More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0031 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0031  50S ribosomal protein L23P  100 
 
 
86 aa  170  7e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0793  50S ribosomal protein L23P  98.84 
 
 
86 aa  169  1e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.110307  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1125  50S ribosomal protein L23P  98.84 
 
 
86 aa  167  4e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0859  50S ribosomal protein L23P  87.21 
 
 
86 aa  152  1e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.455359  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0805  50S ribosomal protein L23P  77.91 
 
 
86 aa  140  5e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.720418  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00350  ribosomal protein, putative  50 
 
 
154 aa  85.1  3e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0228  ribosomal protein L25/L23  45.88 
 
 
90 aa  84.3  5e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_61259  predicted protein  48.81 
 
 
139 aa  80.1  9e-15  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2294  50S ribosomal protein L23P  43.53 
 
 
87 aa  75.5  3e-13  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2447  50S ribosomal protein L23P  38.27 
 
 
84 aa  75.1  3e-13  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1798  50S ribosomal protein L23P  45 
 
 
81 aa  75.1  3e-13  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.217622  normal  0.590833 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1519  ribosomal protein L23  50.62 
 
 
87 aa  74.7  4e-13  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  2.62554e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2220  ribosomal protein L23  45.68 
 
 
84 aa  74.3  5e-13  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16602  Ribosomal protein L23a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  40 
 
 
121 aa  72.8  1e-12  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0212  ribosomal protein L23  44.44 
 
 
84 aa  73.2  1e-12  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1726  ribosomal protein L25/L23  42.5 
 
 
82 aa  72  3e-12  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0978109  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0093  50S ribosomal protein L23P  43.75 
 
 
81 aa  71.6  3e-12  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  2.49681e-09  unclonable  3.35999e-07 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2048  50S ribosomal protein L23P  38.75 
 
 
82 aa  68.9  2e-11  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.700766 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0815  50S ribosomal protein L23P  43.75 
 
 
81 aa  69.3  2e-11  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0083  50S ribosomal protein L23P  46.05 
 
 
82 aa  68.6  3e-11  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.657611  normal  0.218333 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08856  60S ribosomal protein L23 (AFU_orthologue; AFUA_5G05630)  43.9 
 
 
153 aa  68.2  3e-11  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1585  50S ribosomal protein L23P  40 
 
 
81 aa  67.4  7e-11  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0534  50S ribosomal protein L23P  41.77 
 
 
83 aa  66.2  1e-10  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.646212  normal  0.481774 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0566  50S ribosomal protein L23P  40.74 
 
 
82 aa  65.5  2e-10  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0431079  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1776  ribosomal protein L23  41.98 
 
 
81 aa  64.7  4e-10  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0758  50S ribosomal protein L23  46.88 
 
 
99 aa  60.5  8e-09  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  1.56644e-07  normal  0.0173378 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1830  50S ribosomal protein L23P  36.14 
 
 
85 aa  60.1  9e-09  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.649517 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0444  50S ribosomal protein L23P  36.25 
 
 
82 aa  59.7  1e-08  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0443463  normal  0.681719 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2709  Ribosomal protein L25/L23  47.69 
 
 
95 aa  60.1  1e-08  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  6.05336e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3993  Ribosomal protein L25/L23  46.27 
 
 
94 aa  58.2  3e-08  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2251  50S ribosomal protein L23P  35 
 
 
82 aa  58.2  4e-08  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  2.99035e-09  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0285  50S ribosomal protein L23  40.7 
 
 
100 aa  57.8  5e-08  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  2.48684e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0586  50S ribosomal protein L23  40.7 
 
 
100 aa  57.8  5e-08  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.08369e-09  normal  0.186609 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3913  50S ribosomal protein L23  40.7 
 
 
100 aa  57.8  5e-08  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.78804e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2220  50S ribosomal protein L23  41.43 
 
 
98 aa  57.4  6e-08  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3705  50S ribosomal protein L23  43.53 
 
 
110 aa  57.4  7e-08  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0693  50S ribosomal protein L23  36.59 
 
 
104 aa  57  9e-08  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.001904  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1231  50S ribosomal protein L23  43.75 
 
 
97 aa  56.6  1e-07  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.244915  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1958  50S ribosomal protein L23  43.75 
 
 
97 aa  56.6  1e-07  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0171198  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1194  50S ribosomal protein L23  43.75 
 
 
97 aa  56.6  1e-07  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2125  50S ribosomal protein L23  46.88 
 
 
98 aa  56.6  1e-07  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.966187  normal  0.432558 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4542  50S ribosomal protein L23  40.7 
 
 
100 aa  56.6  1e-07  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  1.72317e-09  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2164  50S ribosomal protein L23  45.31 
 
 
98 aa  56.2  2e-07  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.561642 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2442  50S ribosomal protein L23  45.31 
 
 
98 aa  56.2  2e-07  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.369477  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2816  50S ribosomal protein L23  46.88 
 
 
102 aa  56.2  2e-07  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.947427  normal  0.439693 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0315  ribosomal protein L25/L23  35.29 
 
 
86 aa  55.1  3e-07  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.997937  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0325  50S ribosomal protein L23  40.7 
 
 
100 aa  54.7  4e-07  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  1.18373e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1356  ribosomal protein L25/L23  45.31 
 
 
103 aa  54.7  4e-07  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.385939  normal  0.0499735 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0407  50S ribosomal protein L23  40.7 
 
 
100 aa  54.7  4e-07  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00180319  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2153  50S ribosomal protein L23P  38.24 
 
 
95 aa  54.3  5e-07  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0455845  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1088  50S ribosomal protein L23  42.19 
 
