106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0962 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0962  Protoporphyrinogen oxidase  100 
 
 		 173 aa  361  3e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0939  protoporphyrinogen oxidase  97.69 
 
 		 173 aa  354  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.031625  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3400  protoporphyrinogen oxidase  97.11 
 
 		 173 aa  352  2e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0973  protoporphyrinogen oxidase  96.53 
 
 		 173 aa  350  5.9999999999999994e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.705197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0871  protoporphyrinogen oxidase  86.13 
 
 		 173 aa  318  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3038  protoporphyrinogen oxidase  84.97 
 
 		 173 aa  314  3e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0906  protoporphyrinogen oxidase  83.82 
 
 		 173 aa  311  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3066  protoporphyrinogen oxidase  83.82 
 
 		 173 aa  311  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0377442 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3720  hypothetical protein  87.23 
 
 		 141 aa  268  4e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0678  protoporphyrinogen oxidase  67.06 
 
 		 173 aa  249  1e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.103464 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0813  protoporphyrinogen oxidase  67.63 
 
 		 173 aa  246  9e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0793  protoporphyrinogen oxidase  60.82 
 
 		 173 aa  235  3e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2882  protoporphyrinogen oxidase  61.18 
 
 		 178 aa  233  7e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3790  protoporphyrinogen oxidase  63.16 
 
 		 175 aa  233  8e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0673  protoporphyrinogen oxidase  62.21 
 
 		 177 aa  225  3e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0025  protoporphyrinogen oxidase  52.35 
 
 		 174 aa  192  3e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0214113  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0024  protoporphyrinogen oxidase  53.22 
 
 		 174 aa  191  3e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0780321  normal  0.0115046 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0025  protoporphyrinogen oxidase  51.76 
 
 		 175 aa  191  4e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00857411 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0023  protoporphyrinogen oxidase  51.18 
 
 		 175 aa  190  8e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000262535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0036  protoporphyrinogen oxidase  53.89 
 
 		 177 aa  190  1e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.144256 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0020  protoporphyrinogen oxidase  52.63 
 
 		 174 aa  189  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000993803  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0024  Protoporphyrinogen oxidase  52.69 
 
 		 174 aa  189  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.776203  hitchhiker  0.00000179508 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0028  protoporphyrinogen oxidase  52.63 
 
 		 174 aa  186  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000780551  hitchhiker  0.000000145429 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0022  protoporphyrinogen oxidase  54.22 
 
 		 174 aa  186  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000530188  hitchhiker  0.000763246 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0020  protoporphyrinogen oxidase  54.22 
 
 		 174 aa  186  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000664462  normal  0.064653 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0017  protoporphyrinogen oxidase  53.94 
 
 		 174 aa  186  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.324297  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0027  protoporphyrinogen oxidase  52.63 
 
 		 175 aa  184  5e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00412155  normal  0.0535555 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0017  protoporphyrinogen oxidase  50.58 
 
 		 176 aa  183  9e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.229911  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4072  protoporphyrinogen oxidase  50 
 
 		 176 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0022  protoporphyrinogen oxidase  50.59 
 
 		 175 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0025  flavodoxin  50.59 
 
 		 174 aa  181  6e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2953  protoporphyrinogen oxidase  48.84 
 
 		 175 aa  178  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.410486 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0019  protoporphyrinogen oxidase  47.34 
 
 		 175 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1487  protoporphyrinogen oxidase  47.09 
 
 		 175 aa  168  4e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.040472  hitchhiker  0.00766519 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0141  Protoporphyrinogen oxidase  43.53 
 
 		 173 aa  167  8e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2537  protoporphyrinogen oxidase  45.29 
 
 		 174 aa  157  9e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000581009  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0287  protoporphyrinogen oxidase  45.61 
 
 		 177 aa  152  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000232863  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1916  protoporphyrinogen oxidase  45.61 
 
 		 177 aa  152  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000017226  normal  0.191063 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3929  protoporphyrinogen oxidase  45.61 
 
 		 177 aa  152  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.00000000000339774  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4230  protoporphyrinogen oxidase  45.51 
 
 		 179 aa  150  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0023265  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1569  protoporphyrinogen oxidase  44.44 
 
 		 170 aa  149  2e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000838772  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3897  protoporphyrinogen oxidase  44.31 
 
 		 179 aa  148  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0092686  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4040  protoporphyrinogen oxidase  45.51 
 
 		 179 aa  148  4e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00450028  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00463  protoporphyrinogen oxidase  43.6 
 
 		 175 aa  147  5e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4320  protoporphyrinogen oxidase  42.35 
 
 		 181 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000364139  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3743  protoporphyrinogen oxidase  44.31 
 
 		 179 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000514113  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03741  protoporphyrin oxidase, flavoprotein  42.35 
 
 		 181 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00160389  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4131  Protoporphyrinogen oxidase  42.35 
 
 		 181 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000348526  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4073  protoporphyrinogen oxidase  42.35 
 
