More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1661 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1661  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 137 aa  273  7e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.282422  normal  0.34807 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4798  MerR family transcriptional regulator  60.16 
 
 		 136 aa  157  5e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0237  MerR family transcriptional regulator  63.11 
 
 		 132 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2269  MerR family transcriptional regulator  53.44 
 
 		 135 aa  144  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.220473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1474  MerR family transcriptional regulator  53.49 
 
 		 135 aa  137  7e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.70041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1213  transcriptional regulator, MerR family  51.94 
 
 		 144 aa  135  3.0000000000000003e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.276419  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0094  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  49.62 
 
 		 136 aa  133  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0168  putative transcriptional regulator MerR  50 
 
 		 144 aa  133  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4341  putative transcriptional regulator MerR  50.39 
 
 		 151 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6498  putative transcriptional regulator MerR  49.61 
 
 		 144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0239269  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2341  putative transcriptional regulator MerR  49.61 
 
 		 144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0101  putative transcriptional regulator MerR  49.61 
 
 		 144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.656805  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1217  putative transcriptional regulator MerR  49.61 
 
 		 144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6171  putative transcriptional regulator MerR  49.61 
 
 		 144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000597544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6344  Hg(II) resistance regulatory protein MerR  49.61 
 
 		 162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000851109  unclonable  0.0000000537327 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15480  putative transcriptional regulator MerR  49.61 
 
 		 144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000744936  unclonable  4.377399999999999e-22 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2760  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  49.61 
 
 		 135 aa  131  3e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0083  putative transcriptional regulator MerR  49.61 
 
 		 144 aa  131  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.68539 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2129  putative transcriptional regulator MerR  49.61 
 
 		 144 aa  131  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1338  MerR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 135 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.683374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0238  MerR family transcriptional regulator  51.18 
 
 		 141 aa  130  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2323  putative transcriptional regulator MerR  48.82 
 
 		 144 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4014  MerR family transcriptional regulator  50.39 
 
 		 144 aa  130  7.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2232  putative transcriptional regulator MerR  47.01 
 
 		 144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.620327  normal  0.3464 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1339  mercuric resistance operon regulatory protein  50 
 
 		 135 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1395  MerR family transcriptional regulator  47.24 
 
 		 146 aa  125  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.686505  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1783  putative transcriptional regulator MerR  48.41 
 
 		 144 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.45958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0171  MerR family transcriptional regulator  49.19 
 
 		 134 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5990  mercury resistance regulatory protein MerR  47.29 
 
 		 132 aa  124  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.479863 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1943  transcriptional regulator of MerR family protein  41.98 
 
 		 135 aa  122  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.555422  normal  0.0105773 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0115  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  49.62 
 
 		 132 aa  120  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.889131  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1301  MerR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 135 aa  120  5e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2312  MerR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 135 aa  120  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.000000000000678056  hitchhiker  0.000026005 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0486  MerR family transcriptional regulator  47.24 
 
 		 135 aa  119  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0164  transcriptional regulator, MerR family  46.4 
 
 		 135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.768188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0159  transcriptional regulator, MerR family  46.4 
 
 		 135 aa  114  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2699  MerR family transcriptional regulator  44.03 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02955  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  42.74 
 
 		 128 aa  111  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0202543  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3492  transcriptional regulator, MerR family protein  41.09 
 
 		 135 aa  111  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4315  MerR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 130 aa  108  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0477  MerR family transcriptional regulator  44.27 
 
 		 173 aa  107  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2155  transcriptional regulator, MerR family  45.6 
 
 		 167 aa  103  6e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000155365  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2509  MerR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 151 aa  101  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.591979 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02041  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  41.23 
 
 		 116 aa  100  6e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02950  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  43.31 
 
 		 131 aa  100  7e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0289893  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  41.73 
 
 		 135 aa  99  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2198  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 135 aa  97.8  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2981  MerR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 134 aa  97.4  6e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1218  MerR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 134 aa  97.4  6e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4360  MerR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 134 aa  97.4  6e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4384  MerR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 134 aa  97.4  6e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2435  MerR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 135 aa  97.1  7e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1620  MerR family transcriptional regulator  49.47 
 
 		 110 aa  96.7  9e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.230477  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4537  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  38.46 
 
 		 132 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2399  transcriptional regulator, MerR family  41.73 
 
 		 132 aa  95.5  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000424023  normal  0.796089 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2633  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  37.98 
 
 		 162 aa  94  7e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3133  MerR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 139 aa  93.2  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.845727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 137 aa  93.2  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2352  MerR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 152 aa  92.4  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3680  transcriptional regulator, MerR family  37.98 
 
 		 133 aa  91.3  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.446637  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0211  MerR family transcriptional regulator  43.31 
 
 		 140 aa  90.5  7e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4834  transcriptional regulator, MerR family  38.93 
 
 		 144 aa  90.5  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0437  MerR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 161 aa  90.1  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01412  Transcriptional regulator MerR  37.9 
 
 		 150 aa  89.7  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.536111  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2900  MerR family transcriptional regulator  42.4 
 
 		 140 aa  89.7  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 137 aa  89  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  39.37 
 
 		 155 aa  88.6  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1097  transcriptional regulator, MerR family  40.94 
 
 		 133 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3156  MerR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 146 aa  88.6  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215145  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1790  transcriptional regulator  42.52 
 
 		 141 aa  88.6  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269282  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2152  MerR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 137 aa  88.6  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.845816  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3941  MerR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 128 aa  88.2  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.708141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3726  MerR family transcriptional regulator  41.09 
 
 		 140 aa  87.8  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4954  regulatory protein, MerR  46.73 
 
 		 143 aa  87.8  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00750643 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 136 aa  87.4  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2343  MerR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 146 aa  87  7e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0800  MerR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 142 aa  87  8e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.876996 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0137  MerR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 145 aa  87  8e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1771  transcriptional regulator, MerR family  34.09 
 
 		 151 aa  87  9e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.13408  normal  0.537849 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2024  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  36 
 
 		 130 aa  86.7  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0608  zinc-responsive transcriptional regulator  36.17 
 
 		 144 aa  86.7  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000357731  normal  0.723537 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1255  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  35.2 
 
 		 130 aa  85.9  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 150 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 142 aa  85.9  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3888  zinc-responsive transcriptional regulator  36.5 
 
 		 141 aa  85.5  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00039361  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3797  transcriptional regulator, MerR family  37.21 
 
 		 140 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 142 aa  85.9  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0310  zinc-responsive transcriptional regulator  36.5 
 
 		 141 aa  85.5  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 138 aa  85.5  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4950  regulatory protein, MerR  46.43 
 
 		 146 aa  85.9  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0034872 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3563  transcriptional regulator, MerR family  37.8 
 
 		 157 aa  84.7  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3184  transcriptional regulator, MerR family  34.62 
 
 		 142 aa  85.1  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3502  transcriptional regulator, MerR family  36.43 
 
 		 140 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.733746 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3608  zinc-responsive transcriptional regulator  35.66 
 
 		 141 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.260442 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3715  zinc-responsive transcriptional regulator  35.66 
 
 		 141 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.325937 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3778  zinc-responsive transcriptional regulator  35.66 
 
 		 141 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2325  MerR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 147 aa  84.3  6e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2256  MerR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 144 aa  84  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1328  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  33.86 
 
 		 142 aa  84  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.185828  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5562  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 139 aa  83.6  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21316  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>