More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0689 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0689  transcriptional regulator  100 
 
 
297 aa  604  9.999999999999999e-173  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2904  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40 
 
 
225 aa  151  1e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4265  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.61 
 
 
251 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.130601  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2555  twin-arginine translocation pathway signal  34.29 
 
 
285 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.739799 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1313  ThiJ/PfpI domain protein  37.31 
 
 
234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0812761  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1154  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.31 
 
 
234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0937941 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5674  ThiJ/PfpI domain protein  40.31 
 
 
212 aa  130  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4460  ThiJ/PfpI domain protein  38.78 
 
 
243 aa  130  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322473  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0269  DJ-1/PfpI family protein  33.48 
 
 
232 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1611  DJ-1/PfpI family protein  33.48 
 
 
232 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4368  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.82 
 
 
276 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0232  DJ-1/PfpI family protein  33.48 
 
 
232 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1415  DJ-1/PfpI family protein  33.48 
 
 
242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0954  DJ-1/PfpI family protein  33.04 
 
 
691 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4844  ThiJ/PfpI domain protein  35.89 
 
 
242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2666  isonitrile hydratase, putative  33.48 
 
 
242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0514  DJ-1/PfpI family protein  36.65 
 
 
238 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3031  ThiJ/PfpI  35.96 
 
 
234 aa  126  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.140928  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1849  ThiJ/PfpI domain protein  35.75 
 
 
225 aa  125  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0641926  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2525  isonitrile hydratase  35.6 
 
 
242 aa  126  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1835  ThiJ/PfpI  36.65 
 
 
228 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0973  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.87 
 
 
249 aa  124  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1644  transcriptional regulator  33.51 
 
 
220 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.16 
 
 
225 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2623  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.38 
 
 
242 aa  124  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7628  intracellular protease/amidase  34.9 
 
 
261 aa  121  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.66836  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3642  ThiJ/PfpI domain protein  35.6 
 
 
224 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.667474  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2687  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.08 
 
 
227 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2887  ThiJ/PfpI  32.44 
 
 
233 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00139108  normal  0.0511878 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2047  ThiJ/PfpI  35.08 
 
 
227 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2658  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.08 
 
 
227 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152452  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2847  ThiJ/PfpI family protein  36.13 
 
 
276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00201065  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3318  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.6 
 
 
224 aa  120  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.47928  normal  0.652911 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2643  ThiJ family protein  35.4 
 
 
241 aa  119  6e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5266  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.37 
 
 
246 aa  119  7e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.55571 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6949  ThiJ/PfpI family protein  32.43 
 
 
238 aa  119  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0470534  normal  0.335343 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0742  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.79 
 
 
245 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0649323  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2109  ThiJ/PfpI domain protein  34.74 
 
 
233 aa  119  9e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0113293  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3518  ThiJ/PfpI domain protein  35.08 
 
 
226 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0748  ThiJ/PfpI  39.79 
 
 
245 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.958247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0762  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.79 
 
 
245 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.100444  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2098  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.79 
 
 
231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3890  ThiJ/PfpI domain protein  31.96 
 
 
228 aa  117  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2503  ThiJ/PfpI domain protein  39.09 
 
 
233 aa  117  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0492  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.26 
 
 
231 aa  117  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4003  ThiJ/PfpI domain protein  31.96 
 
 
228 aa  117  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448495  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2562  ThiJ/PfpI domain protein  35.26 
 
 
198 aa  116  5e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3148  ThiJ/PfpI domain protein  33.68 
 
 
229 aa  112  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2700  ThiJ/PfpI domain protein  31.84 
 
 
229 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0269047  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3391  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.42 
 
 
262 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694944  normal  0.106605 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0470  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.69 
 
 
210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0050  ThiJ/PfpI domain protein  31.39 
 
 
279 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4131  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.16 
 
 
277 aa  109  5e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3528  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.98 
 
 
198 aa  109  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  36.16 
 
 
349 aa  108  7.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1474  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.16 
 
 
232 aa  108  8.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4230  hypothetical protein  33.51 
 
 
232 aa  108  9.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2579  ThiJ/PfpI  34.95 
 
 
202 aa  108  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0031  ThiJ/PfpI  34.62 
 
 
232 aa  108  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0533722 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6612  transcriptional regulator  35.03 
 
 
341 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3882  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.61 
 
 
231 aa  107  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2886  AraC family transcriptional regulator  31.46 
 
 
322 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0162981  normal  0.0527553 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2928  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.18 
 
 
233 aa  106  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.012618  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2244  ThiJ/PfpI domain protein  37.37 
 
 
222 aa  106  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.121957  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4536  DJ-1/PfpI family protein  37.5 
 
 
261 aa  106  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  32.81 
 
 
322 aa  105  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1495  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.16 
 
 
199 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2087  ThiJ/PfpI domain protein  34.18 
 
 
199 aa  105  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0785753  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  32.11 
 
 
334 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2626  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.16 
 
 
199 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.618286  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  33.15 
 
 
324 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  32.43 
 
 
324 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  32.43 
 
 
324 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4319  AraC family transcriptional regulator  33.91 
 
 
324 aa  104  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1653  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.5 
 
 
240 aa  104  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.187677 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2759  ThiJ/PfpI domain protein  35.33 
 
 
211 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4229  transcriptional regulator  29.78 
 
 
312 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0813  hypothetical protein  32.98 
 
 
198 aa  103  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.396328  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0639  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.7 
 
 
227 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2581  AraC family transcriptional regulator  30.89 
 
 
198 aa  103  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.898766  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3530  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.98 
 
 
207 aa  103  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4315  ThiJ/PfpI domain protein  34.72 
 
 
232 aa  103  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5842  AraC family transcriptional regulator  35.83 
 
 
321 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.770334  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4181  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.29 
 
 
234 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6209  AraC family transcriptional regulator  35.83 
 
 
321 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677646 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6685  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 
321 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  0.261527 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5246  transcriptional regulator, AraC family  32.98 
 
 
331 aa  102  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.893549 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4063  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.29 
 
 
234 aa  102  8e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.72 
 
 
338 aa  101  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10051  hypothetical protein  35.33 
 
 
187 aa  101  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0468  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
357 aa  101  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2269  ThiJ/PfpI domain protein  28.27 
 
 
228 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2705  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.03 
 
 
227 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5992  AraC family transcriptional regulator  33.87 
 
 
348 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728993  normal  0.755382 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6260  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.18 
 
 
284 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2320  ThiJ/PfpI domain protein  28.27 
 
 
228 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1973  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.54 
 
 
230 aa  102  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0965747 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7236  ThiJ/PfpI family protein  30 
 
 
326 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0671264 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  33.15 
 
 
322 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2579  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.03 
 
 
227 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>