More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0106 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0106  50S ribosomal protein L9  100 
 
 
147 aa  288  2e-77  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl083  50S ribosomal protein L9  61.9 
 
 
147 aa  180  5.0000000000000004e-45  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000770286  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5262  50S ribosomal protein L9  43.54 
 
 
148 aa  100  9e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00409171  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1150  50S ribosomal protein L9  33.56 
 
 
165 aa  99.8  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292661  hitchhiker  0.00494207 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1814  ribosomal protein L9  39.55 
 
 
149 aa  99.4  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0012  50S ribosomal protein L9  42.28 
 
 
154 aa  99  2e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181348  hitchhiker  0.0000209307 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  39.85 
 
 
148 aa  97.1  7e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0561  ribosomal protein L9  38.36 
 
 
149 aa  96.3  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204129  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4009  50S ribosomal protein L9  43.54 
 
 
148 aa  95.9  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.015297  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  40.69 
 
 
147 aa  92.4  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5322  50S ribosomal protein L9  43.54 
 
 
148 aa  91.3  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5150  50S ribosomal protein L9  43.54 
 
 
148 aa  91.3  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000483517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5166  50S ribosomal protein L9  43.54 
 
 
148 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0461945  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5579  50S ribosomal protein L9  43.54 
 
 
148 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17506e-22 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5718  50S ribosomal protein L9  43.54 
 
 
148 aa  91.3  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000626689  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1775  50S ribosomal protein L9  34.72 
 
 
149 aa  90.9  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000651865  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  35.37 
 
 
148 aa  89.7  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108464  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5596  50S ribosomal protein L9  42.86 
 
 
148 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000245736  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5620  50S ribosomal protein L9  43.54 
 
 
148 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000412151  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0830  ribosomal protein L9  31.72 
 
 
149 aa  89.4  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.211438  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5657  50S ribosomal protein L9  43.54 
 
 
148 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000227696  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5339  50S ribosomal protein L9  42.86 
 
 
148 aa  89  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000103383  hitchhiker  0.00000000147927 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3412  50S ribosomal protein L9  40.14 
 
 
149 aa  88.6  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0011  50S ribosomal protein L9  37.33 
 
 
150 aa  88.6  3e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.557694  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  38.35 
 
 
147 aa  88.2  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3991  50S ribosomal protein L9  34.25 
 
 
165 aa  86.3  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00054476 
 
 
-
 
NC_002936  DET0541  50S ribosomal protein L9  36 
 
 
151 aa  84.7  4e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0517  50S ribosomal protein L9  37.5 
 
 
151 aa  84.7  4e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_482  ribosomal protein L9  36 
 
 
151 aa  84.3  5e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2535  ribosomal protein L9  40.82 
 
 
148 aa  83.2  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000849852  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7042  ribosomal protein L9  33.77 
 
 
151 aa  82.4  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2212  50S ribosomal protein L9  35.65 
 
 
150 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1422  50S ribosomal protein L9  37.93 
 
 
151 aa  81.3  0.000000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0660955  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3528  50S ribosomal protein L9  32.88 
 
 
168 aa  80.5  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.156676  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1975  50S ribosomal protein L9  36.49 
 
 
149 aa  79.7  0.00000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3303  ribosomal protein L9  35.14 
 
 
149 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204917  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1063  ribosomal protein L9  32.41 
 
 
147 aa  79  0.00000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.342712  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0851  50S ribosomal protein L9P  30.82 
 
 
149 aa  79.3  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0014  50S ribosomal protein L9P  34.84 
 
 
151 aa  79.3  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0064  50S ribosomal protein L9  35.86 
 
 
149 aa  78.6  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1000  50S ribosomal protein L9  37.24 
 
 
147 aa  78.6  0.00000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0064  50S ribosomal protein L9  35.86 
 
 
149 aa  77.8  0.00000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.452229  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1220  50S ribosomal protein L9  34.01 
 
 
148 aa  77.8  0.00000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.592412  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0789  50S ribosomal protein L9  36.91 
 
 
150 aa  77.4  0.00000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1966  50S ribosomal protein L9  34.87 
 
 
150 aa  77.4  0.00000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0766  50S ribosomal protein L9  32.88 
 
 
147 aa  77  0.00000000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2538  50S ribosomal protein L9  37.06 
 
