136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4735 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_4735  Rhodanese domain protein  100 
 
 
276 aa  553  1e-156  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1890  Rhodanese domain protein  90.94 
 
 
276 aa  507  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147742  normal  0.557536 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1752  Rhodanese domain protein  88.04 
 
 
276 aa  488  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.708462  normal  0.834811 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1474  rhodanese domain-containing protein  88.04 
 
 
276 aa  489  1e-137  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0999735 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4195  Rhodanese domain protein  79.34 
 
 
276 aa  431  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2238  Rhodanese domain protein  70.7 
 
 
276 aa  385  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50226  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6096  Rhodanese domain protein  68.86 
 
 
276 aa  373  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6163  rhodanese domain-containing protein  67.4 
 
 
276 aa  369  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3650  rhodanese domain-containing protein  66.28 
 
 
273 aa  346  2e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4664  hypothetical protein  62.69 
 
 
272 aa  342  2.9999999999999997e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.168617  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2390  Rhodanese domain protein  62.77 
 
 
271 aa  340  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2725  Rhodanese domain protein  64.79 
 
 
271 aa  329  4e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0743  rhodanese domain-containing protein  60.87 
 
 
277 aa  328  7e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.792862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2539  hypothetical protein  59.49 
 
 
275 aa  317  9e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.613317  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3132  rhodanese domain-containing protein  59.78 
 
 
281 aa  308  5e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3338  rhodanese domain-containing protein  59.78 
 
 
281 aa  308  5e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.337326 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0299  Rhodanese domain protein  58.8 
 
 
272 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.248369 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4887  hypothetical protein  40.61 
 
 
297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0054  hypothetical protein  57.66 
 
 
205 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1562  hypothetical protein  57.66 
 
 
205 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1209  hypothetical protein  57.66 
 
 
205 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0065  ChrB protein  57.66 
 
 
205 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0065  hypothetical protein  57.66 
 
 
205 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1204  hypothetical protein  52.74 
 
 
152 aa  159  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0392083  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1492  hypothetical protein  57.66 
 
 
142 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0082  ChrB protein  57.66 
 
 
142 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5141  ChrB protein  52.82 
 
 
143 aa  155  8e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.549445  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6454  hypothetical protein  49.66 
 
 
157 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5589  hypothetical protein  48.98 
 
 
157 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5953  hypothetical protein  48.98 
 
 
157 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.241213 
 
 
-
 
NC_003296  RS03923  hypothetical protein  47.5 
 
 
182 aa  151  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0504923 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3864  chromate resistance regulator  48.98 
 
 
152 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3380  helix-turn-helix domain-containing protein  49.31 
 
 
288 aa  150  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2823  transcriptional regulator, AraC family  49.32 
 
 
285 aa  145  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6199  hypothetical protein  50.72 
 
 
140 aa  145  6e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00558934 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2046  transcriptional regulator, AraC family  48.28 
 
 
287 aa  145  9e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.344929  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2153  hypothetical protein  46.94 
 
 
150 aa  144  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.594217  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2525  hypothetical protein  48.3 
 
 
156 aa  138  8.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.368998 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3379  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  43.45 
 
 
285 aa  137  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5223  chromate resistance regulator  46.9 
 
 
155 aa  132  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.327811 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5156  hypothetical protein  52.34 
 
 
128 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0357  hypothetical protein  44.2 
 
 
144 aa  110  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.721844  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1349  Chromate resistance exported protein  34.93 
 
 
146 aa  91.3  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2675  ChrB protein  35.14 
 
 
333 aa  82.4  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2524  ChrB protein  29.29 
 
 
328 aa  82.8  0.000000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.555029 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0097  hypothetical protein  36.96 
 
 
139 aa  81.6  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.00000827491 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1564  chromate resistance exported protein  40.28 
 
 
273 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1213  chromate resistance protein ChrB  40.28 
 
 
325 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1496  chromate resistance protein ChrB  40.28 
 
 
303 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0085  chrB protein  40.28 
 
