More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2757 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
409 aa  807    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  42.66 
 
 
394 aa  269  8.999999999999999e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  38.9 
 
 
407 aa  258  1e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0284  hypothetical protein  39.53 
 
 
391 aa  248  2e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0094  major facilitator transporter  37.25 
 
 
429 aa  213  4.9999999999999996e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  40.25 
 
 
408 aa  208  1e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2807  major facilitator superfamily MFS_1  40.92 
 
 
414 aa  202  8e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  29.27 
 
 
403 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0773  multidrug resistance protein, putative  30.79 
 
 
399 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  29.26 
 
 
396 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0552  major facilitator transporter  27.39 
 
 
407 aa  119  9e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.929363 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  29.71 
 
 
395 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  29.34 
 
 
406 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  27.09 
 
 
400 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0950  major facilitator family transporter  27.73 
 
 
400 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000143189  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  26.85 
 
 
400 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  27.47 
 
 
400 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  27.25 
 
 
400 aa  111  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1093  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 
406 aa  111  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0159699 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0697  quinolone resistence protein NorA  27.2 
 
 
506 aa  110  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000944811  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0684  quinolone resistence protein  27.47 
 
 
506 aa  110  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00565548  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0787  major facilitator family transporter  27.2 
 
 
399 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000257301  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0749  major facilitator family transporter  27.2 
 
 
505 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000682732  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  28.23 
 
 
410 aa  108  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  26.93 
 
 
447 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  27.7 
 
 
381 aa  107  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  26.13 
 
 
381 aa  106  9e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  25.87 
 
 
381 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  26.6 
 
 
381 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0650  major facilitator transporter  27.13 
 
 
400 aa  104  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4635  major facilitator superfamily MFS_1  28.97 
 
 
410 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.720897 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  26.77 
 
 
384 aa  104  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  25.6 
 
 
381 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  25.6 
 
 
381 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  26.6 
 
 
381 aa  103  8e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  27.54 
 
 
415 aa  103  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2034  major facilitator transporter  26.7 
 
 
386 aa  103  8e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0422  major facilitator transporter  26.32 
 
 
397 aa  103  8e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.186179  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  27.01 
 
 
381 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  27.97 
 
 
409 aa  102  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  25.13 
 
 
399 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3129  major facilitator superfamily MFS_1  26.56 
 
 
419 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2991  major facilitator superfamily MFS_1  26.68 
 
 
419 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  25.14 
 
 
399 aa  96.3  9e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3398  general substrate transporter  26.11 
 
 
411 aa  95.5  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  27.66 
 
 
435 aa  94.4  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  24.38 
 
 
387 aa  94  5e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  27.14 
 
 
395 aa  92.4  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1927  major facilitator family transporter  24.65 
 
 
399 aa  92  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.644574 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1620  major facilitator superfamily MFS_1  27.72 
 
 
419 aa  90.9  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00719862  normal  0.0630669 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3013  major facilitator transporter  24.67 
 
 
399 aa  91.3  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0363665  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  23.1 
 
 
391 aa  91.3  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3305  major facilitator family transporter  24.73 
 
 
399 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2713  major facilitator transporter  26.65 
 
 
412 aa  90.5  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.11572 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3322  major facilitator family transporter  24.38 
 
 
399 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3086  quinolone resistence protein NorA  24.38 
 
 
399 aa  90.1  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.388424  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0827  major facilitator transporter  28.01 
 
 
406 aa  90.1  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6746  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 
423 aa  90.1  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3100  major facilitator family transporter  24.38 
 
 
399 aa  90.1  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.085117  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2997  quinolone resistence protein  24.38 
 
 
399 aa  90.1  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3345  major facilitator family transporter  24.38 
 
 
399 aa  90.1  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  24.06 
 
 
406 aa  89.4  9e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  25.33 
 
 
423 aa  89.7  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3309  major facilitator family transporter  24.1 
 
 
399 aa  89  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3315  major facilitator family transporter  24.1 
 
 
399 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  26.29 
 
 
423 aa  87.8  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  26.29 
 
 
423 aa  87.8  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  26.29 
 
 
423 aa  87.8  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  26.29 
 
 
423 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  26.36 
 
 
423 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  26.37 
 
 
423 aa  86.7  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  26.87 
 
 
423 aa  86.7  8e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1902  major facilitator superfamily MFS_1  27.87 
 
 
404 aa  86.3  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1056  major facilitator transporter  27.75 
 
 
396 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0999083  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  23.42 
 
 
424 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4868  major facilitator transporter  26.32 
 
 
418 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.174951 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3525  major facilitator superfamily MFS_1  28.41 
 
 
404 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.63708  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1408  major facilitator superfamily MFS_1  23.56 
 
 
401 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4759  major facilitator transporter  26.13 
 
 
402 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.245052  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6535  major facilitator transporter  25.79 
 
 
402 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3408  major facilitator transporter  26.13 
 
 
402 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4108  major facilitator transporter  26.67 
 
 
402 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.810639 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3461  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 
405 aa  83.6  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4610  major facilitator transporter  27.02 
 
 
395 aa  84  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000316795  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  25.73 
 
 
387 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3286  major facilitator superfamily MFS_1  25.23 
 
 
395 aa  83.2  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  24.47 
 
 
424 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  25.26 
 
 
424 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3372  transporter, major facilitator family  25.57 
 
 
396 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  27.51 
 
 
440 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0805  major facilitator superfamily MFS_1  24.75 
 
 
408 aa  80.5  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.659867  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1098  major facilitator transporter  23.67 
 
 
385 aa  79.3  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4444  multidrug resistance protein  25.87 
 
 
400 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.239413 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2117  major facilitator superfamily MFS_1  26.36 
 
 
391 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000191868  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1577  major facilitator transporter  24.78 
 
 
383 aa  79  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0471047  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15980  arabinose efflux permease family protein  24.79 
 
 
402 aa  78.6  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000235485 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1324  major facilitator superfamily MFS_1  26.34 
 
 
403 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.654344  normal  0.651678 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2528  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 
417 aa  78.2  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.387633  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09090  arabinose efflux permease family protein  27.03 
 
 
434 aa  78.2  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0241408  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0848  major facilitator transporter  23.3 
 
 
383 aa  77.8  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.589458  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>