More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3725 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3725  ribosome-binding factor A  100 
 
 		 123 aa  253  6e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0909  ribosome-binding factor A  43.9 
 
 		 121 aa  99  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1956  ribosome-binding factor A  43.44 
 
 		 120 aa  96.7  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3675  ribosome-binding factor A  42.98 
 
 		 125 aa  96.7  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1436  ribosome-binding factor A  43.59 
 
 		 118 aa  95.5  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.349731  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1557  ribosome-binding factor A  42.74 
 
 		 119 aa  94.4  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000452845  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2049  ribosome-binding factor A  39.84 
 
 		 127 aa  93.6  8e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3909  ribosome-binding factor A  42.73 
 
 		 118 aa  92  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.391027  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3633  ribosome-binding factor A  42.73 
 
 		 118 aa  92  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0539851  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1335  ribosome-binding factor A  42.73 
 
 		 118 aa  92  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0231832  hitchhiker  0.00144693 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3187  ribosome-binding factor A  42.11 
 
 		 119 aa  91.3  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.11601  normal  0.332882 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1157  ribosome-binding factor A  40.37 
 
 		 126 aa  90.9  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000826248  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1589  ribosome-binding factor A  42.5 
 
 		 118 aa  90.5  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00426148  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3073  ribosome-binding factor A  44.95 
 
 		 131 aa  90.1  8e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.729556  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3849  ribosome-binding factor A  41.82 
 
 		 118 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2463  ribosome-binding factor A  41.82 
 
 		 118 aa  89.7  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0350107  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3858  ribosome-binding factor A  41.82 
 
 		 118 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2818  ribosome-binding factor A  42.34 
 
 		 145 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.259467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1644  ribosome-binding factor A  36.44 
 
 		 119 aa  89.7  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3662  ribosome-binding factor A  41.82 
 
 		 118 aa  89  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118279  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3552  ribosome-binding factor A  41.82 
 
 		 118 aa  89.4  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3570  ribosome-binding factor A  41.82 
 
 		 118 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2922  ribosome-binding factor A  42.48 
 
 		 145 aa  89  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0301917  normal  0.0601013 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3948  ribosome-binding factor A  41.82 
 
 		 118 aa  89  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3726  ribosome-binding factor A  42.06 
 
 		 142 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.879451  normal  0.0692072 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3822  ribosome-binding factor A  41.82 
 
 		 118 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.3299500000000005e-63 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2696  ribosome-binding factor A  42.48 
 
 		 145 aa  89  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.674256 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0990  ribosome-binding factor A  40.19 
 
 		 123 aa  89  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.645083  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2819  ribosome-binding factor A  37.5 
 
 		 123 aa  88.6  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2688  ribosome-binding factor A  37.5 
 
 		 123 aa  88.6  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3329  ribosome-binding factor A  45.28 
 
 		 156 aa  88.2  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.414674  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1028  ribosome-binding factor A  44.55 
 
 		 129 aa  87.4  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0189385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0341  ribosome-binding factor A  40.8 
 
 		 134 aa  87.4  6e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2350  ribosome-binding factor A  42.06 
 
 		 140 aa  87  7e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.840269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1004  ribosome-binding factor A  42.99 
 
 		 129 aa  87  8e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.439697  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1329  ribosome-binding factor A  45.28 
 
 		 156 aa  85.5  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402989 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1587  ribosome-binding factor A  43.64 
 
 		 118 aa  85.1  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00540002  normal  0.129345 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1947  ribosome-binding factor A  41.67 
 
 		 130 aa  84.3  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0382472 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2610  ribosome-binding factor A  40.54 
 
 		 139 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.191354 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0481  ribosome-binding factor A  40.16 
 
 		 137 aa  84  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.214856  normal  0.376721 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1939  ribosome-binding factor A  37.17 
 
 		 116 aa  84  6e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1657  ribosome-binding factor A  37.17 
 
 		 116 aa  84  6e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3189  ribosome-binding factor A  44.44 
 
 		 162 aa  83.6  8e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0454193  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0439  ribosome-binding factor A  43.52 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0458  ribosome-binding factor A  39.09 
 
 		 117 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4619  ribosome-binding factor A  40 
 
 		 135 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.302767  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1304  ribosome-binding factor A  36.59 
 
 		 119 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0293197  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2118  Ribosome-binding factor A-like protein  42.45 
 
 		 160 aa  82  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.376562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0025  ribosome-binding factor A  39.34 
 
