60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2314 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2314  flavodoxin-like  100 
 
 
170 aa  332  1e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0403811  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3245  flavodoxin-like protein  37.5 
 
 
176 aa  111  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2554  Flavodoxin-like protein  37.28 
 
 
169 aa  96.3  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3023  flavodoxin  35.84 
 
 
170 aa  95.9  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1410  Flavodoxin-like protein  32.16 
 
 
175 aa  92.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00810371 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2108  flavodoxin-like protein  37.8 
 
 
167 aa  89.7  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0677138  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2409  protoporphyrinogen oxidase  36.75 
 
 
181 aa  89  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0136205  normal  0.0149961 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0573  protoporphyrinogen oxidase  38.69 
 
 
167 aa  86.7  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00307777 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2438  Flavodoxin-like protein  37.65 
 
 
174 aa  82  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000794828  normal  0.0165675 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29950  hypothetical protein  38.89 
 
 
164 aa  81.3  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.641113 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1632  flavodoxin-like protein  33.14 
 
 
193 aa  80.1  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.138919  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1824  flavodoxin  28.57 
 
 
168 aa  80.1  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4171  flavodoxin-like protein  34.16 
 
 
216 aa  79.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2492  flavodoxin-like protein  31.06 
 
 
215 aa  71.2  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2562  Flavodoxin-like protein  29.59 
 
 
179 aa  68.6  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1699  flavodoxin  26.74 
 
 
176 aa  68.2  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.35306  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1685  flavodoxin  27.06 
 
 
172 aa  64.7  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0906832  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0141  Protoporphyrinogen oxidase  28.98 
 
 
173 aa  63.9  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3662  hypothetical protein  32.62 
 
 
140 aa  60.8  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.35074  normal  0.580287 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2375  flavodoxin  34.3 
 
 
173 aa  59.7  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.185264  normal  0.024568 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0168  flavodoxin/nitric oxide synthase  28.82 
 
 
174 aa  56.2  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607551  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19080  flavodoxin  29.82 
 
 
159 aa  55.8  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3038  protoporphyrinogen oxidase  22.02 
 
 
173 aa  51.2  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4324  protoporphyrinogen oxidase  26.7 
 
 
190 aa  51.2  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0906  protoporphyrinogen oxidase  23.21 
 
 
173 aa  50.8  0.000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1035  protoporphyrinogen oxidase  27.22 
 
 
188 aa  50.8  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.395736  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0077  flavodoxin-like protein  17.99 
 
 
160 aa  50.1  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3066  protoporphyrinogen oxidase  22.62 
 
 
173 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0377442 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00340  flavodoxin  30.36 
 
 
164 aa  49.7  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0871  protoporphyrinogen oxidase  22.02 
 
 
173 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0185  hypothetical protein  31.25 
 
 
335 aa  48.5  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.533354  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0939  protoporphyrinogen oxidase  21.56 
 
 
173 aa  48.1  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.031625  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3667  flavodoxin, short chain  32.97 
 
 
148 aa  46.6  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0962  Protoporphyrinogen oxidase  20.96 
 
 
173 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4320  protoporphyrinogen oxidase  22.22 
 
 
181 aa  45.4  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000364139  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2882  protoporphyrinogen oxidase  22.99 
 
 
178 aa  45.4  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0017  protoporphyrinogen oxidase  21.59 
 
 
176 aa  45.4  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.229911  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3945  protoporphyrinogen oxidase  26.81 
 
 
180 aa  44.7  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000851494  decreased coverage  0.00158179 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0025  protoporphyrinogen oxidase  31.52 
 
 
177 aa  44.7  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00109828  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4131  Protoporphyrinogen oxidase  22.22 
 
 
181 aa  43.5  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000348526  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03690  hypothetical protein  22.22 
 
 
181 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000962205  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3743  protoporphyrinogen oxidase  31.87 
 
 
179 aa  43.5  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000514113  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03741  protoporphyrin oxidase, flavoprotein  22.22 
 
 
181 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00160389  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4073  protoporphyrinogen oxidase  22.22 
 
 
181 aa  43.5  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000311087  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4369  protoporphyrinogen oxidase  22.22 
 
 
181 aa  44.3  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000843735  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4160  protoporphyrinogen oxidase  22.22 
 
 
181 aa  43.5  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000131743  decreased coverage  0.00000239257 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5289  protoporphyrinogen oxidase  22.22 
 
 
181 aa  43.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000241436  normal  0.0811334 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4231  protoporphyrinogen oxidase  22.22 
 
 
181 aa  43.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000133684  normal  0.0229749 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0027  protoporphyrinogen oxidase  30.21 
 
 
179 aa  43.5  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0184042 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4194  protoporphyrinogen oxidase  23.84 
 
 
181 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000219448  normal  0.630031 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1569  protoporphyrinogen oxidase  19.89 
 
 
170 aa  42.7  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000838772  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4266  protoporphyrinogen oxidase  23.84 
 
 
181 aa  41.6  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000166727  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4313  protoporphyrinogen oxidase  23.84 
 
 
181 aa  41.6  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000309624  normal  0.107941 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4217  protoporphyrinogen oxidase  23.84 
 
 
181 aa  41.6  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000339833  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0266  protoporphyrinogen oxidase  23.39 
 
 
177 aa  41.6  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0106275  normal  0.013044 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4373  protoporphyrinogen oxidase  23.84 
 
 
181 aa  41.6  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0000903845  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0527  flavodoxin family protein  31.76 
 
 
180 aa  41.2  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2977  protoporphyrinogen oxidase  22.73 
 
 
174 aa  41.2  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0610  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  27.42 
 
 
323 aa  41.2  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.828743  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0855  hypothetical protein  20.65 
 
 
237 aa  40.8  0.009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.110269  normal  0.850819 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>