26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2375 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2375  flavodoxin  100 
 
 
173 aa  331  3e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.185264  normal  0.024568 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2409  protoporphyrinogen oxidase  39.18 
 
 
181 aa  80.5  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0136205  normal  0.0149961 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2554  Flavodoxin-like protein  35.58 
 
 
169 aa  78.2  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0573  protoporphyrinogen oxidase  33.33 
 
 
167 aa  75.5  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00307777 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29950  hypothetical protein  37.35 
 
 
164 aa  73.2  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.641113 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1824  flavodoxin  30.64 
 
 
168 aa  72.4  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3023  flavodoxin  34.3 
 
 
170 aa  67.4  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2108  flavodoxin-like protein  33.88 
 
 
167 aa  63.9  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0677138  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2314  flavodoxin-like  34.88 
 
 
170 aa  61.2  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0403811  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4171  flavodoxin-like protein  29.27 
 
 
216 aa  54.7  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1410  Flavodoxin-like protein  23.53 
 
 
175 aa  54.3  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00810371 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1035  protoporphyrinogen oxidase  27.01 
 
 
188 aa  52.8  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.395736  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4324  protoporphyrinogen oxidase  27.53 
 
 
190 aa  51.6  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1699  flavodoxin  28 
 
 
176 aa  51.6  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.35306  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2492  flavodoxin-like protein  31.36 
 
 
215 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1685  flavodoxin  24.71 
 
 
172 aa  49.7  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0906832  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4255  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.61 
 
 
197 aa  46.2  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3403  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.7 
 
 
193 aa  45.8  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.200863  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0168  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.91 
 
 
174 aa  45.4  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607551  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2438  Flavodoxin-like protein  30.39 
 
 
174 aa  45.1  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000794828  normal  0.0165675 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2562  Flavodoxin-like protein  28.65 
 
 
179 aa  44.3  0.0009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0871  protoporphyrinogen oxidase  20.35 
 
 
173 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3066  protoporphyrinogen oxidase  20.93 
 
 
173 aa  42  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0377442 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0906  protoporphyrinogen oxidase  21.51 
 
 
173 aa  42  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0678  protoporphyrinogen oxidase  20.57 
 
 
173 aa  42  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.103464 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19080  flavodoxin  29.09 
 
 
159 aa  40.8  0.01  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>