61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_3023 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_3023  flavodoxin  100 
 
 		 170 aa  340  8e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1632  flavodoxin-like protein  38.86 
 
 		 193 aa  119  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.138919  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2554  Flavodoxin-like protein  39.39 
 
 		 169 aa  96.7  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2314  flavodoxin-like  35.84 
 
 		 170 aa  95.9  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0403811  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1824  flavodoxin  32.57 
 
 		 168 aa  90.1  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0573  protoporphyrinogen oxidase  38.24 
 
 		 167 aa  87.8  7e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00307777 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2108  flavodoxin-like protein  35.71 
 
 		 167 aa  87  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0677138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1410  Flavodoxin-like protein  32.93 
 
 		 175 aa  85.9  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00810371 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29950  hypothetical protein  38.65 
 
 		 164 aa  86.3  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.641113 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3245  flavodoxin-like protein  37.14 
 
 		 176 aa  85.1  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2409  protoporphyrinogen oxidase  37.35 
 
 		 181 aa  81.6  0.000000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0136205  normal  0.0149961 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4171  flavodoxin-like protein  32.12 
 
 		 216 aa  77.8  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1685  flavodoxin  31.93 
 
 		 172 aa  75.5  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0906832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2438  Flavodoxin-like protein  36.26 
 
 		 174 aa  72  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000794828  normal  0.0165675 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1035  protoporphyrinogen oxidase  32.6 
 
 		 188 aa  70.9  0.000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.395736  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2492  flavodoxin-like protein  31.06 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2562  Flavodoxin-like protein  29.82 
 
 		 179 aa  68.2  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1699  flavodoxin  27.49 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.35306  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0168  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.53 
 
 		 174 aa  63.9  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607551  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2375  flavodoxin  33.72 
 
 		 173 aa  62.4  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.185264  normal  0.024568 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00340  flavodoxin  29.44 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3336  protoporphyrinogen oxidase  29.55 
 
 		 178 aa  57.8  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3601  protoporphyrinogen oxidase  29.93 
 
 		 174 aa  57  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.934061  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1487  protoporphyrinogen oxidase  21.35 
 
 		 175 aa  52  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.040472  hitchhiker  0.00766519 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2953  protoporphyrinogen oxidase  31.82 
 
 		 175 aa  52  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.410486 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0871  protoporphyrinogen oxidase  25 
 
 		 173 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19080  flavodoxin  27.44 
 
 		 159 aa  50.1  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3066  protoporphyrinogen oxidase  31.03 
 
 		 173 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0377442 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3662  hypothetical protein  30 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.35074  normal  0.580287 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2882  protoporphyrinogen oxidase  25.29 
 
 		 178 aa  48.9  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3403  flavodoxin/nitric oxide synthase  29.55 
 
 		 193 aa  48.9  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.200863  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3790  protoporphyrinogen oxidase  31.4 
 
 		 175 aa  48.1  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0077  flavodoxin-like protein  24.71 
 
 		 160 aa  48.1  0.00006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0906  protoporphyrinogen oxidase  28.74 
 
 		 173 aa  48.1  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3038  protoporphyrinogen oxidase  24.44 
 
 		 173 aa  47.8  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0673  protoporphyrinogen oxidase  32.56 
 
 		 177 aa  47.8  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0939  protoporphyrinogen oxidase  32.56 
 
 		 173 aa  47.8  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.031625  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4255  flavodoxin/nitric oxide synthase  28.57 
 
 		 197 aa  47.4  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0973  protoporphyrinogen oxidase  32.56 
 
 		 173 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.705197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0793  protoporphyrinogen oxidase  32.18 
 
 		 173 aa  47  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0962  Protoporphyrinogen oxidase  32.56 
 
 		 173 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4324  protoporphyrinogen oxidase  25.99 
 
 		 190 aa  46.2  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0017  protoporphyrinogen oxidase  25.7 
 
 		 176 aa  46.2  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.229911  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0678  protoporphyrinogen oxidase  24.73 
 
 		 173 aa  46.2  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.103464 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3400  protoporphyrinogen oxidase  26.67 
 
 		 173 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03990  Flavodoxin  32.14 
 
 		 159 aa  44.3  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000376234  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3250  flavodoxin  38.2 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000245665  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0198  protoporphyrinogen oxidase  23.53 
 
 		 173 aa  43.9  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3596  flavodoxin  38.2 
 
 		 147 aa  42.4  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000203482  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3300  flavodoxin  38.2 
 
 		 147 aa  42.4  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.31078e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0019  protoporphyrinogen oxidase  24.32 
 
 		 181 aa  42.4  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.827877  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3550  flavodoxin  38.2 
 
 		 147 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.52439e-45 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3335  flavodoxin  38.2 
 
 		 147 aa  42.4  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000659666  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0813  protoporphyrinogen oxidase  25 
 
 		 173 aa  41.6  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0141  Protoporphyrinogen oxidase  24.71 
 
 		 173 aa  41.6  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0019  protoporphyrinogen oxidase  23.89 
 
 		 175 aa  41.6  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3945  protoporphyrinogen oxidase  24.48 
 
 		 180 aa  41.2  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000851494  decreased coverage  0.00158179 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1668  flavodoxin  37.08 
 
 		 147 aa  41.2  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000400583  hitchhiker  1.50261e-20 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3559  flavodoxin  37.08 
 
 		 147 aa  40.8  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000105724  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1106  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.17 
 
 		 156 aa  41.2  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.796872  normal  0.0316992 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3244  flavodoxin  35.96 
 
 		 147 aa  40.8  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000023193  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>