More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0414 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0414  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 252 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1806  extracellular solute-binding protein  80 
 
 		 253 aa  423  1e-117  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0263139  unclonable  0.0000000066734 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1775  extracellular solute-binding protein  63.49 
 
 		 251 aa  330  1e-89  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.742308  hitchhiker  0.000324527 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0143  extracellular solute-binding protein  61.66 
 
 		 252 aa  315  3e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.216874  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0013  extracellular solute-binding protein  57.37 
 
 		 253 aa  280  2e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.126244  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0564  extracellular solute-binding protein  36.95 
 
 		 243 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.323644  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0340  extracellular solute-binding protein  37.93 
 
 		 248 aa  162  7e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.419937  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1448  extracellular solute-binding protein  37.25 
 
 		 254 aa  161  1e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.194926  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1630  extracellular solute-binding protein  35.6 
 
 		 247 aa  160  2e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0471  extracellular solute-binding protein  36.8 
 
 		 254 aa  159  4e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.295976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0283  extracellular solute-binding protein  37.2 
 
 		 248 aa  159  4e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.37574  hitchhiker  0.000912938 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0366  extracellular solute-binding protein  35.74 
 
 		 253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0754  extracellular solute-binding protein  40.83 
 
 		 252 aa  152  4e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00633321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1164  extracellular solute-binding protein  38.64 
 
 		 252 aa  149  3e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.065416  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0820  extracellular solute-binding protein  36.69 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0067  extracellular solute-binding protein  36.7 
 
 		 252 aa  139  6e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.571905  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0283  extracellular solute-binding protein  35.42 
 
 		 239 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.274556  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1805  extracellular solute-binding protein  33.47 
 
 		 246 aa  124  1e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0545186  unclonable  0.00000000660342 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2062  glutamine-binding periplasmic protein of glutamine ABC transporter  29.8 
 
 		 502 aa  111  9e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2350  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter amino acid-binding protein/permease  29.8 
 
 		 502 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.140877  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1986  extracellular solute-binding protein  31.28 
 
 		 253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  28.02 
 
 		 260 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.62778 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  31.14 
 
 		 266 aa  107  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1767  extracellular solute-binding protein  30.77 
 
 		 276 aa  107  1e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.99488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0864  extracellular solute-binding protein  34.13 
 
 		 248 aa  106  4e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.887861  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  29.64 
 
 		 266 aa  105  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  30.57 
 
 		 266 aa  103  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  30.57 
 
 		 266 aa  103  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  29.82 
 
 		 285 aa  103  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  29.82 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  29.82 
 
 		 285 aa  103  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  29.82 
 
 		 266 aa  102  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1328  extracellular solute-binding protein  30.41 
 
 		 249 aa  102  5e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.313303  normal  0.666491 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3922  extracellular solute-binding protein family 3  31.7 
 
 		 282 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.998829  normal  0.0650452 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0724  extracellular solute-binding protein  27.63 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.531273  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0172  extracellular solute-binding protein  31.58 
 
 		 248 aa  100  3e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2995  extracellular solute-binding protein  28.34 
 
 		 257 aa  99.4  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4899  extracellular solute-binding protein  28.34 
 
 		 257 aa  99.4  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.092586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5371  extracellular solute-binding protein  28.34 
 
 		 257 aa  99.4  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  27.38 
 
 		 266 aa  98.6  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  26.98 
 
 		 266 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  27.38 
 
 		 266 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  26.98 
 
 		 266 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  26.98 
 
 		 266 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  29.84 
 
 		 257 aa  98.6  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4198  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 		 257 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  29.86 
 
 		 265 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  28.83 
 
 		 265 aa  97.1  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1525  extracellular solute-binding protein  27.39 
 
 		 255 aa  96.3  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.490796  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1475  extracellular solute-binding protein  26.85 
 
 		 260 aa  96.3  4e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0984243  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18770  extracellular solute-binding protein family 3  27.94 
 
 		 244 aa  95.9  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.74936e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1658  extracellular solute-binding protein  29.09 
 
