More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0003 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0003  dethiobiotin synthase  100 
 
 
186 aa  367  1e-101  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1097  dethiobiotin synthase  90.32 
 
 
190 aa  336  9.999999999999999e-92  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.110147  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0820  dethiobiotin synthase  88.17 
 
 
186 aa  331  3e-90  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.22019  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0885  dethiobiotin synthase  66.49 
 
 
211 aa  258  4e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0883  dethiobiotin synthase  60.33 
 
 
212 aa  226  2e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.619901  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0021  dethiobiotin synthase  35.08 
 
 
244 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00210748  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1327  dethiobiotin synthase  38.33 
 
 
263 aa  125  5e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2165  dethiobiotin synthase  35.03 
 
 
239 aa  121  6e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1836  dethiobiotin synthase  39.01 
 
 
242 aa  119  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.354399  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2243  dethiobiotin synthase  42.67 
 
 
243 aa  119  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.519579  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2052  dethiobiotin synthase  34.74 
 
 
239 aa  117  7e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1583  dethiobiotin synthase  39.49 
 
 
240 aa  117  7.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0552587  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2543  dethiobiotin synthase  34.74 
 
 
243 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000737689  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2855  dethiobiotin synthase  30.96 
 
 
249 aa  114  7.999999999999999e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1794  dithiobiotin synthetase  39.13 
 
 
228 aa  114  8.999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26269  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2369  dethiobiotin synthase  38.82 
 
 
264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0971494  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1176  dethiobiotin synthase  32.47 
 
 
243 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.592702  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2817  dithiobiotin synthetase  32.97 
 
 
242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3950  dithiobiotin synthetase  33.33 
 
 
242 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1157  dethiobiotin synthase  40 
 
 
217 aa  108  5e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.125346  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4188  dithiobiotin synthetase  32.2 
 
 
242 aa  106  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1008  dithiobiotin synthetase  32.77 
 
 
242 aa  106  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4252  dithiobiotin synthetase  31.64 
 
 
242 aa  105  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4229  dithiobiotin synthetase  32.77 
 
 
242 aa  105  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.411801  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1752  dethiobiotin synthase  35.03 
 
 
222 aa  105  4e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00909358  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2051  dethiobiotin synthase  30.65 
 
 
219 aa  105  5e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0366532  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0823  dethiobiotin synthase  32.46 
 
 
228 aa  104  9e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0599522 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4330  dithiobiotin synthetase  35.03 
 
 
228 aa  103  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.112465  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3874  dithiobiotin synthetase  31.64 
 
 
242 aa  103  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1047  dethiobiotin synthase  35.58 
 
 
216 aa  102  3e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.113648  normal  0.557843 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1581  dethiobiotin synthase  39.6 
 
 
241 aa  102  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.413996 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1459  dethiobiotin synthase  34.62 
 
 
244 aa  101  7e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175087  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0103  dethiobiotin synthase  33.7 
 
 
241 aa  100  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.188104  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4142  dithiobiotin synthetase  31.07 
 
 
242 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3860  dithiobiotin synthetase  31.07 
 
 
242 aa  99.4  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1373  dithiobiotin synthetase  33.81 
 
 
226 aa  99  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.265061  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0398  dethiobiotin synthase  30.34 
 
 
213 aa  99  3e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1842  dithiobiotin synthetase  29.94 
 
 
244 aa  98.6  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.709275  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2835  dethiobiotin synthase  31.85 
 
 
225 aa  98.2  5e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4027  dithiobiotin synthetase  31.07 
 
 
242 aa  98.2  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4340  dithiobiotin synthetase  31.07 
 
 
242 aa  98.2  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2900  dithiobiotin synthetase  32.56 
 
 
221 aa  95.9  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.231577 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0681  dethiobiotin synthase  33.71 
 
 
210 aa  95.1  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2426  dithiobiotin synthetase  40 
 
 
229 aa  95.1  5e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0030  dethiobiotin synthase  34.88 
 
 
210 aa  94.7  7e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.82628  normal  0.806655 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5562  dethiobiotin synthase  39.01 
 
 
210 aa  94.4  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1002  dethiobiotin synthase  34.81 
 
 
216 aa  94.4  9e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16511  putative dethiobiotin synthase  38.6 
 
 
221 aa  94  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6892  dethiobiotin synthase  29.05 
 
 
234 aa  94  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16611  putative dethiobiotin synthase  34.09 
 
 
232 aa  93.6  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.258874  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16731  putative dethiobiotin synthase  33.15 
 