 		 146 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3543  ribosome-binding factor A  40.54 
 
 		 133 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2707  ribosome-binding factor A  43.12 
 
 		 128 aa  82  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.150572 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0068  ribosome-binding factor A  38.98 
 
 		 125 aa  82  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00108757  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1052  ribosome-binding factor A  36.75 
 
 		 132 aa  82  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164371  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2980  ribosome-binding factor A  36.59 
 
 		 119 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.06185e-26 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3580  ribosome-binding factor A  40.54 
 
 		 133 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1661  ribosome-binding factor A  40 
 
 		 121 aa  82.8  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.661527  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0964  ribosome-binding factor A  38.21 
 
 		 122 aa  82  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.404033  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2665  ribosome-binding factor A  39.2 
 
 		 133 aa  81.3  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0640591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0610  ribosome-binding factor A  36.11 
 
 		 128 aa  80.9  0.000000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0012936  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07850  ribosome-binding factor A  36.45 
 
 		 122 aa  80.9  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0837  ribosome-binding factor A  36.94 
 
 		 116 aa  80.9  0.000000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1693  ribosome-binding factor A  37.38 
 
 		 141 aa  80.5  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0101873  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3474  ribosome-binding factor A  39.64 
 
 		 133 aa  80.9  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3604  ribosome-binding factor A  40.37 
 
 		 133 aa  80.5  0.000000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0265365 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1124  ribosome-binding factor A  44.95 
 
 		 121 aa  80.1  0.000000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.559774  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03034  ribosome-binding factor A  40.54 
 
 		 133 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.710808  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0538  ribosome-binding factor A  40.54 
 
 		 133 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1046  ribosome-binding factor A  38.84 
 
 		 141 aa  79.3  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.12886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3651  ribosome-binding factor A  40.54 
 
 		 133 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0531  ribosome-binding factor A  40.54 
 
 		 133 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335299 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02985  hypothetical protein  40.54 
 
 		 133 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.757266  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1902  ribosome-binding factor A  35.25 
 
 		 122 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0066847  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4488  ribosome-binding factor A  40.54 
 
 		 133 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3463  ribosome-binding factor A  40.54 
 
 		 133 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.287723 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3359  ribosome-binding factor A  40.54 
 
 		 133 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3604  ribosome-binding factor A  40.54 
 
 		 133 aa  79.7  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0998  ribosome-binding factor A  35.25 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00108919  normal  0.25507 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2488  ribosome-binding factor A  39.62 
 
 		 159 aa  79  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.180348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1670  ribosome-binding factor A  34.17 
 
 		 123 aa  79  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.014786  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0226  ribosome-binding factor A  36.94 
 
 		 140 aa  79  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.435446  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1105  ribosome-binding factor A  38.02 
 
 		 132 aa  78.6  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.657587  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0696  ribosome-binding factor A  39.25 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146266  normal  0.222032 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1051  ribosome-binding factor A  39.09 
 
 		 122 aa  78.6  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000570949  hitchhiker  0.000000154001 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3474  ribosome-binding factor A  39.64 
 
 		 133 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3642  ribosome-binding factor A  39.64 
 
 		 133 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3046  ribosome-binding factor A  36.45 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62740  ribosome-binding factor A  43.16 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.232446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1330  ribosome-binding factor A  35.14 
 
 		 130 aa  78.2  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.285304  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0601  ribosome-binding factor A  39.62 
 
 		 135 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0818  ribosome-binding factor A  37.5 
 
 		 119 aa  78.2  0.00000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1445  ribosome-binding factor A  32.5 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000145103  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1356  ribosome-binding factor A  35.14 
 
 		 116 aa  77.8  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.348543  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5461  ribosome-binding factor A  44.21 
 
 		 128 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1748  ribosome-binding factor A  39.32 
 
 		 126 aa  77.8  0.00000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0187668  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0032  ribosome-binding factor A  37.7 
 
 		 137 aa  77.8  0.00000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2030  ribosome-binding factor A  35.83 
 
 		 123 aa  77.8  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0111953  normal  0.0437908 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2294  ribosome-binding factor A  38.74 
 
 		 155 aa  77.4  0.00000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.121706 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26151  ribosome-binding factor A  39.64 
 
 		 142 aa  77  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.549053 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0230  ribosome-binding factor A  39.62 
 
 		 136 aa  77  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00202036  normal  0.436051 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0058  ribosome-binding factor A  40.57 
 
 		 138 aa  77  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.649534  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>