73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1516 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1516  PEGA domain-containing protein  100 
 
 		 432 aa  854    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0463  PEGA domain-containing protein  40.98 
 
 		 497 aa  243  5e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00383577 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3001  PEGA  37.38 
 
 		 600 aa  239  5.999999999999999e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.221901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0214  hypothetical protein  38.26 
 
 		 435 aa  216  7e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2495  PEGA  29.63 
 
 		 436 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.441491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0005  PEGA domain protein  36.25 
 
 		 684 aa  195  2e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2758  hypothetical protein  37.45 
 
 		 546 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1891  PEGA domain protein  33 
 
 		 460 aa  145  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0787  PKD domain-containing protein  34.82 
 
 		 561 aa  140  3.9999999999999997e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.605081  normal  0.12809 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1237  PEGA domain protein  28.01 
 
 		 613 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2179  hypothetical protein  48.2 
 
 		 323 aa  123  7e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.257809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3597  PEGA domain protein  27.06 
 
 		 727 aa  117  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.956327  normal  0.0137452 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1135  hypothetical protein  43.14 
 
 		 225 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0772  hypothetical protein  28.18 
 
 		 335 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.133586  normal  0.240825 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0134  hypothetical protein  35.71 
 
 		 412 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2302  hypothetical protein  33.9 
 
 		 271 aa  111  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0951  PEGA domain-containing protein  32.59 
 
 		 409 aa  101  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.919574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2300  PEGA  29.01 
 
 		 311 aa  101  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  30.67 
 
 		 963 aa  98.6  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3130  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.21 
 
 		 1085 aa  96.3  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.446766  hitchhiker  0.000357529 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0035  hypothetical protein  40.54 
 
 		 520 aa  95.9  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.891717 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2301  hypothetical protein  34.22 
 
 		 219 aa  94.4  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0037  serine/threonine protein kinase  29.87 
 
 		 750 aa  92.4  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0086  PEGA domain-containing protein  35.67 
 
 		 456 aa  91.7  3e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00061684  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3131  peptidase C1A, papain  42.21 
 
 		 1096 aa  90.9  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.34084  hitchhiker  0.000341484 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1967  hypothetical protein  43.69 
 
 		 208 aa  89.4  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1431  PEGA domain-containing protein  31.82 
 
 		 326 aa  88.6  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.075762  decreased coverage  0.0000710587 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1438  hypothetical protein  47.42 
 
 		 184 aa  87.8  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00281988  hitchhiker  0.000303146 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0086  PEGA domain-containing protein  34.5 
 
 		 456 aa  87.8  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.943488  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  49.4 
 
 		 802 aa  87.4  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  49.37 
 
 		 823 aa  86.7  7e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0105  PEGA domain-containing protein  34.46 
 
 		 426 aa  82.8  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0195  PEGA domain protein  34.1 
 
 		 412 aa  82  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  47.31 
 
 		 719 aa  71.2  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2317  PEGA domain-containing protein  47.89 
 
 		 379 aa  71.6  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.568097 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1197  PEGA domain-containing protein  37.07 
 
 		 364 aa  66.6  0.0000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.258799  hitchhiker  0.00873035 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2498  PKD  28.57 
 
 		 465 aa  61.2  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.0000170724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0016  hypothetical protein  22.31 
 
 		 553 aa  61.2  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.697123  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0116  PEGA domain-containing protein  31.51 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2682  serine/threonine protein kinase  29.06 
 
 		 752 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1683  PKD  38.71 
 
 		 211 aa  56.2  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.657327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2294  hypothetical protein  31.2 
 
 		 313 aa  55.5  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.769355 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1756  Carbohydrate binding family 6  30.56 
 
 		 930 aa  55.1  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.127893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0814  PEGA domain-containing protein  28.95 
 
 		 341 aa  54.7  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0335  PEGA domain-containing protein  48.21 
 
 		 226 aa  54.3  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.250478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0392  hypothetical protein  38.83 
 
 		 309 aa  53.9  0.000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0000941975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0552  hypothetical protein  24.18 
 
 		 464 aa  53.9  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.092492  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0111  PEGA domain protein  31.76 
 
 		 416 aa  53.1  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1562  PEGA domain protein  25.3 
 
 		 533 aa  53.5  0.000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00305043  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1818  PEGA domain protein  23.3 
 
 		 592 aa  52.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1345  hypothetical protein  37.63 
 
 		 240 aa  51.2  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.235761  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1528  serine/threonine protein kinase  28.66 
 
 		 601 aa  50.4  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03503  Secreted protein with uncharacterized domain  25.86 
 
 		 660 aa  49.3  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3461  serine/threonine protein kinase  23.9 
 
 		 1014 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445982  normal  0.215127 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4224  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 925 aa  48.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.674514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5101  serine/threonine protein kinase  27.33 
 
 		 996 aa  47.4  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2225  serine/threonine protein kinase  34.25 
 
 		 681 aa  46.6  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.297474 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0575  PEGA domain-containing protein  34.33 
 
 		 269 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.416846  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1453  PEGA domain-containing protein  34.65 
 
 		 276 aa  45.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0637995  normal  0.0741839 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6069  serine/threonine protein kinase  26.12 
 
 		 883 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.249912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1527  serine/threonine protein kinase  27.45 
 
 		 1122 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3740  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 591 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.293383  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2676  serine/threonine protein kinase  31.43 
 
 		 769 aa  45.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.396186  normal  0.282843 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4431  PEGA domain-containing protein  32.84 
 
 		 283 aa  44.7  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.373808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4958  PEGA domain protein  33.73 
 
 		 357 aa  44.7  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2575  hypothetical protein  25.15 
 
 		 401 aa  44.3  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000914091 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3881  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 593 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.154001  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3797  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 593 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.059724  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1479  hypothetical protein  35.29 
 
 		 392 aa  43.9  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.192585  normal  0.860345 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3858  protein kinase  30 
 
 		 591 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.634646 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5122  type IV pilus assembly PilZ  30.94 
 
 		 843 aa  43.5  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0427193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0079  PEGA domain-containing protein  37.14 
 
 		 247 aa  43.5  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.91478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2480  hypothetical protein  30.88 
 
 		 364 aa  43.1  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>