96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2554 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2554  Flavodoxin-like protein  100 
 
 
169 aa  337  5e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2108  flavodoxin-like protein  47.24 
 
 
167 aa  140  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0677138  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0573  protoporphyrinogen oxidase  43.11 
 
 
167 aa  125  3e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00307777 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29950  hypothetical protein  46.15 
 
 
164 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.641113 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1824  flavodoxin  35.37 
 
 
168 aa  111  6e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2409  protoporphyrinogen oxidase  40.49 
 
 
181 aa  108  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0136205  normal  0.0149961 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2438  Flavodoxin-like protein  42.69 
 
 
174 aa  99.8  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000794828  normal  0.0165675 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1685  flavodoxin  33.33 
 
 
172 aa  99.4  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0906832  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1410  Flavodoxin-like protein  31.71 
 
 
175 aa  99.4  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00810371 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3245  flavodoxin-like protein  34.64 
 
 
176 aa  98.2  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3023  flavodoxin  39.39 
 
 
170 aa  96.7  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2314  flavodoxin-like  37.28 
 
 
170 aa  96.3  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0403811  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2562  Flavodoxin-like protein  35.12 
 
 
179 aa  89.7  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4171  flavodoxin-like protein  32.3 
 
 
216 aa  86.3  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1632  flavodoxin-like protein  33.53 
 
 
193 aa  85.5  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.138919  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0168  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.33 
 
 
174 aa  83.2  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607551  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00340  flavodoxin  34.59 
 
 
164 aa  81.3  0.000000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2492  flavodoxin-like protein  30.97 
 
 
215 aa  74.3  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2375  flavodoxin  36.14 
 
 
173 aa  73.6  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.185264  normal  0.024568 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1699  flavodoxin  29.41 
 
 
176 aa  70.9  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.35306  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4320  protoporphyrinogen oxidase  26.74 
 
 
181 aa  69.3  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000364139  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4369  protoporphyrinogen oxidase  26.74 
 
 
181 aa  68.9  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000843735  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0025  protoporphyrinogen oxidase  29.31 
 
 
177 aa  67.8  0.00000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00109828  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4131  Protoporphyrinogen oxidase  26.16 
 
 
181 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000348526  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03690  hypothetical protein  26.16 
 
 
181 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000962205  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5289  protoporphyrinogen oxidase  26.16 
 
 
181 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000241436  normal  0.0811334 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4231  protoporphyrinogen oxidase  26.16 
 
 
181 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000133684  normal  0.0229749 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4160  protoporphyrinogen oxidase  26.16 
 
 
181 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000131743  decreased coverage  0.00000239257 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03741  protoporphyrin oxidase, flavoprotein  26.16 
 
 
181 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00160389  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4073  protoporphyrinogen oxidase  26.16 
 
 
181 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000311087  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3662  hypothetical protein  34.09 
 
 
140 aa  64.3  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.35074  normal  0.580287 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19080  flavodoxin  32.72 
 
 
159 aa  62.8  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3945  protoporphyrinogen oxidase  26.16 
 
 
180 aa  60.8  0.000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000851494  decreased coverage  0.00158179 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4230  protoporphyrinogen oxidase  25.58 
 
 
179 aa  59.7  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0023265  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0029  protoporphyrinogen oxidase  26.01 
 
 
179 aa  58.2  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00401521  normal  0.0528505 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0026  protoporphyrinogen oxidase  25.43 
 
 
179 aa  57.4  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0141  Protoporphyrinogen oxidase  26.79 
 
 
173 aa  57.4  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1916  protoporphyrinogen oxidase  24.69 
 
 
177 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000017226  normal  0.191063 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3929  protoporphyrinogen oxidase  24.69 
 
 
177 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.00000000000339774  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4266  protoporphyrinogen oxidase  26.01 
 
 
181 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000166727  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4313  protoporphyrinogen oxidase  26.01 
 
 
181 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000309624  normal  0.107941 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4194  protoporphyrinogen oxidase  26.01 
 
 
181 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000219448  normal  0.630031 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0287  protoporphyrinogen oxidase  24.69 
 
 
177 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000232863  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4217  protoporphyrinogen oxidase  26.01 
 
 
181 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000339833  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4373  protoporphyrinogen oxidase  26.01 
 
 
181 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0000903845  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4040  protoporphyrinogen oxidase  30.85 
 
 
179 aa  55.8  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00450028  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0027  protoporphyrinogen oxidase  25.6 
 
 
179 aa  54.7  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0184042 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3790  protoporphyrinogen oxidase  22.86 
 
