247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8315 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8315  YCII-related  100 
 
 		 140 aa  281  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11198  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2458  YCII-related  84.29 
 
 		 140 aa  248  2e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2572  DGPFAETKE family protein  74.29 
 
 		 140 aa  219  7e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.725199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3531  DGPFAETKE family protein  73.57 
 
 		 143 aa  214  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5048  DGPFAETKE family protein  72.26 
 
 		 143 aa  210  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.291625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4525  DGPFAETKE family protein  72.99 
 
 		 143 aa  210  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4212  DGPFAETKE family protein  68.57 
 
 		 144 aa  209  7e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380376 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3488  DGPFAETKE  72.54 
 
 		 145 aa  209  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1484  hypothetical protein  69.72 
 
 		 143 aa  209  1e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.786004 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3708  DGPFAETKE family protein  74.63 
 
 		 145 aa  209  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.229966  normal  0.769344 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3256  hypothetical protein  68.57 
 
 		 143 aa  206  7e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5112  DGPFAETKE family protein  68.57 
 
 		 143 aa  206  7e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5169  DGPFAETKE family protein  67.86 
 
 		 143 aa  205  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0803026 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3123  DGPFAETKE family protein  68.12 
 
 		 141 aa  202  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265819  normal  0.0263064 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1126  DGPF domain-containing protein  69.63 
 
 		 145 aa  196  6e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0193856  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0988  DGPF domain-containing protein  68.61 
 
 		 145 aa  195  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0795  hypothetical protein  67.88 
 
 		 139 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.999252  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0384  DGPF domain-containing protein  68.61 
 
 		 145 aa  195  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391971  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2452  DGPFAETKE family protein  67.88 
 
 		 139 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0408545 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1835  DGPF domain-containing protein  68.61 
 
 		 145 aa  195  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.565065  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1339  DGPF domain-containing protein  68.61 
 
 		 145 aa  195  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.071027  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0256  DGPF domain-containing protein  68.61 
 
 		 243 aa  194  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162797  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0310  DGPF domain-containing protein  68.61 
 
 		 246 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.471649  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1750  DGPF domain-containing protein  67.88 
 
 		 145 aa  193  7e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.605944  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0528  hypothetical protein  67.67 
 
 		 143 aa  190  7e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252797  normal  0.454149 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2519  DGPFAETKE  62.04 
 
 		 141 aa  189  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.278396  normal  0.095455 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4029  hypothetical protein  71.77 
 
 		 141 aa  187  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46770  hypothetical protein  71.77 
 
 		 141 aa  187  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0208952  decreased coverage  0.000000131045 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2831  DGPFAETKE family protein  65 
 
 		 138 aa  183  8e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.618861  normal  0.707195 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1584  DGPFAETKE  59.57 
 
 		 143 aa  178  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8414  YCII-related  67.19 
 
 		 144 aa  177  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1320  DGPFAETKE family protein  71.07 
 
 		 122 aa  177  4.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.746126  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1458  YCII-related  64.93 
 
 		 142 aa  176  7e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0694  hypothetical protein  59.42 
 
 		 279 aa  167  5e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0969715  unclonable  0.00000000507336 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3321  histidine kinase  57.86 
 
 		 284 aa  159  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5551  YCII-related protein  52.9 
 
 		 145 aa  154  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.622924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0410  DGPFAETKE family protein  54.68 
 
 		 137 aa  154  6e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00435378  normal  0.146566 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3654  YCII-related protein  57.04 
 
 		 141 aa  152  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.046895  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1702  YCII-related protein  47.89 
 
 		 146 aa  147  5e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3588  DGPFAETKE family protein  54.68 
 
 		 147 aa  147  6e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6196  YCII-related protein  55.71 
 
 		 140 aa  146  7e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3500  DGPFAETKE  53.96 
 
 		 147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.161886  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3657  YCII-related  54.74 
 
 		 147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8235  YCII-related protein  48.18 
 
 		 139 aa  135  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6889  putative glutathione S-transferase  50.75 
 
 		 391 aa  133  9e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0839725  normal  0.0391413 
 
 
-
 
NC_003296  RS03730  hypothetical protein  54.4 
 
 		 143 aa  129  9e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.988914  normal  0.724741 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4025  hypothetical protein  50 
 
 		 149 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0232  hypothetical protein  50 
 