 
331 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0068  chrB protein  40.28 
 
 
303 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0069  chromate resistance protein ChrB  40.28 
 
 
325 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0056  chromate resistance protein ChrB  39.58 
 
 
325 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2805  ChrB protein  31.6 
 
 
363 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3192  chromate resistance exported protein  34.87 
 
 
309 aa  76.3  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2248  hypothetical protein  38.57 
 
 
306 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0295306  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0074  chromate resistance protein ChrB  40.14 
 
 
273 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5158  hypothetical protein  38.06 
 
 
313 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3573  putative chromate resistance signal peptide protein  37.82 
 
 
320 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.771292  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3250  putative chromate resistance signal peptide protein  37.82 
 
 
320 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3383  hypothetical protein  37.31 
 
 
313 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431478  hitchhiker  0.00234809 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3866  chromate resistance regulator  37.18 
 
 
335 aa  73.2  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1533  putative chromate resistance protein  39.01 
 
 
141 aa  72.4  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3199  chromate resistance exported protein  38.57 
 
 
325 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5138  chromate resistance exported protein  35 
 
 
332 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374777  normal  0.563482 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2446  chromate resistance exported protein  35.92 
 
 
316 aa  71.2  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1207  putative chromate resistance protein  38.93 
 
 
320 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.609429  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5054  chromate resistance exported protein  37.86 
 
 
325 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234955  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1802  putative chromate resistance protein  37.59 
 
 
320 aa  70.5  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4366  chromate resistance exported protein  33.55 
 
 
312 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.883925  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6203  putative chromate resistance signal peptide protein  36.77 
 
 
324 aa  69.3  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.941608  normal  0.0314221 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4254  hypothetical protein  36.69 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0554  chromate resistance signal peptide protein  35.48 
 
 
323 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0496701 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1522  chromate resistance signal peptide protein  35 
 
 
324 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.320502  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0082  Chromate resistance exported protein  39.69 
 
 
323 aa  65.9  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.908609 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5591  putative chromate resistance signal peptide protein  34.72 
 
 
320 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5955  putative chromate resistance signal peptide protein  34.72 
 
 
320 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0687386 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6456  putative chromate resistance signal peptide protein  36.43 
 
 
320 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.968357 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2449  hypothetical protein  41.18 
 
 
93 aa  63.5  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.941698  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1227  hypothetical protein  31.29 
 
 
216 aa  60.1  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.833302 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6200  rhodanese-like protein  32.38 
 
 
113 aa  57.4  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00527926 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2187  rhodanese-like protein  37.5 
 
 
135 aa  53.9  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  35.71 
 
 
711 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0093  rhodanese domain-containing protein  34.74 
 
 
106 aa  50.1  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.00000890078 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0455  rhodanese domain-containing protein  30.1 
 
 
139 aa  49.7  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1146  Rhodanese domain protein  30.77 
 
 
137 aa  48.9  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0154905  hitchhiker  0.0000789559 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2657  rhodanese-like protein  34.02 
 
 
125 aa  48.5  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  31.63 
 
 
455 aa  47.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  33.33 
 
 
132 aa  47.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2502  manganese and iron superoxide dismutase  34.07 
 
 
305 aa  47.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4245  rhodanese domain-containing protein  37.08 
 
 
137 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0856379 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  26.17 
 
 
133 aa  45.8  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0047  rhodanese-like protein  31.82 
 
 
139 aa  45.8  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5758  manganese and iron superoxide dismutase  39.08 
 
 
308 aa  45.8  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.48784  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1911  rhodanese domain-containing protein  30.16 
 
 
189 aa  45.8  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000193462  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0984  rhodanese domain-containing protein  34.91 
 
 
192 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2894  rhodanese domain-containing protein  36.61 
 
 
113 aa  45.8  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127379  normal  0.672082 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0495  hypothetical protein  30.48 
 
 
132 aa  45.4  0.0009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  34.48 
 
 
151 aa  45.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1047  Rhodanese domain protein  36.36 
 
 
185 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>