105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5477 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_5477  hypothetical protein  100 
 
 
285 aa  566  1e-160  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0193619  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5764  hypothetical protein  98.25 
 
 
285 aa  555  1e-157  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5388  hypothetical protein  99.59 
 
 
242 aa  478  1e-134  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5265  hypothetical protein  61.4 
 
 
286 aa  348  4e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.550058 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3899  hypothetical protein  39.64 
 
 
289 aa  173  2.9999999999999996e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3303  hypothetical protein  37.1 
 
 
279 aa  150  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5155  protein of unknown function DUF559  36.75 
 
 
311 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2561  hypothetical protein  30.34 
 
 
285 aa  88.2  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.465825  normal  0.0508989 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1506  hypothetical protein  32.01 
 
 
306 aa  81.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1560  hypothetical protein  32.87 
 
 
304 aa  81.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.426763  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1053  protein of unknown function DUF559  32.35 
 
 
270 aa  78.2  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100575  normal  0.261729 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0804  hypothetical protein  28.99 
 
 
318 aa  76.3  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3817  hypothetical protein  31.44 
 
 
294 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.590665  normal  0.529394 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4824  hypothetical protein  33.61 
 
 
295 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5457  hypothetical protein  28.21 
 
 
301 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.597295 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1580  protein of unknown function DUF559  31.72 
 
 
305 aa  62.8  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3899  hypothetical protein  27.47 
 
 
289 aa  62  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05730  hypothetical protein  28.47 
 
 
297 aa  61.2  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0096  hypothetical protein  29.6 
 
 
286 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0105  hypothetical protein  29.6 
 
 
286 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3039  hypothetical protein  31.33 
 
 
289 aa  60.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000250216  hitchhiker  0.00216931 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0597  hypothetical protein  26.17 
 
 
320 aa  60.1  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0726  hypothetical protein  27.97 
 
 
310 aa  58.2  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1355  hypothetical protein  28.47 
 
 
335 aa  57.4  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0634709  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0971  hypothetical protein  27.39 
 
 
320 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0989  hypothetical protein  27.39 
 
 
320 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0711273  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0999  hypothetical protein  27.39 
 
 
320 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4629  hypothetical protein  31.82 
 
 
277 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4717  hypothetical protein  31.82 
 
 
277 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247054  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11511  hypothetical protein  27.08 
 
 
280 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.494625 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12277  hypothetical protein  25.86 
 
 
295 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000026926  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13550  hypothetical protein  31.68 
 
 
279 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000138397  hitchhiker  0.00000300083 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1289  hypothetical protein  28.52 
 
 
294 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.17962  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5011  hypothetical protein  31.25 
 
 
277 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.938275  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2531  hypothetical protein  26.57 
 
 
306 aa  54.3  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2486  hypothetical protein  28.31 
 
 
309 aa  54.3  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.123059  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1335  hypothetical protein  28.72 
 
 
293 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.402305 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1942  hypothetical protein  35.92 
 
 
357 aa  53.1  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.116952 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4768  protein of unknown function DUF559  30.83 
 
 
259 aa  53.1  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.146214  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1723  hypothetical protein  28.21 
 
 
306 aa  53.1  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0541732 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2878  hypothetical protein  30.34 
 
 
302 aa  52.8  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5044  hypothetical protein  28.63 
 
 
291 aa  52  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1651  hypothetical protein  33.71 
 
 
123 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.173926 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0608  hypothetical protein  29.91 
 
 
290 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.876444  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0621  hypothetical protein  29.91 
 
 
290 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.568124  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0599  hypothetical protein  29.91 
 
 
290 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2277  hypothetical protein  34.94 
 
 
257 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110769  hitchhiker  0.0000150727 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3623  hypothetical protein  32.75 
 
 
293 aa  51.2  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.510989  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16880  hypothetical protein  27.59 
 
 
327 aa  50.1  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.38822  normal  0.977824 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4792  hypothetical protein  28.29 
 
 
294 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.79958  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0966  hypothetical protein  28.43 
 
 
275 aa  50.1  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0128  hypothetical protein  28.29 
 
