29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3662 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3662  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  276  5e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.35074  normal  0.580287 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2438  Flavodoxin-like protein  35.71 
 
 
174 aa  74.3  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000794828  normal  0.0165675 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2554  Flavodoxin-like protein  34.09 
 
 
169 aa  64.3  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2409  protoporphyrinogen oxidase  34.06 
 
 
181 aa  63.2  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0136205  normal  0.0149961 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1685  flavodoxin  32.58 
 
 
172 aa  61.2  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0906832  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2314  flavodoxin-like  32.62 
 
 
170 aa  60.8  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0403811  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2108  flavodoxin-like protein  35.77 
 
 
167 aa  60.1  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0677138  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29950  hypothetical protein  33.83 
 
 
164 aa  58.5  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.641113 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1410  Flavodoxin-like protein  24.34 
 
 
175 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00810371 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0573  protoporphyrinogen oxidase  34.17 
 
 
167 aa  53.1  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00307777 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2492  flavodoxin-like protein  29.29 
 
 
215 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4171  flavodoxin-like protein  29.85 
 
 
216 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3023  flavodoxin  30 
 
 
170 aa  49.3  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1632  flavodoxin-like protein  30.61 
 
 
193 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.138919  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1824  flavodoxin  26.62 
 
 
168 aa  48.1  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0678  protoporphyrinogen oxidase  23.97 
 
 
173 aa  45.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.103464 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3245  flavodoxin-like protein  29.05 
 
 
176 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0871  protoporphyrinogen oxidase  21.53 
 
 
173 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2562  Flavodoxin-like protein  26.17 
 
 
179 aa  44.3  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2953  protoporphyrinogen oxidase  27.84 
 
 
175 aa  43.9  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.410486 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0017  protoporphyrinogen oxidase  27.03 
 
 
174 aa  43.9  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.324297  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0141  Protoporphyrinogen oxidase  25.85 
 
 
173 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0027  protoporphyrinogen oxidase  20.98 
 
 
175 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00412155  normal  0.0535555 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1487  protoporphyrinogen oxidase  23.28 
 
 
175 aa  42.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.040472  hitchhiker  0.00766519 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3038  protoporphyrinogen oxidase  20.83 
 
 
173 aa  42.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4072  protoporphyrinogen oxidase  23.08 
 
 
176 aa  41.6  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0906  protoporphyrinogen oxidase  23.01 
 
 
173 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3066  protoporphyrinogen oxidase  22.12 
 
 
173 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0377442 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0017  protoporphyrinogen oxidase  25 
 
 
176 aa  40.8  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.229911  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>