More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0148 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  100 
 
 		 277 aa  559  1e-158  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0242  polysaccharide export protein  47.97 
 
 		 264 aa  229  3e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  42.44 
 
 		 264 aa  206  5e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  43.8 
 
 		 270 aa  204  1e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1877  polysaccharide export protein  44.67 
 
 		 281 aa  201  8e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2734  capsular polysaccharide export protein, putative  41.8 
 
 		 276 aa  172  5e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0365414 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2367  polysaccharide export protein EpsE  39.92 
 
 		 262 aa  164  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1538  periplasmic polysaccharide export protein  37.6 
 
 		 268 aa  153  4e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  34.63 
 
 		 277 aa  144  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3311  polysaccharide export protein  36.44 
 
 		 324 aa  139  6e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.328062 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1695  polysaccharide export protein  36.76 
 
 		 356 aa  132  6e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24357  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3319  polysaccharide export protein  38 
 
 		 351 aa  131  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.211792 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0835  polysaccharide export protein  34.82 
 
 		 272 aa  123  3e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3803  polysaccharide export protein  32.81 
 
 		 344 aa  123  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0834  polysaccharide export protein  33.79 
 
 		 309 aa  119  6e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  32.52 
 
 		 362 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2182  polysaccharide export protein  30.04 
 
 		 298 aa  113  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  32.52 
 
 		 388 aa  109  6e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1823  polysaccharide export protein  30.65 
 
 		 387 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0435675  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1525  polysaccharide export protein  31.05 
 
 		 243 aa  104  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  30.95 
 
 		 379 aa  103  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1114  polysaccharide export protein  29.7 
 
 		 431 aa  102  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0366205  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1515  polysaccharide export protein  30.84 
 
 		 869 aa  102  9e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000317972  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1728  putative capsular polysaccharide transport outermembrane protein  32.47 
 
 		 352 aa  99.8  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0619  polysaccharide export protein  31.8 
 
 		 376 aa  99.4  6e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112684  normal  0.159669 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.82 
 
 		 378 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000597973  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2676  polysaccharide export protein  34.62 
 
 		 379 aa  96.3  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4429  polysaccharide export protein  30.35 
 
 		 374 aa  96.3  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001119  polysaccharide export lipoprotein wza  27.99 
 
 		 317 aa  95.5  8e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000135082  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1430  capsular polysaccharide export protein, putative  29.8 
 
 		 333 aa  95.5  9e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01968  lipoprotein required for capsular polysaccharide translocation through the outer membrane  33.65 
 
 		 379 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1595  polysaccharide export protein  33.65 
 
 		 379 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.249253  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3871  polysaccharide export protein  32.74 
 
 		 214 aa  94.7  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.631942  normal  0.0416181 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2997  polysaccharide biosynthesis/export protein  33.65 
 
 		 379 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0597184 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01957  hypothetical protein  33.65 
 
 		 379 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2864  polysaccharide export protein  33.09 
 
 		 389 aa  95.1  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1170  polysaccharide biosynthesis/export protein  33.65 
 
 		 379 aa  94.7  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2344  polysaccharide biosynthesis/export protein  33.17 
 
 		 379 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.675285  normal  0.855008 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2355  polysaccharide biosynthesis/export protein  33.65 
 
 		 379 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1579  polysaccharide export protein  33.65 
 
 		 379 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.479279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2458  polysaccharide biosynthesis/export protein  33.17 
 
 		 379 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0550214 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2243  polysaccharide biosynthesis/export protein  33.17 
 
 		 348 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2300  polysaccharide biosynthesis/export protein  33.17 
 
 		 348 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.480899 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2351  polysaccharide biosynthesis/export protein  33.17 
 
 		 351 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1000  polysaccharide biosynthesis/export protein  33.65 
 
 		 379 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4409  polysaccharide export protein  30.5 
 
 		 368 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1352  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  30.34 
 
 		 396 aa  94.4  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2365  polysaccharide export protein  26.71 
 
 		 282 aa  93.2  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1092  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  29.63 
 
 		 386 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2867  polysaccharide export protein  30.26 
 
 		 378 aa  92.8  6e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1712  polysaccharide export protein  29.66 
 