 
100 aa  54.7  5e-07  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3326  50S ribosomal protein L23  38.64 
 
 
94 aa  54.3  5e-07  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.23257e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0935  50S ribosomal protein L23  38.64 
 
 
94 aa  54.3  5e-07  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  1.34151e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3820  50S ribosomal protein L23  40.7 
 
 
100 aa  54.3  6e-07  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  4.60172e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0247  50S ribosomal protein L23  40.24 
 
 
100 aa  54.3  6e-07  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.925224  normal  0.80387 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3999  50S ribosomal protein L23  40.7 
 
 
100 aa  54.3  6e-07  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  1.01961e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0578  Ribosomal protein L25/L23  43.48 
 
 
102 aa  54.3  6e-07  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0250  50S ribosomal protein L23  40.24 
 
 
100 aa  54.3  6e-07  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0668  50S ribosomal protein L23  46.27 
 
 
97 aa  53.9  7e-07  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  1.42276e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0700  50S ribosomal protein L23  46.27 
 
 
97 aa  53.9  7e-07  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  1.43862e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0807  50S ribosomal protein L25/L23  33.33 
 
 
88 aa  53.9  7e-07  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.563432 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0460  50S ribosomal protein L23P  40.58 
 
 
99 aa  53.5  9e-07  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001740  LSU ribosomal protein L23p (L23Ae)  41.46 
 
 
100 aa  53.5  1e-06  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  4.23409e-07  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03169  50S ribosomal protein L23  39.53 
 
 
100 aa  53.5  1e-06  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000759178  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01190  Ribosomal protein L25/L23  43.75 
 
 
96 aa  53.5  1e-06  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0110234  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2561  Ribosomal protein L25/L23  34.15 
 
 
104 aa  53.1  1e-06  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0198  50S ribosomal protein L23  44.62 
 
 
95 aa  53.5  1e-06  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00352738  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03120  hypothetical protein  39.53 
 
 
100 aa  53.5  1e-06  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000565358  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0395  Ribosomal protein L25/L23  39.53 
 
 
100 aa  53.5  1e-06  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  2.25919e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3801  50S ribosomal protein L23  39.53 
 
 
100 aa  53.5  1e-06  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  7.49996e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2855  50S ribosomal protein L23  38.82 
 
 
94 aa  53.1  1e-06  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0878449  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3512  50S ribosomal protein L23  39.53 
 
 
100 aa  53.5  1e-06  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.92959e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00732  50S ribosomal protein L23  41.46 
 
 
100 aa  53.5  1e-06  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1617  Ribosomal protein L25/L23  39.74 
 
 
99 aa  53.1  1e-06  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3749  50S ribosomal protein L23  39.53 
 
 
100 aa  53.1  1e-06  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  4.8697e-06  hitchhiker  0.00429034 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  44.62 
 
 
94 aa  53.1  1e-06  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0395  50S ribosomal protein L23  39.53 
 
 
100 aa  53.5  1e-06  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  8.0861e-06  hitchhiker  0.00030352 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3613  50S ribosomal protein L23  39.53 
 
 
100 aa  53.5  1e-06  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  8.47098e-06  hitchhiker  0.00309782 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3665  50S ribosomal protein L23  43.75 
 
 
99 aa  53.1  1e-06  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1676  50S ribosomal protein L23  39.36 
 
 
97 aa  53.1  1e-06  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.62104  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2297  50S ribosomal protein L23  42.19 
 
 
99 aa  53.1  1e-06  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3707  50S ribosomal protein L23  39.53 
 
 
100 aa  52.8  1e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000802937  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3742  50S ribosomal protein L23  39.53 
 
 
100 aa  52.8  1e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.344368  normal  0.0150111 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3634  50S ribosomal protein L23  39.53 
 
 
100 aa  52.8  1e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00980054  normal  0.223242 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0330  ribosomal protein L23  45.68 
 
 
100 aa  53.5  1e-06  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3634  50S ribosomal protein L23  39.53 
 
 
100 aa  52.8  1e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  7.93915e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3805  50S ribosomal protein L23  39.53 
 
 
100 aa  52.8  1e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000686351  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4641  50S ribosomal protein L23  39.53 
 
 
100 aa  53.5  1e-06  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0287124  normal  0.0460173 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1294  50S ribosomal protein L23  35.37 
 
 
105 aa  53.5  1e-06  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  9.21122e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3703  50S ribosomal protein L23  39.53 
 
 
100 aa  53.5  1e-06  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  2.25733e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04519  50S ribosomal protein L23  53.33 
 
 
99 aa  52  2e-06  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  2.51996e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0424  50S ribosomal protein L23  45.31 
 
 
95 aa  52.8  2e-06  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.40996e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1547  50S ribosomal protein L23  43.75 
 
 
98 aa  52.4  2e-06  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1366  50S ribosomal protein L23  42.42 
 
 
98 aa  52.8  2e-06  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.263915  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3010  50S ribosomal protein L23  36.47 
 
 
101 aa  52.4  2e-06  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00732369 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0710  50S ribosomal protein L23  42.62 
 
 
95 aa  52.4  2e-06  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.58529  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0564  Ribosomal protein L25/L23  42.19 
 
 
100 aa  52  3e-06  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0325  Ribosomal protein L25/L23  37.5 
 
 
97 aa  51.6  3e-06  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  1.79883e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0628  50S ribosomal protein L23  35.96 
 
 
94 aa  52  3e-06  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.16587e-06  hitchhiker  9.56309e-13 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1251  50S ribosomal protein L23  45.31 
 
 
100 aa  51.6  3e-06  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.781143  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>