 		 243 aa  95.1  8e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000026827  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4248  extracellular solute-binding protein  27.95 
 
 		 266 aa  95.5  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0312845 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0743  extracellular solute-binding protein  29.12 
 
 		 260 aa  95.1  9e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  28.96 
 
 		 266 aa  95.1  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1739  extracellular solute-binding protein  30.89 
 
 		 248 aa  94.7  1e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.376685 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1512  hypothetical protein  31.05 
 
 		 238 aa  94.7  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  28.96 
 
 		 266 aa  95.1  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  28.96 
 
 		 266 aa  95.1  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4772  extracellular solute-binding protein  27.95 
 
 		 266 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4024  extracellular solute-binding protein  27.19 
 
 		 270 aa  92.8  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.400278  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2588  extracellular solute-binding protein  26.18 
 
 		 270 aa  92.8  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0228  lysine/arginine/ornithine ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.56 
 
 		 260 aa  92.8  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.892568  normal  0.956195 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  23.24 
 
 		 264 aa  91.3  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3496  extracellular solute-binding protein  27.31 
 
 		 258 aa  91.3  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4626  arginine/ornithine binding protein AotJ  27.71 
 
 		 259 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1044  extracellular solute-binding protein family 3  29.03 
 
 		 247 aa  91.3  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3045  extracellular solute-binding protein  28.05 
 
 		 252 aa  91.7  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.29813  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0112  ABC-type amino acid transport system, periplasmic component  27.88 
 
 		 271 aa  91.3  1e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1452  amino acid ABC transporter periplasmic protein  27.82 
 
 		 264 aa  91.7  1e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000020347  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3585  extracellular solute-binding protein  26.41 
 
 		 266 aa  90.9  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0150  extracellular solute-binding protein  28.96 
 
 		 306 aa  90.5  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.975549 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0836  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  26.64 
 
 		 266 aa  90.9  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0996489 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1454  amino acid ABC transporter periplasmic protein  30.47 
 
 		 265 aa  90.5  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00353635  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0971  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.71 
 
 		 259 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000530479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4174  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.27 
 
 		 259 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0433211 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0208  basic amino acid ABC transporter periplasmic protein  26.21 
 
 		 255 aa  90.1  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0717  extracellular solute-binding protein family 3  30.22 
 
 		 247 aa  90.5  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.303541  normal  0.0145592 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0202  extracellular solute-binding protein  28.96 
 
 		 306 aa  90.5  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.725948  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04090  putative binding protein component of ABC transporter  27.88 
 
 		 256 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1377  extracellular solute-binding protein  28.21 
 
 		 277 aa  90.5  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000115158  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2113  extracellular solute-binding protein  27.88 
 
 		 290 aa  90.1  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1471  hypothetical protein  30.32 
 
 		 238 aa  89.7  4e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4264  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.75 
 
 		 259 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000272293  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5552  ABC transporter substrate binding protein (glutamine)  30.7 
 
 		 250 aa  89.4  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3886  amino acid ABC transporter permease  28.15 
 
 		 501 aa  89.4  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3995  extracellular solute-binding protein  27.67 
 
 		 259 aa  89  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0155411  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4225  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.27 
 
 		 259 aa  89  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000103966  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0255  extracellular solute-binding protein  26.84 
 
 		 257 aa  89  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.367372 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3905  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.27 
 
 		 259 aa  88.6  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000878527  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4285  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.27 
 
 		 259 aa  88.6  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000352358  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4059  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  27.27 
 
 		 259 aa  88.6  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000988465  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3898  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.27 
 
 		 259 aa  88.6  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.3817799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4376  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  27.27 
 
 		 259 aa  88.6  9e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000139221  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4136  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.09 
 
 		 260 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.502518  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2849  extracellular solute-binding protein  28.74 
 
 		 261 aa  88.2  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000542084  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  28.35 
 
 		 265 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3091  ABC transporter, substrate binding component  25.54 
 
 		 266 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0186  extracellular solute-binding protein  25.44 
 
 		 251 aa  88.2  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3742  extracellular solute-binding protein  24.43 
 
 		 261 aa  87.8  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>