48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5017 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5017  homocysteine S-methyltransferase  100 
 
 		 312 aa  639    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0089  homocysteine S-methyltransferase  62.5 
 
 		 312 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.898737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0597  homocysteine S-methyltransferase  57.37 
 
 		 322 aa  359  4e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0984  homocysteine S-methyltransferase  56.73 
 
 		 315 aa  358  8e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2696  homocysteine S-methyltransferase  53.85 
 
 		 328 aa  351  8e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274652 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0064  homocysteine S-methyltransferase  54.02 
 
 		 328 aa  350  1e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0417  homocysteine S-methyltransferase  53.99 
 
 		 314 aa  342  5e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0769316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0624  homocysteine S-methyltransferase  55.13 
 
 		 312 aa  334  1e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.537919  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1107  homocysteine S-methyltransferase  51.6 
 
 		 313 aa  323  3e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0120891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3671  homocysteine S-methyltransferase  50.64 
 
 		 316 aa  313  1.9999999999999998e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2467  homocysteine S-methyltransferase  49.35 
 
 		 330 aa  288  1e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6335  homocysteine S-methyltransferase  47.3 
 
 		 307 aa  266  4e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.228765 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0740  homocysteine S-methyltransferase  46.9 
 
 		 311 aa  257  2e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1304  homocysteine S-methyltransferase  42.66 
 
 		 311 aa  226  4e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.652458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1943  putative homocysteine/selenocysteine methylase  35.27 
 
 		 319 aa  182  6e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3324  homocysteine S-methyltransferase  35.84 
 
 		 319 aa  159  7e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1327  homocysteine S-methyltransferase domain-containing protein  34.68 
 
 		 318 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5337  homocysteine S-methyltransferase  33.66 
 
 		 319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1146  homocysteine methyltransferase  27.43 
 
 		 319 aa  57  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000617566 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2547  methionine synthase I  29.17 
 
 		 340 aa  54.7  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.946299 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2926  homocysteine methyltransferase  27.56 
 
 		 313 aa  50.4  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0073  homocysteine S-methyltransferase  22.13 
 
 		 290 aa  50.4  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4837  homocysteine S-methyltransferase  33.73 
 
 		 309 aa  49.7  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.345042 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0324  homocysteine S-methyltransferase  22.05 
 
 		 413 aa  49.7  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0645  methionine synthase (B12-dependent)  21.59 
 
 		 804 aa  48.5  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.474097  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3471  homocysteine methyltransferase  26.89 
 
 		 312 aa  48.5  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4282  homocysteine S-methyltransferase  30.18 
 
 		 309 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0828  homocysteine methyltransferase  29.05 
 
 		 311 aa  47.4  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1535  homocysteine methyltransferase  26.79 
 
 		 315 aa  47.8  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.521433  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1315  homocysteine S-methyltransferase  28.02 
 
 		 288 aa  47.8  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0420975  normal  0.31637 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0682  homocysteine S-methyltransferase  25.1 
 
 		 793 aa  47  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3081  homocysteine S-methyltransferase  22.27 
 
 		 791 aa  47  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0866  homocysteine methyltransferase  27.72 
 
 		 316 aa  46.6  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.142005  normal  0.135969 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0708  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  25.17 
 
 		 616 aa  46.6  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0266464  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2815  homocysteine S-methyltransferase  25.13 
 
 		 304 aa  46.2  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2921  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  28.72 
 
 		 804 aa  45.4  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37350  homocysteine methyltransferase  25.85 
 
 		 295 aa  44.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.493269 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0141  homocysteine S-methyltransferase  27.37 
 
 		 816 aa  43.1  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000403798  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2722  methionine synthase I (cobalamin-dependent) methyltransferase subunit  24.68 
 
 		 801 aa  43.5  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0283  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  26.9 
 
 		 615 aa  43.1  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3426  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  25.28 
 
 		 617 aa  43.1  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.41819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1211  homocysteine S-methyltransferase  22.22 
 
 		 807 aa  42.7  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3090  homocysteine S-methyltransferase  29.63 
 
 		 300 aa  42.7  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1442  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  24.9 
 
 		 839 aa  42.7  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.955782  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1947  methionine synthase  23.23 
 
 		 1223 aa  42.7  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0537124  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1277  homocysteine S-methyltransferase  29.48 
 
 		 300 aa  42.4  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0441893 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3100  homocysteine S-methyltransferase  29.63 
 
 		 300 aa  42.4  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3243  homocysteine S-methyltransferase  29.63 
 
 		 300 aa  42.4  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.562987  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>