47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1632 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1632  flavodoxin-like protein  100 
 
 		 193 aa  387  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.138919  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3023  flavodoxin  38.86 
 
 		 170 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0168  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.73 
 
 		 174 aa  94.4  9e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607551  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0573  protoporphyrinogen oxidase  38.55 
 
 		 167 aa  89.7  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00307777 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29950  hypothetical protein  39.53 
 
 		 164 aa  88.6  5e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.641113 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2409  protoporphyrinogen oxidase  37.28 
 
 		 181 aa  87.8  8e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0136205  normal  0.0149961 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2554  Flavodoxin-like protein  33.53 
 
 		 169 aa  85.5  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1824  flavodoxin  29.94 
 
 		 168 aa  83.2  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4171  flavodoxin-like protein  33.33 
 
 		 216 aa  79.7  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2314  flavodoxin-like  33.14 
 
 		 170 aa  80.1  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0403811  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1410  Flavodoxin-like protein  27.38 
 
 		 175 aa  76.3  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00810371 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2562  Flavodoxin-like protein  30.77 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3245  flavodoxin-like protein  31.38 
 
 		 176 aa  74.3  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1699  flavodoxin  31.93 
 
 		 176 aa  73.6  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.35306  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1685  flavodoxin  29.76 
 
 		 172 aa  73.6  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0906832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2492  flavodoxin-like protein  30.72 
 
 		 215 aa  71.6  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00340  flavodoxin  32.74 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2108  flavodoxin-like protein  33.12 
 
 		 167 aa  62  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0677138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1035  protoporphyrinogen oxidase  32.04 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.395736  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19080  flavodoxin  30.41 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2438  Flavodoxin-like protein  32.6 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000794828  normal  0.0165675 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3790  protoporphyrinogen oxidase  23.33 
 
 		 175 aa  51.2  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0266  protoporphyrinogen oxidase  25 
 
 		 177 aa  50.1  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0106275  normal  0.013044 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0973  protoporphyrinogen oxidase  24.85 
 
 		 173 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.705197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3662  hypothetical protein  30.61 
 
 		 140 aa  49.3  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.35074  normal  0.580287 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0939  protoporphyrinogen oxidase  24.26 
 
 		 173 aa  48.9  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.031625  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2953  protoporphyrinogen oxidase  23.33 
 
 		 175 aa  47  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.410486 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0141  Protoporphyrinogen oxidase  28 
 
 		 173 aa  46.2  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4230  protoporphyrinogen oxidase  24.56 
 
 		 179 aa  45.8  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0023265  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0962  Protoporphyrinogen oxidase  23.57 
 
 		 173 aa  45.1  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0906  protoporphyrinogen oxidase  23.08 
 
 		 173 aa  45.1  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3066  protoporphyrinogen oxidase  22.49 
 
 		 173 aa  45.1  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0377442 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3038  protoporphyrinogen oxidase  21.76 
 
 		 173 aa  44.7  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3743  protoporphyrinogen oxidase  29.47 
 
 		 179 aa  43.9  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000514113  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0287  protoporphyrinogen oxidase  23.08 
 
 		 177 aa  43.5  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000232863  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0793  protoporphyrinogen oxidase  22.16 
 
 		 173 aa  43.9  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1916  protoporphyrinogen oxidase  23.08 
 
 		 177 aa  43.5  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000017226  normal  0.191063 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0871  protoporphyrinogen oxidase  21.89 
 
 		 173 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3929  protoporphyrinogen oxidase  23.08 
 
 		 177 aa  43.5  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.00000000000339774  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3400  protoporphyrinogen oxidase  24.71 
 
 		 173 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0673  protoporphyrinogen oxidase  22.35 
 
 		 177 aa  42.4  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1132  beta-lactamase domain-containing protein  30.14 
 
 		 399 aa  42  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4324  protoporphyrinogen oxidase  24.21 
 
 		 190 aa  42.4  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0017  protoporphyrinogen oxidase  21.86 
 
 		 176 aa  42  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.229911  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0017  protoporphyrinogen oxidase  22.65 
 
 		 174 aa  41.6  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.324297  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0023  protoporphyrinogen oxidase  22.73 
 
 		 175 aa  41.6  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000262535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0025  protoporphyrinogen oxidase  23.38 
 
 		 175 aa  41.6  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00857411 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>