
 		 368 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0320  A/G-specific adenine glycosylase  53.02 
 
 		 369 aa  353  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0401  A/G-specific adenine glycosylase protein  54.08 
 
 		 362 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2715  A/G-specific adenine glycosylase  54.83 
 
 		 381 aa  324  1e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.197522 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2857  A/G-specific adenine glycosylase  54.55 
 
 		 368 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0256  A/G-specific adenine glycosylase  53.09 
 
 		 382 aa  316  5e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0283  A/G-specific adenine glycosylase  52.82 
 
 		 382 aa  316  5e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0064  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  48.12 
 
 		 345 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000461825  normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0078  A/G-specific adenine glycosylase  48.4 
 
 		 383 aa  296  6e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.99857  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0348  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  48.3 
 
 		 393 aa  293  5e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2130  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  49.85 
 
 		 344 aa  290  2e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0295  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  49.47 
 
 		 405 aa  290  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0443  A/G-specific adenine glycosylase  52.3 
 
 		 359 aa  288  8e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0522  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  48 
 
 		 353 aa  282  5.000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000130755  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0003  A/G-specific adenine glycosylase  41.98 
 
 		 353 aa  281  2e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000019513  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2945  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  48.29 
 
 		 348 aa  278  1e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3368  A/G-specific adenine glycosylase  43.22 
 
 		 365 aa  277  2e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0286  A/G-specific adenine glycosylase  47.49 
 
 		 355 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160369 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0306  A/G-specific adenine glycosylase  47.49 
 
 		 355 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04530  A/G-specific adenine glycosylase  47.38 
 
 		 362 aa  276  4e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1545  A/G-specific adenine glycosylase  45.35 
 
 		 374 aa  275  1.0000000000000001e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.151581  normal  0.696978 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.78 
 
 		 372 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000556638  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1916  A/G-specific adenine glycosylase  43.75 
 
 		 381 aa  274  2.0000000000000002e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2525  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  44.38 
 
 		 368 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4901  A/G-specific adenine glycosylase MutY  47.06 
 
 		 355 aa  273  3e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4922  A/G-specific adenine glycosylase  46.67 
 
 		 355 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208141 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1181  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.22 
 
 		 372 aa  271  1e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000011452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1141  A/G-specific adenine glycosylase  48.68 
 
 		 358 aa  271  2e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1621  A/G-specific adenine glycosylase  52.65 
 
 		 381 aa  271  2e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.865832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4259  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  48.08 
 
 		 355 aa  270  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000489397 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0311  A/G-specific adenine glycosylase  46.9 
 
 		 355 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354771  normal  0.798997 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0857  A/G-specific adenine glycosylase  45.98 
 
 		 353 aa  269  5e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1319  A/G-specific adenine glycosylase  41.43 
 
 		 382 aa  268  8e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.565336  normal  0.399065 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0755  A/G-specific adenine glycosylase  43.6 
 
 		 350 aa  268  8e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1180  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.67 
 
 		 372 aa  268  8e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000236828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00282  A/G-specific adenine glycosylase  42.73 
 
 		 355 aa  268  8.999999999999999e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.274494  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0882  adenine DNA glycosylase  41.19 
 
 		 368 aa  268  1e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5342  A/G-specific adenine glycosylase  46.47 
 
 		 355 aa  266  4e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3176  A/G-specific adenine glycosylase  44.41 
 
 		 354 aa  266  5e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3407  adenine DNA glycosylase  40.91 
 
 		 368 aa  265  7e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0148197  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3196  A/G-specific adenine glycosylase  41.08 
 
 		 363 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000131734  normal  0.644967 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3307  adenine DNA glycosylase  40.8 
 
 		 360 aa  264  2e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1325  A/G-specific adenine glycosylase  41.13 
 
 		 363 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00655288  hitchhiker  0.00812067 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3394  adenine DNA glycosylase  40.52 
 
 		 360 aa  264  2e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2490  A/G-specific adenine glycosylase  41.57 
 
 		 368 aa  264  2e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.646812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2700  A/G-specific adenine glycosylase  41.24 
 
 		 362 aa  263  3e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.469189  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3122  adenine DNA glycosylase  40.8 
 
 		 360 aa  263  3e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0937  A/G-specific adenine glycosylase  45.01 
 
 		 349 aa  263  4e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4265  adenine DNA glycosylase  41.35 
 
 		 350 aa  263  4e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2267  A/G-specific adenine glycosylase MutY  44.06 
 
 		 354 aa  262  4.999999999999999e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1003  A/G-specific adenine glycosylase  40.17 
 
 		 354 aa  262  6.999999999999999e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0662317  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02791  adenine DNA glycosylase  41.35 
 
 		 350 aa  262  8e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0610871  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0734  A/G-specific adenine glycosylase  41.35 
 
 		 350 aa  262  8e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3053  A/G-specific adenine glycosylase  41.08 
 
 		 363 aa  262  8e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000966997  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02754  hypothetical protein  41.35 
 
 		 350 aa  262  8e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0736099  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2695  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  48.9 
 
 		 361 aa  262  8e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.375064 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0753  adenine DNA glycosylase  41.35 
 
 		 350 aa  262  8e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.852915  normal  0.0133097 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1133  A/G-specific adenine DNA glycosylase  40.17 
 
 		 354 aa  261  1e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.893564  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3039  A/G-specific adenine glycosylase  41.08 
 
 		 363 aa  260  2e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000495773  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0120  A/G-specific adenine glycosylase  41.28 
 
 		 350 aa  260  3e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000558564  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01430  A/G-specific adenine glycosylase  44.26 
 
 		 357 aa  260  3e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.229953  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0076  A/G-specific adenine glycosylase  42.12 
 
 		 354 aa  259  4e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.80443  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3104  adenine DNA glycosylase  40.76 
 
 		 350 aa  259  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00400976 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1219  A/G-specific adenine glycosylase  40.33 
 
 		 370 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000411331  normal  0.458065 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0151  adenine DNA glycosylase  42.65 
 
 		 372 aa  259  5.0000000000000005e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.523345  hitchhiker  0.00000764149 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0534  A/G-specific adenine glycosylase  41.11 
 
 		 350 aa  258  8e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000506444  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0820  adenine DNA glycosylase  42.06 
 
 		 419 aa  258  8e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.746728  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5884  A/G-specific adenine glycosylase  48.67 
 
 		 355 aa  258  9e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1108  A/G-specific adenine glycosylase  43 
 
 		 354 aa  258  1e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000562379  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0819  adenine DNA glycosylase  42.06 
 
 		 371 aa  258  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4043  adenine DNA glycosylase  40.88 
 
 		 381 aa  257  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0975151 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0960  hypothetical protein  40.35 
 
 		 355 aa  257  2e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0930  hypothetical protein  40.06 
 
 		 355 aa  257  2e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0320  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  45.43 
 
 		 355 aa  257  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0253407  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3206  adenine DNA glycosylase  42.73 
 
 		 361 aa  257  2e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141745  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>