228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2033 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2033  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  326  7e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4311  putative nucleotide-binding protein  57.76 
 
 
160 aa  187  6e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.57751  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03091  putative nucleotide-binding protein  54.66 
 
 
172 aa  181  4e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2524  putative nucleotide-binding protein  56.1 
 
 
161 aa  180  6e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.983821  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1036  putative nucleotide-binding protein  55.83 
 
 
163 aa  179  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.448426  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1902  putative nucleotide-binding protein  59.26 
 
 
161 aa  178  3e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3275  putative nucleotide-binding protein  55.21 
 
 
163 aa  177  5e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0533  putative nucleotide-binding protein  56.52 
 
 
160 aa  176  9e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1196  putative nucleotide-binding protein  56.52 
 
 
160 aa  176  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.699154  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0348  putative nucleotide-binding protein  54.6 
 
 
163 aa  174  5e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00378  hypothetical protein  54.6 
 
 
163 aa  174  5e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0510  putative nucleotide-binding protein  54.6 
 
 
163 aa  174  5e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.781965  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00374  nucleotide-binding protein  54.6 
 
 
163 aa  174  5e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0462  putative nucleotide-binding protein  54.6 
 
 
163 aa  174  5e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3183  protein of unknown function DUF520  54.6 
 
 
163 aa  174  5e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.387868  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0498  putative nucleotide-binding protein  54.6 
 
 
163 aa  174  5e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0458  putative nucleotide-binding protein  54.6 
 
 
163 aa  174  5e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3207  putative nucleotide-binding protein  54.6 
 
 
163 aa  174  5e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  5.36011e-05 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1098  putative nucleotide-binding protein  55.28 
 
 
160 aa  174  6e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.157658  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2888  putative nucleotide-binding protein  54.6 
 
 
163 aa  173  8e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13410  putative nucleotide-binding protein  55.9 
 
 
159 aa  173  9e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04099  nucleotide-binding protein  53.42 
 
 
160 aa  173  9e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2585  putative nucleotide-binding protein  54.66 
 
 
160 aa  172  1e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0358565  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3079  putative nucleotide-binding protein  54.6 
 
 
163 aa  172  1e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.421568  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4966  putative nucleotide-binding protein  57.14 
 
 
159 aa  171  3e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57130  putative nucleotide-binding protein  57.14 
 
 
159 aa  171  3e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1084  putative nucleotide-binding protein  53.99 
 
 
163 aa  171  4e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.235952  hitchhiker  3.04548e-06 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0893  putative nucleotide-binding protein  54.6 
 
 
163 aa  171  4e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2254  putative nucleotide-binding protein  56.79 
 
 
160 aa  171  5e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  9.45037e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3487  putative nucleotide-binding protein  53.42 
 
 
160 aa  170  9e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.660179  normal  0.50409 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0203  putative nucleotide-binding protein  53.42 
 
 
160 aa  170  9e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1993  putative nucleotide-binding protein  53.42 
 
 
160 aa  170  9e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0973999  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3104  putative nucleotide-binding protein  53.37 
 
 
163 aa  169  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3247  putative nucleotide-binding protein  53.37 
 
 
163 aa  169  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3067  putative nucleotide-binding protein  53.37 
 
 
163 aa  169  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0977  hypothetical protein  55.21 
 
 
161 aa  167  4e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1091  protein of unknown function DUF520  55.21 
 
 
161 aa  167  4e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2557  putative nucleotide-binding protein  53.09 
 
 
161 aa  167  4e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.317915 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2261  putative nucleotide-binding protein  50.93 
 
 
160 aa  167  5e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.299234  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0537  putative nucleotide-binding protein  54.88 
 
 
163 aa  167  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.323651  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4497  putative nucleotide-binding protein  56.79 
 
 
161 aa  167  7e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253922  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1352  putative nucleotide-binding protein  57.41 
 
 
161 aa  166  9e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.154119  normal  0.12708 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4372  putative nucleotide-binding protein  57.41 
 
 
161 aa  166  9e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0514431 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0482  putative nucleotide-binding protein  54.88 
 
 
163 aa  166  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.101201 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0474  putative nucleotide-binding protein  54.88 
 
 
163 aa  166  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0476  putative nucleotide-binding protein  54.88 
 
 
163 aa  166  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0495  putative nucleotide-binding protein  54.88 
 
 
163 aa  166  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0959  putative nucleotide-binding protein  54.94 
 
 
161 aa  164  4e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1115  putative nucleotide-binding protein  52.17 
 
 
160 aa  164  5e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0782  putative nucleotide-binding protein  53.7 
 
 
161 aa  164  5e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0499744  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0811  putative nucleotide-binding protein  53.7 
 