 
175 aa  54.3  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0871  protoporphyrinogen oxidase  21.43 
 
 
173 aa  54.3  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0019  protoporphyrinogen oxidase  23.53 
 
 
184 aa  53.5  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.309289  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3066  protoporphyrinogen oxidase  22.01 
 
 
173 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0377442 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3038  protoporphyrinogen oxidase  21.43 
 
 
173 aa  53.9  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3897  protoporphyrinogen oxidase  31.91 
 
 
179 aa  53.1  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0092686  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0673  protoporphyrinogen oxidase  26.04 
 
 
177 aa  52.8  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0906  protoporphyrinogen oxidase  21.38 
 
 
173 aa  52.4  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0030  protoporphyrinogen oxidase  22.41 
 
 
184 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000025966  hitchhiker  0.00000099426 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0077  flavodoxin-like protein  23.08 
 
 
160 aa  52  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0185  hypothetical protein  28.38 
 
 
335 aa  51.6  0.000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.533354  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0024  protoporphyrinogen oxidase  22.41 
 
 
184 aa  51.2  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000372207  hitchhiker  0.000782857 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0022  protoporphyrinogen oxidase  22.41 
 
 
184 aa  51.2  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00158221  normal  0.0730107 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0024  Protoporphyrinogen oxidase  24.54 
 
 
174 aa  51.2  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.776203  hitchhiker  0.00000179508 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0020  protoporphyrinogen oxidase  23.46 
 
 
174 aa  51.2  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000993803  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0027  protoporphyrinogen oxidase, putative  21.84 
 
 
184 aa  50.8  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3601  protoporphyrinogen oxidase  31.76 
 
 
174 aa  50.8  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.934061  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0793  protoporphyrinogen oxidase  21.32 
 
 
173 aa  50.8  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0023  protoporphyrinogen oxidase  20.93 
 
 
175 aa  50.4  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000262535  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0026  Protoporphyrinogen oxidase  23.08 
 
 
183 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000181014 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3607  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.68 
 
 
156 aa  50.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0025  protoporphyrinogen oxidase  23.93 
 
 
174 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0214113  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0027  protoporphyrinogen oxidase  23.08 
 
 
183 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0370554  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0024  protoporphyrinogen oxidase  22.84 
 
 
174 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0780321  normal  0.0115046 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0026  protoporphyrinogen oxidase  23.08 
 
 
183 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00716362  normal  0.0118461 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4324  protoporphyrinogen oxidase  25.41 
 
 
190 aa  50.1  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0022  protoporphyrinogen oxidase  23.08 
 
 
183 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0671098  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0880  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.56 
 
 
158 aa  48.9  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3743  protoporphyrinogen oxidase  29.79 
 
 
179 aa  49.3  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000514113  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0017  protoporphyrinogen oxidase  23.74 
 
 
174 aa  48.1  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.324297  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1035  protoporphyrinogen oxidase  25.41 
 
 
188 aa  47.4  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.395736  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03990  Flavodoxin  24.68 
 
 
159 aa  46.2  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000376234  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2953  protoporphyrinogen oxidase  21.05 
 
 
175 aa  46.2  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.410486 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4072  protoporphyrinogen oxidase  21.08 
 
 
176 aa  45.4  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0678  protoporphyrinogen oxidase  19.53 
 
 
173 aa  45.8  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.103464 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3403  flavodoxin/nitric oxide synthase  28.12 
 
 
193 aa  45.4  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.200863  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1106  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.68 
 
 
156 aa  45.1  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.796872  normal  0.0316992 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1261  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.14 
 
 
160 aa  44.7  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.46399  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1487  protoporphyrinogen oxidase  16.96 
 
 
175 aa  44.3  0.0009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.040472  hitchhiker  0.00766519 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0589  flavodoxin family protein  29.06 
 
 
166 aa  43.5  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2882  protoporphyrinogen oxidase  21.05 
 
 
178 aa  43.5  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0999  hypothetical protein  27.01 
 
 
175 aa  42.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000710305  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1177  flavodoxin family protein  29.06 
 
 
167 aa  43.1  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.392318  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1205  flavodoxin family protein  33.68 
 
 
157 aa  43.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0038  protoporphyrinogen oxidase  22.81 
 
 
183 aa  42.4  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.142009 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2977  protoporphyrinogen oxidase  21.97 
 
 
174 aa  42  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2648  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.33 
 
 
144 aa  41.6  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000348313  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3336  protoporphyrinogen oxidase  27.06 
 
 
178 aa  41.6  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0340  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.99 
 
 
151 aa  41.6  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.687368 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>