115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1824 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1824  flavodoxin  100 
 
 
168 aa  339  1e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2562  Flavodoxin-like protein  43.56 
 
 
179 aa  142  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2492  flavodoxin-like protein  42.24 
 
 
215 aa  124  8e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0168  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.51 
 
 
174 aa  122  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607551  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1685  flavodoxin  35.4 
 
 
172 aa  120  1e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0906832  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4171  flavodoxin-like protein  41.25 
 
 
216 aa  118  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2554  Flavodoxin-like protein  35.37 
 
 
169 aa  111  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1699  flavodoxin  34.32 
 
 
176 aa  106  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.35306  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2108  flavodoxin-like protein  35.88 
 
 
167 aa  100  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0677138  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1410  Flavodoxin-like protein  30.36 
 
 
175 aa  94.4  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00810371 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3023  flavodoxin  32.57 
 
 
170 aa  90.1  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29950  hypothetical protein  32.91 
 
 
164 aa  87.8  7e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.641113 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0573  protoporphyrinogen oxidase  32.94 
 
 
167 aa  87.8  7e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00307777 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1632  flavodoxin-like protein  29.94 
 
 
193 aa  83.2  1e-15  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.138919  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2409  protoporphyrinogen oxidase  32.91 
 
 
181 aa  83.6  1e-15  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0136205  normal  0.0149961 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1035  protoporphyrinogen oxidase  35.47 
 
 
188 aa  80.5  9e-15  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.395736  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2314  flavodoxin-like  28.57 
 
 
170 aa  80.1  1e-14  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0403811  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2438  Flavodoxin-like protein  28.4 
 
 
174 aa  77  1e-13  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  7.94828e-07  normal  0.0165675 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00340  flavodoxin  31.21 
 
 
164 aa  73.9  1e-12  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3245  flavodoxin-like protein  31.52 
 
 
176 aa  73.6  1e-12  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4369  protoporphyrinogen oxidase  28.9 
 
 
181 aa  71.6  4e-12  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  8.43735e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03690  hypothetical protein  28.9 
 
 
181 aa  71.6  5e-12  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000962205  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4073  protoporphyrinogen oxidase  28.9 
 
 
181 aa  71.6  5e-12  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.11087e-12  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03741  protoporphyrin oxidase, flavoprotein  28.9 
 
 
181 aa  71.6  5e-12  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00160389  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4160  protoporphyrinogen oxidase  28.9 
 
 
181 aa  71.6  5e-12  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  1.31743e-05  decreased coverage  2.39257e-06 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5289  protoporphyrinogen oxidase  28.9 
 
 
181 aa  71.6  5e-12  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  2.41436e-05  normal  0.0811334 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4131  Protoporphyrinogen oxidase  28.9 
 
 
181 aa  71.6  5e-12  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  3.48526e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1916  protoporphyrinogen oxidase  29.24 
 
 
177 aa  70.5  1e-11  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  1.7226e-07  normal  0.191063 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3929  protoporphyrinogen oxidase  29.24 
 
 
177 aa  70.5  1e-11  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  3.39774e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0287  protoporphyrinogen oxidase  29.24 
 
 
177 aa  70.5  1e-11  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.32863e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4320  protoporphyrinogen oxidase  28.32 
 
 
181 aa  69.7  2e-11  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  3.64139e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2375  flavodoxin  30.06 
 
 
173 aa  68.9  3e-11  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.185264  normal  0.024568 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4231  protoporphyrinogen oxidase  28.32 
 
 
181 aa  69.3  3e-11  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  1.33684e-07  normal  0.0229749 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0019  protoporphyrinogen oxidase  28.49 
 
 
184 aa  68.2  5e-11  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.309289  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0266  protoporphyrinogen oxidase  27.06 
 
 
177 aa  67.4  8e-11  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0106275  normal  0.013044 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0141  Protoporphyrinogen oxidase  30.64 
 
 
173 aa  67  1e-10  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4072  protoporphyrinogen oxidase  29.48 
 
 
176 aa  67  1e-10  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4324  protoporphyrinogen oxidase  30.99 
 
 
190 aa  67  1e-10  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1487  protoporphyrinogen oxidase  29.48 
 
 
175 aa  67.4  1e-10  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.040472  hitchhiker  0.00766519 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0027  protoporphyrinogen oxidase, putative  29.07 
 
 
184 aa  65.9  3e-10  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3336  protoporphyrinogen oxidase  27.49 
 
 
178 aa  64.7  6e-10  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00463  protoporphyrinogen oxidase  30.77 
 
 
175 aa  64.7  6e-10  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0871  protoporphyrinogen oxidase  23.7 
 
 
173 aa  64.3  8e-10  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0019  protoporphyrinogen oxidase  26.52 
 
 
181 aa  63.9  9e-10  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.827877  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3601  protoporphyrinogen oxidase  27.65 
 
 
174 aa  63.9  1e-09  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.934061  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3945  protoporphyrinogen oxidase  26.63 
 
 
180 aa  62.4  2e-09  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000851494  decreased coverage  0.00158179 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0973  protoporphyrinogen oxidase  26.01 
 
 
173 aa  62.8  2e-09  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.705197  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001985  protoporphyrinogen IX oxidase oxygen-independent HemG  28.99 
 
 
175 aa  62.8  2e-09  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  3.84734e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2953  protoporphyrinogen oxidase  27.75 
 
 
175 aa  63.2  2e-09  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.410486 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4040  protoporphyrinogen oxidase  29.07 
 
 
179 aa  62.4  3e-09  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00450028  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3790  protoporphyrinogen oxidase  25 
 
 
175 aa  62  4e-09  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0962  Protoporphyrinogen oxidase  26.01 
 