 
148 aa  76.3  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1335  50S ribosomal protein L9  32.88 
 
 
147 aa  76.6  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.779246  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2002  50S ribosomal protein L9  34.48 
 
 
153 aa  76.3  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0148705  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4506  ribosomal protein L9  31.72 
 
 
149 aa  75.9  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0691  50S ribosomal protein L9  32.19 
 
 
147 aa  75.5  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.965634  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3541  50S ribosomal protein L9  38.51 
 
 
149 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0755  50S ribosomal protein L9  33.56 
 
 
147 aa  75.1  0.0000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.123004  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  31.72 
 
 
146 aa  75.1  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1029  ribosomal protein L9  34.23 
 
 
148 aa  74.7  0.0000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0075177  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1996  50S ribosomal protein L9  34.93 
 
 
148 aa  74.7  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5366  ribosomal protein L9  30.28 
 
 
151 aa  74.7  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3757  50S ribosomal protein L9  34.48 
 
 
148 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5913  ribosomal protein L9  30.14 
 
 
150 aa  74.3  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0448  50S ribosomal protein L9  35.14 
 
 
148 aa  74.3  0.0000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4351  ribosomal protein L9  31.72 
 
 
148 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2135  ribosomal protein L9  31.58 
 
 
148 aa  73.6  0.0000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  30.14 
 
 
149 aa  73.2  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6995  ribosomal protein L9  30.88 
 
 
148 aa  72  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.142438 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  30.14 
 
 
148 aa  72  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0163  50S ribosomal protein L9  28.8 
 
 
146 aa  72.4  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00237667  normal  0.639266 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  33.78 
 
 
147 aa  72  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2509  50S ribosomal protein L9  30.61 
 
 
151 aa  72  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000781135  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4931  50S ribosomal protein L9  32.88 
 
 
148 aa  71.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.108353  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  26.67 
 
 
148 aa  71.6  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0642  50S ribosomal protein L9  39.6 
 
 
145 aa  71.6  0.000000000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0740  ribosomal protein L9  36.05 
 
 
150 aa  71.6  0.000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5065  50S ribosomal protein L9  30.61 
 
 
148 aa  71.2  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.972236  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  28.57 
 
 
151 aa  71.2  0.000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0894  50S ribosomal protein L9  33.79 
 
 
149 aa  71.2  0.000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000571684  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1976  50S ribosomal protein L9  38.51 
 
 
152 aa  71.6  0.000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  32.43 
 
 
150 aa  70.9  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4661  50S ribosomal protein L9P  28.77 
 
 
148 aa  70.5  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2006  ribosomal protein L9  36.99 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11530  ribosomal protein L9  32.59 
 
 
191 aa  70.5  0.000000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0446546  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  32.43 
 
 
148 aa  70.1  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7309  50S ribosomal protein L9  26.21 
 
 
148 aa  70.1  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  0.0304173 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  27.59 
 
 
171 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000225617  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1375  50S ribosomal protein L9  32.88 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0636184  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5743  50S ribosomal protein L9  30.41 
 
 
152 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.245852 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5367  50S ribosomal protein L9  30.41 
 
 
152 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5456  50S ribosomal protein L9  30.41 
 
 
152 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166119  normal  0.0135281 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4336  50S ribosomal protein L9  27.7 
 
 
150 aa  68.9  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0023  ribosomal protein L9  28.47 
 
 
174 aa  69.3  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.725827  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27890  ribosomal protein L9  31.03 
 
 
181 aa  69.3  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00233062  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  29.93 
 
 
148 aa  68.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2022  50S ribosomal protein L9  26.21 
 
 
168 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2761  50S ribosomal protein L9  34.25 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  26.71 
 
 
148 aa  67.8  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4553  50S ribosomal protein L9  28.57 
 
 
148 aa  67.4  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156994  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10055  50S ribosomal protein L9  30.2 
 
 
152 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.95125e-19  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9354  50S ribosomal protein L9P  29.93 
 
 
148 aa  67.4  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0025  ribosomal protein L9  28.97 
 
 
178 aa  67  0.00000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00173008  normal  0.984167 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2972  50S ribosomal protein L9  33.83 
 
 
148 aa  67  0.00000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2650  50S ribosomal protein L9  33.83 
 
 
148 aa  67  0.00000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.502254  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>