120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0077 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_0077  flavodoxin-like protein  100 
 
 		 160 aa  317  6e-86  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03990  Flavodoxin  38.46 
 
 		 159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000376234  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03741  protoporphyrin oxidase, flavoprotein  22.78 
 
 		 181 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00160389  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4131  Protoporphyrinogen oxidase  22.78 
 
 		 181 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000348526  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03690  hypothetical protein  22.78 
 
 		 181 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000962205  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4073  protoporphyrinogen oxidase  22.78 
 
 		 181 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000311087  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4160  protoporphyrinogen oxidase  22.78 
 
 		 181 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000131743  decreased coverage  0.00000239257 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5289  protoporphyrinogen oxidase  22.78 
 
 		 181 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000241436  normal  0.0811334 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4369  protoporphyrinogen oxidase  22.78 
 
 		 181 aa  74.3  0.0000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000843735  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4231  protoporphyrinogen oxidase  22.15 
 
 		 181 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000133684  normal  0.0229749 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3945  protoporphyrinogen oxidase  24.68 
 
 		 180 aa  71.6  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000851494  decreased coverage  0.00158179 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4320  protoporphyrinogen oxidase  22.15 
 
 		 181 aa  71.6  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000364139  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3897  protoporphyrinogen oxidase  26.28 
 
 		 179 aa  70.9  0.000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0092686  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4266  protoporphyrinogen oxidase  22.15 
 
 		 181 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000166727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4313  protoporphyrinogen oxidase  22.15 
 
 		 181 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000309624  normal  0.107941 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4194  protoporphyrinogen oxidase  22.15 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000219448  normal  0.630031 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4217  protoporphyrinogen oxidase  22.15 
 
 		 181 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000339833  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4373  protoporphyrinogen oxidase  22.15 
 
 		 181 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0000903845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00463  protoporphyrinogen oxidase  21.79 
 
 		 175 aa  68.2  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1569  protoporphyrinogen oxidase  26.32 
 
 		 170 aa  67.8  0.00000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000838772  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001985  protoporphyrinogen IX oxidase oxygen-independent HemG  21.79 
 
 		 175 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000384734  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4230  protoporphyrinogen oxidase  25 
 
 		 179 aa  66.6  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0023265  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3743  protoporphyrinogen oxidase  25 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000514113  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1035  protoporphyrinogen oxidase  24.84 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.395736  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4040  protoporphyrinogen oxidase  24.36 
 
 		 179 aa  62.4  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00450028  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3601  protoporphyrinogen oxidase  21.08 
 
 		 174 aa  62.8  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.934061  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3336  protoporphyrinogen oxidase  22.89 
 
 		 178 aa  62.8  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0287  protoporphyrinogen oxidase  21.39 
 
 		 177 aa  62  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000232863  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0266  protoporphyrinogen oxidase  21.94 
 
 		 177 aa  62  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0106275  normal  0.013044 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1916  protoporphyrinogen oxidase  21.39 
 
 		 177 aa  62  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000017226  normal  0.191063 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3929  protoporphyrinogen oxidase  21.39 
 
 		 177 aa  62  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.00000000000339774  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2977  protoporphyrinogen oxidase  23.87 
 
 		 174 aa  61.6  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0026  protoporphyrinogen oxidase  24.68 
 
 		 179 aa  60.8  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0019  protoporphyrinogen oxidase  22.97 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.827877  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2953  protoporphyrinogen oxidase  24.67 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.410486 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1824  flavodoxin  26.09 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0029  protoporphyrinogen oxidase  24.68 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00401521  normal  0.0528505 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1410  Flavodoxin-like protein  33.64 
 
 		 175 aa  58.9  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00810371 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0027  protoporphyrinogen oxidase  24.22 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0184042 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0027  protoporphyrinogen oxidase, putative  24.34 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4324  protoporphyrinogen oxidase  19.53 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2882  protoporphyrinogen oxidase  25.48 
 
 		 178 aa  57  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0017  protoporphyrinogen oxidase  26.8 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.229911  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2537  protoporphyrinogen oxidase  20.12 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000581009  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3066  protoporphyrinogen oxidase  26.35 
 
 		 173 aa  54.3  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0377442 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4255  flavodoxin/nitric oxide synthase  21.99 
 
 		 197 aa  54.3  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0871  protoporphyrinogen oxidase  26.35 
 
 		 173 aa  53.9  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4072  protoporphyrinogen oxidase  23.33 
 
 		 176 aa  53.9  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0906  protoporphyrinogen oxidase  25.68 
 
 		 173 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0141  Protoporphyrinogen oxidase  20.78 
 