 
221 aa  94  1e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0144  dethiobiotin synthase  33.73 
 
 
474 aa  92.8  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.211479  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18711  putative dethiobiotin synthase  34.81 
 
 
216 aa  93.2  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85593  dethiobiotin synthetase  40.54 
 
 
217 aa  92  4e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3643  dethiobiotin synthase  32.89 
 
 
236 aa  91.3  8e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2160  dethiobiotin synthase  30.53 
 
 
228 aa  91.3  8e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2454  dethiobiotin synthase  30.81 
 
 
224 aa  90.9  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.101684  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1833  dethiobiotin synthase  36 
 
 
233 aa  90.5  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2946  dethiobiotin synthase  32.48 
 
 
239 aa  90.9  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00040484  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05390  dethiobiotin synthetase  35.93 
 
 
205 aa  89.7  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.198587  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1564  dethiobiotin synthase  33.52 
 
 
221 aa  89.4  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2293  dethiobiotin synthase  30.43 
 
 
220 aa  88.6  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1911  dethiobiotin synthase  33.8 
 
 
227 aa  89  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0526  dethiobiotin synthase  25.65 
 
 
248 aa  88.6  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0621  dethiobiotin synthase  32.54 
 
 
219 aa  88.6  5e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.868735  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1129  dethiobiotin synthetase  31.18 
 
 
228 aa  87  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.543969  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2097  dethiobiotin synthase  33.97 
 
 
243 aa  87.4  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0617  dethiobiotin synthase  30.21 
 
 
249 aa  87.4  1e-16  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0451088  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0071  dethiobiotin synthase  35.22 
 
 
223 aa  86.7  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.255458  normal  0.0373724 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4265  dithiobiotin synthetase  31.18 
 
 
245 aa  86.3  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0554323 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3842  dethiobiotin synthase  35.86 
 
 
194 aa  85.9  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04561  putative dethiobiotin synthase  33.53 
 
 
232 aa  85.9  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0465  dithiobiotin synthetase  30.07 
 
 
230 aa  85.9  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000224118  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2053  dithiobiotin synthetase  34.67 
 
 
217 aa  85.5  4e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0534973 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3668  dethiobiotin synthase  33.78 
 
 
210 aa  85.5  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192292  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1568  dethiobiotin synthase  29.14 
 
 
231 aa  85.5  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.248853  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0116  dithiobiotin synthetase  35.14 
 
 
224 aa  85.5  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1996  dithiobiotin synthetase  30.23 
 
 
225 aa  84.7  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3096  dethiobiotin synthase  26.63 
 
 
238 aa  84.7  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0149  dethiobiotin synthase  32.19 
 
 
248 aa  84.3  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2919  dithiobiotin synthetase  37.12 
 
 
213 aa  84.3  9e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0445  dithiobiotin synthetase  30.65 
 
 
247 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2186  dethiobiotin synthase  31.93 
 
 
227 aa  84  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0811  dethiobiotin synthase  32.34 
 
 
210 aa  83.6  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.624971  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1910  dethiobiotin synthase  31.9 
 
 
204 aa  83.2  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0517  dethiobiotin synthase  36.02 
 
 
221 aa  83.2  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0354098  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2420  dithiobiotin synthetase  35.07 
 
 
213 aa  83.2  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.401456  normal  0.0742626 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1675  dethiobiotin synthetase  31.76 
 
 
251 aa  83.2  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0926  dithiobiotin synthetase  28.86 
 
 
225 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000415248  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2098  dithiobiotin synthetase  34.56 
 
 
209 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.250318  normal  0.47001 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1373  dethiobiotin synthase  31.76 
 
 
262 aa  83.2  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0422  dethiobiotin synthase  27.96 
 
 
234 aa  82.8  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000789598 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0246  dethiobiotin synthetase  27.96 
 
 
234 aa  82.8  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187676  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4239  dithiobiotin synthetase  37.88 
 
 
212 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.528424 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0304  dethiobiotin synthase  26.88 
 
 
225 aa  82.8  0.000000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3711  dethiobiotin synthase  28.65 
 
 
237 aa  82.4  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00204232  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0036  dethiobiotin synthase  36.76 
 
 
206 aa  82.8  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15911  putative dethiobiotin synthase  34.71 
 
 
242 aa  81.6  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.454357  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2812  dethiobiotin synthase  31.43 
 
 
266 aa  81.6  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00660538  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0717  dithiobiotin synthetase  29.17 
 
 
206 aa  81.3  0.000000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>