More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0503 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_0503  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 
376 aa  738    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0568  monooxygenase FAD-binding  97.07 
 
 
376 aa  692    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3614  monooxygenase FAD-binding  63.83 
 
 
378 aa  409  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392094  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2657  monooxygenase, FAD-binding  57.34 
 
 
377 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.751067  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0950  monooxygenase, FAD-binding  46.05 
 
 
368 aa  351  1e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0960  monooxygenase, FAD-binding  45.5 
 
 
368 aa  348  1e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.234631  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0982  monooxygenase FAD-binding  36.86 
 
 
369 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.240273  decreased coverage  0.000117397 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1093  monooxygenase, FAD-binding  36.02 
 
 
369 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.363504 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  26.06 
 
 
377 aa  129  6e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30630  putative FAD-dependent monooxygenase  31.33 
 
 
382 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0241073 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0067  monooxygenase FAD-binding protein  31.49 
 
 
400 aa  119  6e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  32.75 
 
 
385 aa  119  9e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2611  putative FAD-dependent monooxygenase  33.23 
 
 
382 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.172271  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0125  monooxygenase FAD-binding  28.28 
 
 
374 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  32.76 
 
 
377 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  30.48 
 
 
403 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4063  monooxygenase FAD-binding protein  30.61 
 
 
402 aa  114  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  31.23 
 
 
402 aa  113  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  31.34 
 
 
404 aa  112  9e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3566  monooxygenase, FAD-binding  33.44 
 
 
389 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411114  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1889  hypothetical protein  25.14 
 
 
374 aa  110  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1561  monooxygenase FAD-binding  34.17 
 
 
392 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0688558  normal  0.0725424 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00340  kynurenine 3-monooxygenase, putative  26.12 
 
 
421 aa  108  1e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.303065  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3561  monooxygenase, FAD-binding protein  33.54 
 
 
389 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.014092  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3634  monooxygenase, FAD-binding  33.54 
 
 
389 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.231418  normal  0.598375 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1462  monooxygenase FAD-binding  28.29 
 
 
390 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000001589  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  29.38 
 
 
397 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  31.51 
 
 
377 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4211  monooxygenase, FAD-binding  33.04 
 
 
382 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.815591  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0481  salicylate 1-monooxygenase  33.12 
 
 
373 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3892  monooxygenase FAD-binding protein  30.24 
 
 
396 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.116118  normal  0.359829 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1486  monooxygenase FAD-binding protein  32.59 
 
 
408 aa  107  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.528879  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3957  monooxygenase FAD-binding  29.05 
 
 
376 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0387  monooxygenase FAD-binding  26.84 
 
 
402 aa  106  7e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.491614 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1969  hypothetical protein  22.81 
 
 
377 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0438709  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5387  hypothetical protein  29.83 
 
 
420 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  29.77 
 
 
421 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  29.54 
 
 
404 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4002  monooxygenase FAD-binding  28.77 
 
 
376 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  32.6 
 
 
391 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  30.55 
 
 
399 aa  104  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  32.6 
 
 
391 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7487  putative oxidoreductase  30.09 
 
 
399 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455453  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1494  monooxygenase, FAD-binding  29.37 
 
 
386 aa  103  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.379752  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4005  monooxygenase FAD-binding  32.09 
 
 
396 aa  103  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.888605  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2230  hypothetical protein  23.71 
 
 
377 aa  103  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000757274  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1987  hypothetical protein  23.7 
 
 
377 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000746962  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6537  monooxygenase, FAD-binding protein  29.6 
 
 
392 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203356  normal  0.0154804 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1142  monooxygenase FAD-binding  30.14 
 
 
388 aa  102  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000665044 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  28.41 
 
 
376 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1528  monooxygenase FAD-binding  29.05 
 
 
362 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.392805  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  28.78 
 
 
386 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0733  hypothetical protein  27.83 
 
 
369 aa  100  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  29.27 
 
 
422 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2779  monooxygenase FAD-binding  31.2 
 
 
411 aa  99.8  7e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0421282 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2962  monooxygenase FAD-binding protein  30.42 
 
 
397 aa  99.8  8e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5812  monooxygenase, FAD-binding protein  31.55 
 
 
408 aa  99.8  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0698086  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3284  monooxygenase FAD-binding protein  28.46 
 
 
393 aa  99.4  9e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.289154 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5319  monooxygenase FAD-binding protein  32.4 
 
 
390 aa  99  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2318  monooxygenase FAD-binding  29.9 
 
 
385 aa  99  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.694664  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0859  hypothetical protein  25.14 
 
 
376 aa  99.4  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  30.62 
 
 
390 aa  99  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5727  monooxygenase, FAD-binding  28.94 
 
 
364 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1253  monooxygenase, FAD-binding  29.8 
 
 
388 aa  98.2  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.420129  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  28.42 
 
 
404 aa  98.6  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2242  hypothetical protein  27.16 
 
 
379 aa  98.6  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5341  monooxygenase FAD-binding protein  28.72 
 
 
418 aa  98.2  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5557  FAD-dependent oxidoreductase  31.74 
 
 
367 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.633311 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1002  hypothetical protein  27.51 
 
 
369 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.132346  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2621  monooxygenase, FAD-binding  28.93 
 
 
388 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.684205  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5437  monooxygenase, FAD-binding  28.94 
 
 
364 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  26.92 
 
 
374 aa  97.1  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5348  monooxygenase, FAD-binding protein  28.65 
 
 
360 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8535  monooxygenase FAD-binding  29.89 
 
 
384 aa  96.3  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0157087  hitchhiker  0.0015439 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  30.91 
 
 
387 aa  95.5  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0871  salicylate hydroxylase  26.72 
 
 
422 aa  95.9  1e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0457769  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  28.26 
 
 
404 aa  95.1  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2710  monooxygenase FAD-binding  26.35 
 
 
392 aa  94.7  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2905  monooxygenase FAD-binding  33.33 
 
 
381 aa  94  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00589473 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  29.34 
 
 
376 aa  93.6  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00140  conserved hypothetical protein  28.43 
 
 
419 aa  93.2  6e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.180406  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  30.53 
 
 
396 aa  93.6  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1977  monooxygenase FAD-binding protein  30.6 
 
 
393 aa  92.8  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0000420901  unclonable  0.000000044053 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_11206  FAD-dependent monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02380)  26.22 
 
 
479 aa  92  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0213132 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0229  monooxygenase FAD-binding  31.93 
 
 
409 aa  92.8  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5335  FAD-dependent monooxygenase  33.73 
 
 
378 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3140  hypothetical protein  26.15 
 
 
376 aa  92  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4249  monooxygenase FAD-binding  26.02 
 
 
370 aa  92.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31126  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  28.3 
 
 
411 aa  92  1e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4138  monooxygenase, FAD-binding protein  28.33 
 
 
408 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145497  normal  0.0296411 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4701  putative oxidoreductase transmembrane protein  29.47 
 
 
381 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105263  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06742  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00590)  24.63 
 
 
697 aa  90.9  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00748094 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2253  monooxygenase FAD-binding protein  29.31 
 
 
401 aa  90.9  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4324  salicylate 1-monooxygenase  27.58 
 
 
385 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524787  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4042  salicylate 1-monooxygenase  27.58 
 
 
385 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00369253  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2372  hypothetical protein  23.51 
 
 
374 aa  90.5  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2329  hypothetical protein  23.51 
 
 
374 aa  90.5  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  27.22 
 
 
385 aa  90.9  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0310  monooxygenase FAD-binding protein  28.47 
 
 
309 aa  90.5  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0496808  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  28.03 
 
 
383 aa  90.1  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>