 		 137 aa  128  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5462  YCII-related protein  45.65 
 
 		 146 aa  125  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.330293 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19760  hypothetical protein  46.81 
 
 		 145 aa  125  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.113314  hitchhiker  0.00158371 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7113  DGPFAETKE family protein  47.18 
 
 		 137 aa  122  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4927  DGPFAETKE family protein  46.81 
 
 		 140 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0785882 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2634  DGPF domain-containing protein  45.99 
 
 		 137 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.821675  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0929  DGPF domain-containing protein  49.17 
 
 		 137 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0534  DGPF domain-containing protein  49.6 
 
 		 137 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.362719  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3712  DGPFAETKE family protein  45.07 
 
 		 139 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4551  hypothetical protein  45.07 
 
 		 139 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.626002  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3812  DGPFAETKE family protein  45.07 
 
 		 139 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2496  DGPF domain-containing protein  49.17 
 
 		 137 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0021  hypothetical protein  49.14 
 
 		 137 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.512817 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0261  hypothetical protein  48.33 
 
 		 137 aa  117  6e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1442  DGPF domain-containing protein  48.33 
 
 		 137 aa  117  6e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1639  DGPF domain-containing protein  48.33 
 
 		 137 aa  117  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0294  DGPF domain-containing protein  48.33 
 
 		 137 aa  117  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.360873  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2284  hypothetical protein  44.37 
 
 		 139 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2421  DGPFAETKE domain-containing protein  47.58 
 
 		 145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5538  DGPFAETKE family protein  44.37 
 
 		 140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3713  DGPFAETKE family protein  44.37 
 
 		 140 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.794137  normal  0.315323 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3924  hypothetical protein  45.97 
 
 		 141 aa  114  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.762923  normal  0.122571 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4361  DGPFAETKE family protein  50 
 
 		 137 aa  111  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4099  DGPFAETKE family protein  45.83 
 
 		 137 aa  110  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4155  hypothetical protein  46.56 
 
 		 139 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0734985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1303  DGPFAETKE family protein  43.85 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2197  DGPFAETKE domain-containing protein  45.45 
 
 		 138 aa  103  9e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.936751  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0349  YCII-related protein  46.61 
 
 		 136 aa  103  9e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0677816 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1804  DGPF protein  44.63 
 
 		 136 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2972  hypothetical protein  38.57 
 
 		 140 aa  97.4  5e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0580  DGPFAETKE family protein  42.37 
 
 		 261 aa  97.1  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5826  hypothetical protein  42.61 
 
 		 139 aa  96.3  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924088  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2136  YCII-related protein  42.5 
 
 		 139 aa  95.5  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3518  hypothetical protein  39.17 
 
 		 139 aa  90.9  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.382158  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2841  YCII-related protein  39.32 
 
 		 135 aa  90.5  7e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.903735  decreased coverage  0.00264181 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6888  hypothetical protein  47.47 
 
 		 138 aa  90.5  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.0297541 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0199  DGPFAETKE domain-containing protein  40.32 
 
 		 138 aa  89.7  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.301875 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18250  hypothetical protein  39.17 
 
 		 139 aa  89.7  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3642  DGPFAETKE family protein  42.48 
 
 		 154 aa  89.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1459  YCII-related  37.41 
 
 		 139 aa  88.6  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4076  YCII-related protein  39.17 
 
 		 138 aa  86.3  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0077  YCII-related  33.33 
 
 		 142 aa  83.6  8e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.35045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0741  DGPFAETKE domain-containing protein  42.86 
 
 		 168 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0755  DGPFAETKE family protein  42.86 
 
 		 168 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.19239 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0735  DGPFAETKE family protein  42.86 
 
 		 168 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208807  normal  0.29504 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3319  YCII-related  38.89 
 
 		 251 aa  80.9  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2144  YCII-related protein  38.26 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3416  YCII-related protein  38.46 
 
 		 119 aa  75.9  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162675  hitchhiker  0.00509587 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3536  YCII-related protein  35.78 
 
 		 112 aa  73.2  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4396  hypothetical protein  44.57 
 
 		 116 aa  72.4  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0759442  normal  0.0566576 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3850  DGPFAETKE family protein  39.47 
 
 		 114 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2314  DGPFAETKE family protein  41.86 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4062  DGPFAETKE family protein  38.6 
 
 		 114 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>