 		 386 aa  92.4  6e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69321  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2894  polysaccharide export protein  31.25 
 
 		 377 aa  92.4  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0993342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4275  polysaccharide export protein  30.5 
 
 		 368 aa  92.4  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1099  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  29.26 
 
 		 386 aa  92.4  7e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0031657  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00986  predicted exopolysaccharide export protein  29.26 
 
 		 379 aa  92.4  8e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1219  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  29.26 
 
 		 379 aa  92.4  8e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2660  polysaccharide export protein  29.26 
 
 		 379 aa  92.4  8e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00993  hypothetical protein  29.26 
 
 		 379 aa  92.4  8e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4430  polysaccharide export protein  30.5 
 
 		 368 aa  92  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.756533  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2332  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  29.26 
 
 		 386 aa  92.4  8e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.132677  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0794  polysaccharide export protein  27.78 
 
 		 869 aa  92  9e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3036  polysaccharide export protein  27.78 
 
 		 378 aa  92  9e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1985  outer membrane protein, putative  26.17 
 
 		 282 aa  91.7  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  32.92 
 
 		 205 aa  91.7  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1669  polysaccharide export protein  30.92 
 
 		 347 aa  92  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2717  polysaccharide export protein  32.26 
 
 		 379 aa  91.3  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.335454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1296  polysaccharide export protein  28.15 
 
 		 378 aa  90.9  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.660258  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3278  polysaccharide export protein  30.37 
 
 		 390 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.828407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  28.15 
 
 		 373 aa  90.9  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4093  hypothetical protein  29.7 
 
 		 356 aa  90.9  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.818341  normal  0.104815 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2613  polysaccharide export protein  28.89 
 
 		 379 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.139508 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1463  putative polysaccharide export protein  28.04 
 
 		 352 aa  90.5  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.24713e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2584  polysaccharide export protein  28.1 
 
 		 288 aa  90.5  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2236  polysaccharide export protein  30.15 
 
 		 948 aa  89.7  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.987184  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4086  polysaccharide export protein  28.68 
 
 		 360 aa  89.7  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.194923  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01391  exopolysaccharide xanthan biosynthesis export protein GumB  33.74 
 
 		 232 aa  90.1  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1842  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  32.32 
 
 		 781 aa  89.4  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.749239  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1482  polysaccharide export protein  28.85 
 
 		 270 aa  89  8e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.242862  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  29.52 
 
 		 473 aa  89  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0599  polysaccharide export protein  28.64 
 
 		 580 aa  89  8e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000541966  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4241  polysaccharide export protein  29.63 
 
 		 417 aa  89  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.238114 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1538  GumB protein  28.37 
 
 		 249 aa  88.6  1e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1020  EPS I polysaccharide export outer membrane transmembrane protein  27.9 
 
 		 381 aa  87  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.784638  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5370  polysaccharide export protein  28.47 
 
 		 391 aa  87  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3274  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.21 
 
 		 446 aa  87  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3222  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.21 
 
 		 400 aa  86.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5851  EPS I polysaccharide export outer membrane protein  28.26 
 
 		 362 aa  86.7  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0277  polysaccharide export periplasmic protein  29.2 
 
 		 869 aa  86.3  6e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1399  polysaccharide export protein  26.99 
 
 		 920 aa  85.9  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00159215  normal  0.0100644 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2478  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  29.13 
 
 		 268 aa  85.9  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3260  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.84 
 
 		 422 aa  85.9  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.14085  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3645  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.41 
 
 		 920 aa  85.5  9e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1769  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  28.74 
 
 		 268 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2475  polysaccharide export protein  27.24 
 
 		 283 aa  84.7  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4055  polysaccharide export protein  28.89 
 
 		 390 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1189  polysaccharide export protein  28.42 
 
 		 387 aa  84.7  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0530  polysaccharide export protein  29.9 
 
 		 1055 aa  84.7  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.925852 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1175  polysaccharide biosynthesis/export protein  40.5 
 
 		 152 aa  83.6  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.265571  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3196  polysaccharide export protein  32.68 
 
 		 391 aa  84  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.622788  normal  0.189888 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0509  putative polysaccharide export, outer membrane protein, epsA  29.04 
 
 		 350 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>