 
173 aa  62  4e-09  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4230  protoporphyrinogen oxidase  28.65 
 
 
179 aa  61.6  4e-09  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0023265  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3400  protoporphyrinogen oxidase  26.01 
 
 
173 aa  61.6  5e-09  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0939  protoporphyrinogen oxidase  25.43 
 
 
173 aa  61.6  5e-09  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.031625  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0022  protoporphyrinogen oxidase  27.91 
 
 
184 aa  61.6  5e-09  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00158221  normal  0.0730107 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0026  protoporphyrinogen oxidase  27.17 
 
 
183 aa  61.6  5e-09  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00716362  normal  0.0118461 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0026  Protoporphyrinogen oxidase  27.17 
 
 
183 aa  61.6  5e-09  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  1.81014e-06 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0027  protoporphyrinogen oxidase  27.17 
 
 
183 aa  61.6  5e-09  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0370554  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0022  protoporphyrinogen oxidase  27.17 
 
 
183 aa  60.8  7e-09  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0671098  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0030  protoporphyrinogen oxidase  27.91 
 
 
184 aa  60.8  8e-09  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  2.5966e-05  hitchhiker  9.9426e-07 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0024  protoporphyrinogen oxidase  27.91 
 
 
184 aa  60.8  8e-09  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000372207  hitchhiker  0.000782857 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3038  protoporphyrinogen oxidase  22.54 
 
 
173 aa  60.5  1e-08  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0793  protoporphyrinogen oxidase  25.14 
 
 
173 aa  59.7  2e-08  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4266  protoporphyrinogen oxidase  27.75 
 
 
181 aa  59.7  2e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000166727  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4313  protoporphyrinogen oxidase  27.75 
 
 
181 aa  59.7  2e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  3.09624e-05  normal  0.107941 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4194  protoporphyrinogen oxidase  27.75 
 
 
181 aa  60.1  2e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  2.19448e-06  normal  0.630031 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4217  protoporphyrinogen oxidase  27.75 
 
 
181 aa  59.7  2e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  3.39833e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4373  protoporphyrinogen oxidase  27.75 
 
 
181 aa  59.7  2e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  9.03845e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3066  protoporphyrinogen oxidase  22.54 
 
 
173 aa  59.3  2e-08  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0377442 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0026  protoporphyrinogen oxidase  23.84 
 
 
179 aa  59.7  2e-08  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0906  protoporphyrinogen oxidase  23.12 
 
 
173 aa  59.7  2e-08  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2882  protoporphyrinogen oxidase  25 
 
 
178 aa  60.1  2e-08  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0077  flavodoxin-like protein  26.09 
 
 
160 aa  59.3  2e-08  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0673  protoporphyrinogen oxidase  25.14 
 
 
177 aa  59.3  3e-08  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1569  protoporphyrinogen oxidase  26.38 
 
 
170 aa  58.5  4e-08  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  8.38772e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4255  flavodoxin/nitric oxide synthase  29.59 
 
 
197 aa  58.2  5e-08  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3743  protoporphyrinogen oxidase  27.33 
 
 
179 aa  56.6  2e-07  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  5.14113e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3897  protoporphyrinogen oxidase  27.75 
 
 
179 aa  56.6  2e-07  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0092686  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0813  protoporphyrinogen oxidase  25.58 
 
 
173 aa  56.2  2e-07  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3403  flavodoxin/nitric oxide synthase  28.66 
 
 
193 aa  56.2  2e-07  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.200863  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0678  protoporphyrinogen oxidase  24.71 
 
 
173 aa  55.8  2e-07  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.103464 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0027  protoporphyrinogen oxidase  24.86 
 
 
175 aa  55.8  3e-07  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00412155  normal  0.0535555 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0025  protoporphyrinogen oxidase  23.73 
 
 
175 aa  54.7  6e-07  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00857411 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0023  protoporphyrinogen oxidase  23.7 
 
 
175 aa  54.7  6e-07  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  2.62535e-07  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19080  flavodoxin  24.84 
 
 
159 aa  53.5  1e-06  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0880  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.99 
 
 
158 aa  53.5  1e-06  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0017  protoporphyrinogen oxidase  26.74 
 
 
176 aa  52.8  2e-06  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.229911  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0029  protoporphyrinogen oxidase  23.16 
 
 
179 aa  50.8  9e-06  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00401521  normal  0.0528505 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0017  protoporphyrinogen oxidase  24.26 
 
 
174 aa  50.4  1e-05  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.324297  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1261  flavodoxin/nitric oxide synthase  35.14 
 
 
160 aa  49.3  3e-05  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.46399  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09631  putative protoporphyrinogen oxidase  24.57 
 
 
178 aa  48.5  4e-05  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0198  protoporphyrinogen oxidase  26.01 
 
 
173 aa  48.9  4e-05  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3662  hypothetical protein  26.62 
 
 
140 aa  48.1  5e-05  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.35074  normal  0.580287 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0020  protoporphyrinogen oxidase  22.94 
 
 
174 aa  48.1  5e-05  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000993803  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0024  Protoporphyrinogen oxidase  22.94 
 
 
174 aa  47.8  8e-05  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.776203  hitchhiker  1.79508e-06 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0028  protoporphyrinogen oxidase  22.49 
 
 
174 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  7.80551e-05  hitchhiker  1.45429e-07 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0020  protoporphyrinogen oxidase  22.49 
 
 
174 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  6.64462e-06  normal  0.064653 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0022  protoporphyrinogen oxidase  22.49 
 
 
174 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  5.30188e-08  hitchhiker  0.000763246 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1709  NADPH-dependent FMN reductase  29.1 
 
 
189 aa  46.6  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0120762  normal  0.0625376 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>