More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4430 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_4430  peptidase M22 glycoprotease  100 
 
 
232 aa  444  1e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0939599  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3393  peptidase M22 glycoprotease  93.1 
 
 
231 aa  345  3e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.265135 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3199  peptidase M22 glycoprotease  69.4 
 
 
226 aa  272  4e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.150243  normal  0.772653 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3395  peptidase M22 glycoprotease  70.26 
 
 
226 aa  269  3e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3523  peptidase M22 glycoprotease  69.83 
 
 
226 aa  264  8e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.256611  normal  0.0963127 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0643  peptidase M22 glycoprotease  63.95 
 
 
224 aa  231  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.732049 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1052  peptidase M22 glycoprotease  52.61 
 
 
259 aa  215  4e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.310661  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2899  peptidase M22 glycoprotease  54.15 
 
 
234 aa  209  4e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.328536 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0246  peptidase M22, glycoprotease  50.66 
 
 
231 aa  192  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0011  peptidase M22, glycoprotease  49.14 
 
 
232 aa  190  1e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.202985 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0018  peptidase M22, glycoprotease  50.22 
 
 
232 aa  185  7e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0268782  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1822  peptidase M22 glycoprotease  49.14 
 
 
227 aa  183  2e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309714  normal  0.168766 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0464  peptidase M22, glycoprotease  49.78 
 
 
231 aa  178  7e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.819984  normal  0.799621 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0586  peptidase M22, glycoprotease  49.34 
 
 
230 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0042  putative glycoprotease family protein  47.98 
 
 
233 aa  165  6e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5048  normal  0.440262 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0456  peptidase M22 glycoprotease  47.32 
 
 
231 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0023  peptidase M22 glycoprotease  40.52 
 
 
220 aa  146  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.579068 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0035  peptidase M22 glycoprotease  38.79 
 
 
220 aa  135  7e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2063  putative protease  37.45 
 
 
261 aa  120  2e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.273267  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2150  protease, putative  37.45 
 
 
261 aa  120  2e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0432  hypothetical protein  37.66 
 
 
229 aa  119  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0331052  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0761  peptidase M22 glycoprotease  36.75 
 
 
229 aa  119  4e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.731351  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3916  peptidase M22, glycoprotease  37.05 
 
 
225 aa  110  2e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0037  peptidase M22 glycoprotease  37.95 
 
 
218 aa  106  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  1.50711e-06 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1241  glycoprotease family protein  32.37 
 
 
235 aa  101  9e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3092  peptidase M22, glycoprotease  34.84 
 
 
215 aa  99.8  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3613  peptidase M22 glycoprotease  42.11 
 
 
230 aa  97.8  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0015  peptidase M22 glycoprotease  37.44 
 
 
213 aa  97.4  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00456768  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3029  peptidase M22, glycoprotease  33.77 
 
 
213 aa  87.4  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2377  peptidase M22, glycoprotease  34.22 
 
 
231 aa  84.3  2e-15  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1747  glycoprotein endopeptidase  36.11 
 
 
228 aa  83.2  3e-15  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.3762  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1294  peptidase M22 glycoprotease  34.55 
 
 
233 aa  82  6e-15  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.450316  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1857  peptidase M22 glycoprotease  30.83 
 
 
227 aa  82  8e-15  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00567012  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2887  peptidase M22, glycoprotease  31.43 
 
 
235 aa  80.1  2e-14  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00054006  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01132  peptidase M22, glycoprotease  30.6 
 
 
236 aa  80.9  2e-14  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1868  metal-dependent protease-like protein  30.71 
 
 
238 aa  79.7  3e-14  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.01917  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0994  peptidase M22 glycoprotease  32.2 
 
 
237 aa  79.7  4e-14  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29230  putative molecular chaperone, inactive metal-dependent protease like protein  38.74 
 
 
224 aa  79.3  5e-14  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2016  family M22 nonpeptidase-like protein  35.11 
 
 
232 aa  79.3  5e-14  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0164135  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2405  family M22 nonpeptidase-like protein  35.11 
 
 
232 aa  79.3  5e-14  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000205018  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2127  peptidase M22 glycoprotease  35.11 
 
 
232 aa  79.3  5e-14  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2229  peptidase M22 glycoprotease  35.77 
 
 
233 aa  79.3  5e-14  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1934  peptidase M22 glycoprotease  35.88 
 
 
233 aa  79  5e-14  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.762827  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2762  peptidase M22 glycoprotease  32.37 
 
 
233 aa  78.6  8e-14  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00215046  hitchhiker  0.00129003 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1759  hypothetical protein  31.01 
 
 
230 aa  78.2  9e-14  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.607918  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1991  peptidase M22 glycoprotease  36.5 
 
 
233 aa  78.6  9e-14  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.931611  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004094  peptidase M22  34.97 
 
 
233 aa  78.6  9e-14  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0629  peptidase M22 glycoprotease  32.64 
 
 
229 aa  78.2  1e-13  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.147334  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2021  putative M22 peptidase-like protein YeaZ  33.33 
 
 
231 aa  77  2e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839853  normal  0.532705 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2012  peptidase M22 glycoprotease  34.31 
 
 
233 aa  77.4  2e-13  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1775  peptidase M22, glycoprotease  26.12 
 
