73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl027 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006055  Mfl027  DNA uptake protein  100 
 
 		 378 aa  772    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2072  beta-lactamase domain protein  26.13 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1135  beta-lactamase domain protein  26.13 
 
 		 320 aa  55.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000516269  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2581  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.27 
 
 		 856 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1890  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  21.2 
 
 		 845 aa  55.1  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1471  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22 
 
 		 856 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.300879  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1693  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22 
 
 		 842 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.891985  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3120  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22 
 
 		 856 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2198  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22 
 
 		 856 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.975554  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2636  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22 
 
 		 856 aa  53.9  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0667077  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2715  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22 
 
 		 842 aa  54.3  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1902  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.09 
 
 		 880 aa  53.5  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2103  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.1 
 
 		 812 aa  53.5  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.858083  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1120  putative transporter DNA uptake transmembrane protein  25 
 
 		 847 aa  53.5  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0978754  normal  0.511509 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1519  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.2 
 
 		 790 aa  53.1  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1043  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.14 
 
 		 851 aa  53.1  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.605949 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1716  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.52 
 
 		 846 aa  51.2  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.116279  normal  0.782454 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12920  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.57 
 
 		 775 aa  50.8  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000012809  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2510  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  21.15 
 
 		 794 aa  50.4  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2752  beta-lactamase-like protein  22.54 
 
 		 443 aa  50.4  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0606  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.09 
 
 		 778 aa  50.4  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1043  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.14 
 
 		 785 aa  50.4  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5080  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.5 
 
 		 832 aa  50.4  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.411729  normal  0.0251813 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1508  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.47 
 
 		 737 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3817  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  20.47 
 
 		 738 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.925349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1473  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.41 
 
 		 738 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1314  beta-lactamase domain-containing protein  22.75 
 
 		 363 aa  50.1  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1173  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.7 
 
 		 750 aa  49.7  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00434485  hitchhiker  0.000212306 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1897  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  20.87 
 
 		 737 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116946 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1910  metallo-beta-lactamase family protein  21.43 
 
 		 284 aa  49.7  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.404298  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1955  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.2 
 
 		 786 aa  49.3  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00591  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.03 
 
 		 776 aa  48.9  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0903265  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2177  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  21.63 
 
 		 740 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.589266  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2506  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.31 
 
 		 766 aa  48.1  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1270  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.81 
 
 		 767 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.791158  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1258  ComEC/Rec2-related protein  24.7 
 
 		 872 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0672087 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1710  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase-like protein  26.04 
 
 		 390 aa  48.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.658274  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0547  ComEC/Rec2-related protein  26.12 
 
 		 900 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0736  putative competence-related protein  23.62 
 
 		 768 aa  47.4  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2593  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.64 
 
 		 767 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180843  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1921  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25 
 
 		 752 aa  47  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00848355  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0782  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.19 
 
 		 745 aa  47  0.0006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1750  metallo-beta-lactamase family protein  21.8 
 
 		 291 aa  47  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000258752  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1556  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.49 
 
 		 774 aa  47  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0645  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.81 
 
 		 709 aa  47  0.0006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000127283  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3847  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.65 
 
 		 806 aa  46.6  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1059  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.22 
 
 		 839 aa  46.6  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0600  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.46 
 
 		 815 aa  46.6  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.404851 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2686  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.32 
 
 		 767 aa  46.6  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00549034  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1561  ComEC/Rec2-related protein  24.54 
 
 		 826 aa  46.2  0.0009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.16578  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl369  DNA uptake protein  25.21 
 
 		 607 aa  45.8  0.001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  5.399e-27  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3303  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  19.84 
 
 		 789 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.78547  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1164  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.81 
 
 		 777 aa  46.2  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00428726 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0187  hypothetical protein  24.29 
 
 		 269 aa  46.2  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1205  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.65 
 
 		 845 aa  46.2  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.285892 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1682  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.57 
 
 		 783 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3098  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.38 
 
 		 811 aa  45.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2675  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.57 
 
 		 783 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.923098  normal  0.0587505 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1174  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  24.33 
 
 		 761 aa  45.1  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000121236  hitchhiker  0.000000673843 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1480  metallo-beta-lactamase family protein  22.01 
 
 		 292 aa  45.1  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000092664  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0963  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.32 
 
 		 840 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116554  normal  0.0504124 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2499  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.18 
 
 		 783 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00304772 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1702  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.48 
 
 		 839 aa  44.7  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0283023 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25480  putative competence protein  20.79 
 
 		 741 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2449  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.15 
 
 		 759 aa  44.3  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.327807  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2585  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.51 
 
 		 773 aa  43.9  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.13038 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1155  competence protein ComEC/Rec2, putative  23.4 
 
 		 738 aa  44.3  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.889631  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4406  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.47 
 
 		 773 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3404  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.34 
 
 		 747 aa  43.9  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2070  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  21.43 
 
 		 818 aa  43.9  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3468  ComEC/Rec2-related protein  26.25 
 
 		 806 aa  43.9  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4458  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.16 
 
 		 773 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00283851  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1232  beta-lactamase domain protein  23.46 
 
 		 453 aa  42.7  0.01  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000615653  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>