 		 181 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000311087  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4369  protoporphyrinogen oxidase  42.35 
 
 		 181 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000843735  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4160  protoporphyrinogen oxidase  42.35 
 
 		 181 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000131743  decreased coverage  0.00000239257 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4231  protoporphyrinogen oxidase  42.35 
 
 		 181 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000133684  normal  0.0229749 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5289  protoporphyrinogen oxidase  42.35 
 
 		 181 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000241436  normal  0.0811334 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03690  hypothetical protein  42.35 
 
 		 181 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000962205  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3945  protoporphyrinogen oxidase  43.53 
 
 		 180 aa  145  4.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000851494  decreased coverage  0.00158179 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2977  protoporphyrinogen oxidase  41.14 
 
 		 174 aa  144  6e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4266  protoporphyrinogen oxidase  41.18 
 
 		 181 aa  141  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000166727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4313  protoporphyrinogen oxidase  41.18 
 
 		 181 aa  141  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000309624  normal  0.107941 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4217  protoporphyrinogen oxidase  41.18 
 
 		 181 aa  141  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000339833  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4373  protoporphyrinogen oxidase  41.18 
 
 		 181 aa  141  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0000903845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0029  protoporphyrinogen oxidase  37.36 
 
 		 179 aa  140  6e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00401521  normal  0.0528505 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001985  protoporphyrinogen IX oxidase oxygen-independent HemG  41.86 
 
 		 175 aa  140  6e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000384734  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09631  putative protoporphyrinogen oxidase  38.6 
 
 		 178 aa  140  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4194  protoporphyrinogen oxidase  40.59 
 
 		 181 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000219448  normal  0.630031 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0266  protoporphyrinogen oxidase  42.01 
 
 		 177 aa  139  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0106275  normal  0.013044 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0026  protoporphyrinogen oxidase  36.78 
 
 		 179 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0024  protoporphyrinogen oxidase  37.93 
 
 		 184 aa  136  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000372207  hitchhiker  0.000782857 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0022  protoporphyrinogen oxidase  37.93 
 
 		 184 aa  137  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00158221  normal  0.0730107 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0030  protoporphyrinogen oxidase  37.93 
 
 		 184 aa  136  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000025966  hitchhiker  0.00000099426 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0027  protoporphyrinogen oxidase, putative  37.36 
 
 		 184 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0038  protoporphyrinogen oxidase  36.47 
 
 		 183 aa  134  9e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.142009 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0027  protoporphyrinogen oxidase  36.78 
 
 		 183 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0370554  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0022  protoporphyrinogen oxidase  36.78 
 
 		 183 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0671098  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0026  protoporphyrinogen oxidase  36.78 
 
 		 183 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00716362  normal  0.0118461 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0026  Protoporphyrinogen oxidase  36.78 
 
 		 183 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000181014 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0025  protoporphyrinogen oxidase  36.05 
 
 		 177 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00109828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0027  protoporphyrinogen oxidase  34.09 
 
 		 179 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0184042 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0019  protoporphyrinogen oxidase  35.63 
 
 		 184 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.309289  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0019  protoporphyrinogen oxidase  34.48 
 
 		 181 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.827877  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0198  protoporphyrinogen oxidase  38.69 
 
 		 173 aa  120  9e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4324  protoporphyrinogen oxidase  34.12 
 
 		 190 aa  109  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4255  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.91 
 
 		 197 aa  108  5e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3403  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.98 
 
 		 193 aa  97.8  6e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.200863  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1035  protoporphyrinogen oxidase  30.51 
 
 		 188 aa  94.4  8e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.395736  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3601  protoporphyrinogen oxidase  35.06 
 
 		 174 aa  94  9e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.934061  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3336  protoporphyrinogen oxidase  32.37 
 
 		 178 aa  89.4  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2492  flavodoxin-like protein  26.47 
 
 		 215 aa  64.7  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1824  flavodoxin  26.01 
 
 		 168 aa  62  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1685  flavodoxin  26.63 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0906832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03990  Flavodoxin  25.29 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000376234  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4171  flavodoxin-like protein  24.48 
 
 		 216 aa  51.6  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0077  flavodoxin-like protein  24.32 
 
 		 160 aa  51.2  0.000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2648  flavodoxin/nitric oxide synthase  35.56 
 
 		 144 aa  50.8  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000348313  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00340  flavodoxin  24.56 
 
 		 164 aa  49.3  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0573  protoporphyrinogen oxidase  28.3 
 
 		 167 aa  48.9  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00307777 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2562  Flavodoxin-like protein  20.93 
 
 		 179 aa  48.5  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3023  flavodoxin  32.56 
 
 		 170 aa  46.2  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2314  flavodoxin-like  20.96 
 
 		 170 aa  46.6  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0403811  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0562  hypothetical protein  21.64 
 
 		 205 aa  46.6  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.916789  normal  0.708771 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0610  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  23.26 
 
 		 323 aa  45.4  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.828743  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>