27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2409 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2409  protoporphyrinogen oxidase  100 
 
 
181 aa  355  1.9999999999999998e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0136205  normal  0.0149961 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0573  protoporphyrinogen oxidase  49.38 
 
 
167 aa  146  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00307777 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29950  hypothetical protein  47.8 
 
 
164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.641113 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2108  flavodoxin-like protein  45 
 
 
167 aa  125  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0677138  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2554  Flavodoxin-like protein  40.49 
 
 
169 aa  108  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2314  flavodoxin-like  36.75 
 
 
170 aa  89  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0403811  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1632  flavodoxin-like protein  37.28 
 
 
193 aa  87.8  7e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.138919  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1824  flavodoxin  32.91 
 
 
168 aa  83.6  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1410  Flavodoxin-like protein  28.57 
 
 
175 aa  83.2  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00810371 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3023  flavodoxin  37.35 
 
 
170 aa  81.6  0.000000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2375  flavodoxin  39.18 
 
 
173 aa  77.8  0.00000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.185264  normal  0.024568 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2492  flavodoxin-like protein  34.18 
 
 
215 aa  72.8  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4171  flavodoxin-like protein  34.19 
 
 
216 aa  72  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1685  flavodoxin  28.4 
 
 
172 aa  71.6  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0906832  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2562  Flavodoxin-like protein  31.1 
 
 
179 aa  70.5  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1699  flavodoxin  31.36 
 
 
176 aa  69.7  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.35306  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2438  Flavodoxin-like protein  33.72 
 
 
174 aa  66.2  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000794828  normal  0.0165675 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0168  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.54 
 
 
174 aa  63.9  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607551  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3662  hypothetical protein  34.06 
 
 
140 aa  63.2  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.35074  normal  0.580287 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3245  flavodoxin-like protein  32.39 
 
 
176 aa  62.8  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00340  flavodoxin  33.74 
 
 
164 aa  57  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4324  protoporphyrinogen oxidase  27.59 
 
 
190 aa  45.8  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0266  protoporphyrinogen oxidase  28.57 
 
 
177 aa  43.5  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0106275  normal  0.013044 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0476  flavodoxin  28.74 
 
 
160 aa  42.7  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0539  flavodoxin  28.14 
 
 
160 aa  42  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3945  protoporphyrinogen oxidase  25.97 
 
 
180 aa  41.2  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000851494  decreased coverage  0.00158179 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0141  Protoporphyrinogen oxidase  27.34 
 
 
173 aa  40.8  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>