 		 173 aa  53.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3038  protoporphyrinogen oxidase  25 
 
 		 173 aa  52.8  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1487  protoporphyrinogen oxidase  23.33 
 
 		 175 aa  53.1  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.040472  hitchhiker  0.00766519 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2554  Flavodoxin-like protein  23.08 
 
 		 169 aa  52  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0022  protoporphyrinogen oxidase  22.36 
 
 		 174 aa  52  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000530188  hitchhiker  0.000763246 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0020  protoporphyrinogen oxidase  22.36 
 
 		 174 aa  52  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000664462  normal  0.064653 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0028  protoporphyrinogen oxidase  22.36 
 
 		 174 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000780551  hitchhiker  0.000000145429 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0962  Protoporphyrinogen oxidase  24.32 
 
 		 173 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0610  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  29.41 
 
 		 323 aa  51.2  0.000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.828743  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3245  flavodoxin-like protein  24.71 
 
 		 176 aa  50.8  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0673  protoporphyrinogen oxidase  25.17 
 
 		 177 aa  51.2  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0023  protoporphyrinogen oxidase  23.33 
 
 		 175 aa  50.8  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000262535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2314  flavodoxin-like  17.99 
 
 		 170 aa  50.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0403811  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0939  protoporphyrinogen oxidase  24.32 
 
 		 173 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.031625  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0027  protoporphyrinogen oxidase  22.54 
 
 		 175 aa  50.1  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00412155  normal  0.0535555 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0198  protoporphyrinogen oxidase  23.68 
 
 		 173 aa  49.7  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3400  protoporphyrinogen oxidase  22.97 
 
 		 173 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0017  protoporphyrinogen oxidase  22.64 
 
 		 174 aa  48.9  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.324297  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0793  protoporphyrinogen oxidase  22 
 
 		 173 aa  48.9  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1284  hypothetical protein  20.62 
 
 		 188 aa  48.1  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.016048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4171  flavodoxin-like protein  21.01 
 
 		 216 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3023  flavodoxin  24.71 
 
 		 170 aa  48.1  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0573  protoporphyrinogen oxidase  27.78 
 
 		 167 aa  48.1  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00307777 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0973  protoporphyrinogen oxidase  24.32 
 
 		 173 aa  47.8  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.705197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0020  protoporphyrinogen oxidase  21.38 
 
 		 174 aa  47.4  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000993803  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0024  Protoporphyrinogen oxidase  21.38 
 
 		 174 aa  47.4  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.776203  hitchhiker  0.00000179508 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0678  protoporphyrinogen oxidase  21.77 
 
 		 173 aa  46.6  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.103464 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2492  flavodoxin-like protein  23.19 
 
 		 215 aa  47  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0025  protoporphyrinogen oxidase  21.08 
 
 		 175 aa  47  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00857411 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0025  protoporphyrinogen oxidase  21.71 
 
 		 174 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0214113  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3790  protoporphyrinogen oxidase  22.84 
 
 		 175 aa  45.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0024  protoporphyrinogen oxidase  21.71 
 
 		 174 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0780321  normal  0.0115046 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2438  Flavodoxin-like protein  20.42 
 
 		 174 aa  45.8  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000794828  normal  0.0165675 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0019  protoporphyrinogen oxidase  23.53 
 
 		 175 aa  45.4  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29950  hypothetical protein  20.2 
 
 		 164 aa  45.4  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.641113 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2648  flavodoxin/nitric oxide synthase  30 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000348313  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1501  flavodoxin  24.81 
 
 		 144 aa  44.3  0.0007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1180  flavodoxin/nitric oxide synthase  28.21 
 
 		 183 aa  44.3  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1685  flavodoxin  25 
 
 		 172 aa  44.3  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0906832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1291  flavodoxin/nitric oxide synthase  24.81 
 
 		 144 aa  43.9  0.0008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0855  hypothetical protein  23.66 
 
 		 237 aa  43.5  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.110269  normal  0.850819 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1106  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.56 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.796872  normal  0.0316992 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0813  protoporphyrinogen oxidase  20.35 
 
 		 173 aa  43.5  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1269  flavodoxin FldA  28.57 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.829769  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1205  flavodoxin family protein  24.44 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0025  flavodoxin  21.12 
 
 		 174 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2108  flavodoxin-like protein  20 
 
 		 167 aa  42.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0677138  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0530  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.06 
 
 		 185 aa  42.7  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2874  flavodoxin/nitric oxide synthase  28.77 
 
 		 191 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00256934  hitchhiker  0.000000000000114365 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0880  flavodoxin/nitric oxide synthase  28.38 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3121  putative flavodoxin  27 
 
 		 183 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.197452  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>