28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1393 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1393  DNA primase large subunit  100 
 
 
362 aa  751    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.402871  normal  0.321171 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1462  DNA primase large subunit  48.4 
 
 
334 aa  317  2e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1489  DNA primase large subunit  43.05 
 
 
384 aa  301  1e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0793  DNA primase large subunit  43.97 
 
 
338 aa  295  6e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0232424  normal  0.488052 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1252  DNA primase large subunit  42.51 
 
 
354 aa  272  8.000000000000001e-72  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2192  DNA primase large subunit  33.14 
 
 
364 aa  189  5e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0880  DNA primase large subunit  30.79 
 
 
413 aa  176  5e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1028  DNA primase large subunit  34.44 
 
 
330 aa  168  1e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.163924  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0159  DNA primase, large subunit  33.73 
 
 
360 aa  167  2.9999999999999998e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1650  DNA primase large subunit  32.28 
 
 
361 aa  163  4.0000000000000004e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0993  DNA primase, large subunit  35.21 
 
 
362 aa  160  2e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.438183  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2038  DNA primase, large subunit  37.56 
 
 
427 aa  145  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1229  DNA primase, large subunit  37.07 
 
 
364 aa  137  3.0000000000000003e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0065  DNA primase large subunit  27.95 
 
 
341 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0623  DNA primase, large subunit  27.99 
 
 
356 aa  120  3e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.426261  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0852  DNA primase large subunit  27.86 
 
 
349 aa  117  3e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.10596 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1917  DNA primase large subunit  29.45 
 
 
349 aa  112  7.000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0952  DNA primase large subunit  28.45 
 
 
346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1401  DNA primase large subunit  35.64 
 
 
349 aa  106  8e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2529  DNA primase, large subunit  30 
 
 
389 aa  90.9  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.436606  normal  0.303957 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0829  DNA primase, large subunit  25.56 
 
 
371 aa  64.3  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1625  DNA primase, large subunit  21.64 
 
 
307 aa  53.9  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.179853  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1211  DNA primase, large subunit  20.56 
 
 
369 aa  52  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.676025  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1006  DNA primase, large subunit  20.59 
 
 
369 aa  51.2  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0940  DNA primase, large subunit  19.49 
 
 
369 aa  50.4  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.410078  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1675  DNA primase large subunit  20.23 
 
 
369 aa  46.6  0.0007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43992  predicted protein  30.69 
 
 
488 aa  45.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.440471  normal  0.072463 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01730  hypothetical protein  30.11 
 
 
502 aa  45.1  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>