More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1620 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1620  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 110 aa  227  4e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.230477  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2323  putative transcriptional regulator MerR  69.81 
 
 		 144 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0094  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  70.75 
 
 		 136 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6498  putative transcriptional regulator MerR  68.87 
 
 		 144 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0239269  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1217  putative transcriptional regulator MerR  68.87 
 
 		 144 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0101  putative transcriptional regulator MerR  68.87 
 
 		 144 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.656805  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6171  putative transcriptional regulator MerR  68.87 
 
 		 144 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000597544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6344  Hg(II) resistance regulatory protein MerR  68.87 
 
 		 162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000851109  unclonable  0.0000000537327 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2341  putative transcriptional regulator MerR  68.87 
 
 		 144 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15480  putative transcriptional regulator MerR  68.87 
 
 		 144 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000744936  unclonable  4.377399999999999e-22 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2232  putative transcriptional regulator MerR  69.81 
 
 		 144 aa  144  4.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.620327  normal  0.3464 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0083  putative transcriptional regulator MerR  67.92 
 
 		 144 aa  144  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.68539 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2129  putative transcriptional regulator MerR  67.92 
 
 		 144 aa  143  7.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1213  transcriptional regulator, MerR family  67.92 
 
 		 144 aa  142  1e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.276419  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4341  putative transcriptional regulator MerR  69.81 
 
 		 151 aa  142  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0168  putative transcriptional regulator MerR  72.92 
 
 		 144 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1783  putative transcriptional regulator MerR  72.92 
 
 		 144 aa  141  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.45958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2269  MerR family transcriptional regulator  66.32 
 
 		 135 aa  130  6e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.220473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4014  MerR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 144 aa  129  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1338  MerR family transcriptional regulator  65.62 
 
 		 135 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.683374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1474  MerR family transcriptional regulator  62.89 
 
 		 135 aa  127  8.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.70041  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1339  mercuric resistance operon regulatory protein  61.76 
 
 		 135 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1301  MerR family transcriptional regulator  60.78 
 
 		 135 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2312  MerR family transcriptional regulator  60.78 
 
 		 135 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.000000000000678056  hitchhiker  0.000026005 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4798  MerR family transcriptional regulator  62.11 
 
 		 136 aa  125  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2760  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  61.46 
 
 		 135 aa  117  4.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0486  MerR family transcriptional regulator  59.8 
 
 		 135 aa  117  7.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0238  MerR family transcriptional regulator  58.7 
 
 		 141 aa  114  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1395  MerR family transcriptional regulator  60.22 
 
 		 146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.686505  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0159  transcriptional regulator, MerR family  60 
 
 		 135 aa  107  6e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0164  transcriptional regulator, MerR family  60 
 
 		 135 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.768188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5990  mercury resistance regulatory protein MerR  51.58 
 
 		 132 aa  98.2  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.479863 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0237  MerR family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 132 aa  97.8  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1661  MerR family transcriptional regulator  49.47 
 
 		 137 aa  96.7  9e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.282422  normal  0.34807 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0115  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  50.51 
 
 		 132 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.889131  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1943  transcriptional regulator of MerR family protein  44.79 
 
 		 135 aa  85.1  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.555422  normal  0.0105773 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02950  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  44.68 
 
 		 131 aa  84.7  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0289893  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3492  transcriptional regulator, MerR family protein  43.62 
 
 		 135 aa  82  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02955  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  44.68 
 
 		 128 aa  81.3  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0202543  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01412  Transcriptional regulator MerR  42.55 
 
 		 150 aa  80.5  0.000000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.536111  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4315  MerR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 130 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 142 aa  77  0.00000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 142 aa  77  0.00000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0171  MerR family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0477  MerR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 173 aa  72.8  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2699  MerR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 171 aa  71.2  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2155  transcriptional regulator, MerR family  36.08 
 
 		 167 aa  71.6  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000155365  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2435  MerR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0060  hypothetical protein  41.3 
 
 		 134 aa  70.1  0.000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2509  MerR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 151 aa  70.1  0.000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.591979 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0059  hypothetical protein  40.22 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4950  regulatory protein, MerR  40.82 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0034872 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4117  MerR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 135 aa  68.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1623  MerR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.473197 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4954  regulatory protein, MerR  41.05 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00750643 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1123  MerR family transcriptional regulator  49.35 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4277  MerR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02041  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  41.67 
 
 		 116 aa  67.8  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2322  MerR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1129  MerR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.560457  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0608  zinc-responsive transcriptional regulator  36.17 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000357731  normal  0.723537 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2900  MerR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3797  transcriptional regulator, MerR family  36.84 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2331  MerR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2122  MerR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392854  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2572  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2198  MerR family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1678  MerR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2152  MerR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.845816  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4834  transcriptional regulator, MerR family  34.95 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0310  zinc-responsive transcriptional regulator  35.87 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3888  zinc-responsive transcriptional regulator  35.87 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00039361  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0747  MerR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0211  MerR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3410  hypothetical protein  37.5 
 
 		 142 aa  63.5  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2391  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  37.36 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0284263  normal  0.3053 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3502  transcriptional regulator, MerR family  34.74 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.733746 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2104  transcriptional regulator, MerR family  37.36 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0437  MerR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  48.44 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2024  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  46.38 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6360  transcriptional regulator, MerR family  38.46 
 
 		 152 aa  62  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1218  MerR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2300  MerR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.639917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4360  MerR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4384  MerR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2981  MerR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3788  MerR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 144 aa  62  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.318416  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2470  MerR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2686  MerR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 172 aa  62  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1255  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  44.93 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3726  MerR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1790  transcriptional regulator  40.22 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269282  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3941  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.708141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2848  MerR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5013  MerR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3680  transcriptional regulator, MerR family  42.47 
 
 		 133 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.446637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>