 
300 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0735  hypothetical protein  27.31 
 
 
305 aa  49.3  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2211  protein of unknown function DUF559  35.21 
 
 
122 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2274  protein of unknown function DUF559  35.21 
 
 
122 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0690835  hitchhiker  0.00000422818 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0138  hypothetical protein  28.29 
 
 
300 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4159  hypothetical protein  29.72 
 
 
276 aa  48.5  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00219007  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0147  hypothetical protein  28.29 
 
 
300 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0342  hypothetical protein  29.91 
 
 
289 aa  48.9  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.844394  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4812  hypothetical protein  28.81 
 
 
307 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00673201 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1959  hypothetical protein  39.66 
 
 
121 aa  47.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00461889  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0561  hypothetical protein  31.19 
 
 
320 aa  48.1  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.273722  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17370  hypothetical protein  27.39 
 
 
351 aa  47.8  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00299301 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0955  hypothetical protein  29.15 
 
 
307 aa  48.1  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1169  hypothetical protein  26.26 
 
 
320 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1186  hypothetical protein  26.26 
 
 
320 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2841  protein of unknown function DUF559  42.31 
 
 
148 aa  47  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00016732  normal  0.493476 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0780  hypothetical protein  29.2 
 
 
201 aa  46.6  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.600335  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0086  hypothetical protein  29.27 
 
 
278 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.329246 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3007  hypothetical protein  28.95 
 
 
424 aa  46.2  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.153123  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0865  hypothetical protein  29.02 
 
 
319 aa  45.8  0.0009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0633151  normal  0.194369 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3354  hypothetical protein  27.71 
 
 
374 aa  45.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11062  hypothetical protein  34.17 
 
 
207 aa  45.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1238  protein of unknown function DUF559  28.71 
 
 
144 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1233  hypothetical protein  34.57 
 
 
151 aa  45.8  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0114459  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2516  hypothetical protein  35.38 
 
 
316 aa  44.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0713675  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0541  hypothetical protein  31.17 
 
 
225 aa  44.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.164679  normal  0.146689 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3129  hypothetical protein  27.66 
 
 
279 aa  44.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.975256  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0912  hypothetical protein  26.72 
 
 
289 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0938391  normal  0.0123481 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4517  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  26.79 
 
 
1986 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0952  leucyl-tRNA synthetase  28.21 
 
 
1146 aa  44.3  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22570  hypothetical protein  28.77 
 
 
237 aa  44.3  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22770  hypothetical protein  28.68 
 
 
303 aa  44.3  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.513597  normal  0.79035 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3080  putative DNA helicase  25.86 
 
 
1983 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0715277 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0966  hypothetical protein  35.48 
 
 
137 aa  43.9  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0444734  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0914  hypothetical protein  36.84 
 
 
316 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.462598 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13746  hypothetical protein  28.38 
 
 
296 aa  43.9  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00180958  normal  0.465684 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1037  protein of unknown function DUF559  36.21 
 
 
122 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0549922  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1692  hypothetical protein  29.52 
 
 
303 aa  43.9  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.360943  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2488  hypothetical protein  37.68 
 
 
925 aa  43.5  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1094  hypothetical protein  29.17 
 
 
144 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.090836  normal  0.542302 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0068  hypothetical protein  25.95 
 
 
276 aa  43.5  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2158  hypothetical protein  27.84 
 
 
321 aa  43.1  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2875  hypothetical protein  37.08 
 
 
184 aa  43.1  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0638  hypothetical protein  26.56 
 
 
284 aa  42.7  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0651  hypothetical protein  26.56 
 
 
284 aa  42.7  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.617524  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0631  hypothetical protein  26.56 
 
 
284 aa  42.7  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0729308 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1350  type III restriction protein res subunit  34.38 
 
 
967 aa  43.1  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.810752  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3954  hypothetical protein  35.09 
 
 
162 aa  42.7  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0732034  normal  0.657782 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3848  hypothetical protein  41.94 
 
 
143 aa  42.7  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0110186  normal  0.347936 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>