 
236 aa  77.4  2e-13  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0438332  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1960  putative M22 peptidase homolog YeaZ  33.33 
 
 
231 aa  77  2e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.608794  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3663  peptidase M22, glycoprotease  33.19 
 
 
212 aa  77  2e-13  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2604  hypothetical protein  36.44 
 
 
231 aa  77  2e-13  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0356  hypothetical protein  33.57 
 
 
228 aa  77  2e-13  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0444593 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2123  peptidase M22, glycoprotease  34 
 
 
223 aa  77  3e-13  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2233  peptidase  31.33 
 
 
235 aa  76.3  4e-13  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000143948  hitchhiker  2.68833e-06 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3763  peptidase M22, glycoprotease  37.36 
 
 
232 aa  75.9  5e-13  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2015  peptidase M22, glycoprotease  36.6 
 
 
238 aa  75.9  5e-13  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.186434  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1496  glycoprotease family protein  33.33 
 
 
231 aa  75.9  5e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1964  glycoprotease family protein  33.33 
 
 
231 aa  75.9  5e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1311  glycoprotease family protein  33.33 
 
 
231 aa  75.9  5e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0611537  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2453  peptidase M22 glycoprotease  32.19 
 
 
238 aa  75.5  6e-13  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2528  hypothetical protein  29.86 
 
 
239 aa  75.1  8e-13  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.721153  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2067  glycoprotease family protein  30.54 
 
 
231 aa  75.1  1e-12  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2033  glycoprotease family protein  30.54 
 
 
231 aa  74.3  1e-12  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1728  peptidase M22, glycoprotease  32.62 
 
 
233 aa  74.7  1e-12  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01765  hypothetical protein  30.54 
 
 
231 aa  74.7  1e-12  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.821026  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3849  peptidase M22 glycoprotease  29.87 
 
 
231 aa  74.7  1e-12  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.434015  normal  0.803149 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01777  predicted peptidase  30.54 
 
 
231 aa  74.7  1e-12  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0379  metal-dependent protease-like protein, putative molecular chaperone  26.8 
 
 
241 aa  74.3  2e-12  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.457617  hitchhiker  3.59774e-07 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0675  peptidase M22 glycoprotease  35.68 
 
 
241 aa  74.3  2e-12  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.892215  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1381  glycoprotease family protein  34.06 
 
 
231 aa  74.3  2e-12  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132461  normal  0.678308 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1826  peptidase M22 glycoprotease  34.06 
 
 
231 aa  73.9  2e-12  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.876091  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1000  peptidase M22 glycoprotease  35.98 
 
 
218 aa  74.3  2e-12  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960848  normal  0.156746 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1895  glycoprotease family protein  34.06 
 
 
231 aa  73.9  2e-12  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01960  O-sialoglycoprotein endopeptidase  30.5 
 
 
239 aa  73.9  2e-12  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.717624  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1836  peptidase M22 glycoprotease  34.06 
 
 
231 aa  73.9  2e-12  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  2.8735e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1725  glycoprotease  36.69 
 
 
229 aa  74.3  2e-12  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.803312 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2534  glycoprotease family protein  30.13 
 
 
231 aa  73.9  2e-12  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.219727  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1546  peptidase M22 glycoprotease  34.27 
 
 
230 aa  73.2  3e-12  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.311826 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1663  hypothetical protein  26.88 
 
 
220 aa  73.2  3e-12  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0944  peptidase M22 glycoprotease  34.42 
 
 
225 aa  73.2  3e-12  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1885  hypothetical protein  34.09 
 
 
223 aa  73.2  3e-12  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2516  hypothetical protein  34.31 
 
 
222 aa  73.6  3e-12  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2146  peptidase M22 glycoprotease  34.31 
 
 
222 aa  73.6  3e-12  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.472287  hitchhiker  0.00199457 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0341  peptidase M22, glycoprotease  31.65 
 
 
241 aa  73.2  3e-12  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2193  peptidase M22, glycoprotease  31.32 
 
 
247 aa  72.8  4e-12  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00327839 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2301  peptidase M22, glycoprotease  30.05 
 
 
237 aa  72.8  4e-12  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110817  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01100  putative glycoprotease family exported protein  25.43 
 
 
222 aa  72.4  5e-12  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01375  hypothetical protein  31.82 
 
 
233 aa  72.4  5e-12  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0400  peptidase M22 glycoprotease  34.65 
 
 
236 aa  72.4  6e-12  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0240362 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2159  peptidase M22, glycoprotease  34.35 
 
 
228 aa  72  7e-12  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000287799 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4457  peptidase M22 glycoprotease  35.68 
 
 
212 aa  72  8e-12  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0347  peptidase M22 glycoprotease  32.58 
 
 
241 aa  72  8e-12  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.425571  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0290  hypothetical protein  32.06 
 
 
230 aa  72  8e-12  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1896  hypothetical protein  33.33 
 
 
223 aa  71.2  1e-11  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0259  hypothetical protein  32.06 
 
 
230 aa  71.6  1e-11  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0245  hypothetical protein  32.06 
 
 
230 aa  71.6  1e-11  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5034  hypothetical protein  32.06 
 
 
230 aa  71.2  1e-11  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.674425  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>