 
161 aa  163  9e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3156  putative nucleotide-binding protein  53.7 
 
 
161 aa  163  9e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0939  putative nucleotide-binding protein  53.42 
 
 
159 aa  162  1e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.911761  normal  0.507719 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003420  protein yajQ  52.15 
 
 
160 aa  162  2e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.424393  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1728  putative nucleotide-binding protein  50.93 
 
 
160 aa  162  2e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.499513  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02358  putative nucleotide-binding protein  49.69 
 
 
160 aa  161  4e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3815  putative nucleotide-binding protein  53.09 
 
 
161 aa  160  7e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4087  putative nucleotide-binding protein  55.28 
 
 
159 aa  160  7e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.568883  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0688  putative nucleotide-binding protein  49.69 
 
 
163 aa  159  2e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.067831  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0818  putative nucleotide-binding protein  51.85 
 
 
161 aa  159  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3114  putative nucleotide-binding protein  54.32 
 
 
161 aa  158  3e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.941773  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3769  putative nucleotide-binding protein  51.85 
 
 
161 aa  157  8e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4393  hypothetical protein  53.42 
 
 
159 aa  157  9e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3532  putative nucleotide-binding protein  53.09 
 
 
161 aa  155  3e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  7.07458e-05 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3601  putative nucleotide-binding protein  53.09 
 
 
161 aa  155  3e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4421  putative nucleotide-binding protein  53.09 
 
 
161 aa  155  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.425503  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0710  putative nucleotide-binding protein  53.09 
 
 
161 aa  155  3e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3724  putative nucleotide-binding protein  53.09 
 
 
161 aa  155  3e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2893  putative nucleotide-binding protein  50 
 
 
161 aa  154  5e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000719059  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1469  protein of unknown function DUF520  51.55 
 
 
164 aa  154  6e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0438378  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3443  putative nucleotide-binding protein  51.85 
 
 
161 aa  153  9e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  2.33798e-08  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03430  hypothetical protein  48.75 
 
 
163 aa  152  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.405869  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1846  putative nucleotide-binding protein  50.92 
 
 
161 aa  152  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1670  putative nucleotide-binding protein  51.53 
 
 
161 aa  152  3e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.502764  normal  0.473324 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1854  putative nucleotide-binding protein  51.23 
 
 
161 aa  152  3e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0379  protein of unknown function DUF520  48.19 
 
 
164 aa  150  5e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0120708  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4781  putative nucleotide-binding protein  51.53 
 
 
161 aa  150  6e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0520927  normal  0.263782 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3646  putative nucleotide-binding protein  51.85 
 
 
161 aa  150  7e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.507653  normal  0.0694826 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2826  putative nucleotide-binding protein  51.23 
 
 
161 aa  149  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.931729 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1927  putative nucleotide-binding protein  49.38 
 
 
166 aa  149  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0682804  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2420  putative nucleotide-binding protein  51.23 
 
 
161 aa  148  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2692  putative nucleotide-binding protein  49.38 
 
 
161 aa  147  6e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3039  hypothetical protein  49.69 
 
 
162 aa  147  8e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2603  putative nucleotide-binding protein  50 
 
 
161 aa  147  9e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2474  putative nucleotide-binding protein  50 
 
 
161 aa  146  1e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0278079 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2549  putative nucleotide-binding protein  50 
 
 
161 aa  146  1e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1044  putative nucleotide-binding protein  49.08 
 
 
161 aa  145  2e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3204  putative nucleotide-binding protein  47.85 
 
 
161 aa  145  2e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0477  putative nucleotide-binding protein  47.5 
 
 
164 aa  145  2e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.132383 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2750  putative nucleotide-binding protein  50 
 
 
161 aa  145  2e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.821102  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0770  putative nucleotide-binding protein  49.69 
 
 
161 aa  145  3e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  2.79998e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2240  putative nucleotide-binding protein  50 
 
 
161 aa  144  4e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.065474  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0959  hypothetical protein  47.88 
 
 
164 aa  144  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486251  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0730  putative nucleotide-binding protein  48.77 
 
 
161 aa  144  6e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1242  hypothetical protein  50.31 
 
 
168 aa  143  8e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.1131 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0318  protein of unknown function DUF520  46.63 
 
 
161 aa  143  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5887  putative nucleotide-binding protein  49.38 
 
 
161 aa  143  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0409  putative nucleotide-binding protein  46.25 
 
 
164 aa  143  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.67309 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0673  putative nucleotide-binding protein  48.15 
 
 
161 aa  143  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1175  putative nucleotide-binding protein  44.44 
 
 
161 aa  143  1e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>