More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02209 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_02209  Biotin biosynthesis protein BioC  100 
 
 
325 aa  668  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.28779  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2555  methyltransferase type 11  35.51 
 
 
315 aa  135  8e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00279696  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  31.92 
 
 
312 aa  121  2e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  32.81 
 
 
268 aa  120  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5173  biotin biosynthesis protein BioC  34.73 
 
 
268 aa  119  9e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0205142  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4085  biotin biosynthesis protein BioC  34.78 
 
 
267 aa  118  1e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0497  biotin synthesis protein BioC  32.31 
 
 
269 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.572424  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4684  biotin synthesis protein BioC  31.68 
 
 
269 aa  115  1e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.701434  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0603  putative biotin synthesis protein BioC  34.19 
 
 
274 aa  114  2e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  32.27 
 
 
255 aa  113  4e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06540  putative biotin synthesis protein BioC  33.76 
 
 
274 aa  111  2e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  31.64 
 
 
268 aa  111  2e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2537  biotin biosynthesis protein BioC  29.8 
 
 
260 aa  108  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000300876  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1477  methyltransferase type 11  31.8 
 
 
254 aa  107  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2962  biotin biosynthesis protein BioC  27.78 
 
 
253 aa  107  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0381627  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  31.28 
 
 
275 aa  107  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1721  methyltransferase type 11  35.1 
 
 
309 aa  105  7e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0157757  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0925  biotin biosynthesis protein BioC  30.92 
 
 
251 aa  105  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  3.10618e-05  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1507  biotin biosynthesis protein BioC  28.17 
 
 
253 aa  104  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  6.3017e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0800  biotin biosynthesis protein BioC  30.52 
 
 
251 aa  104  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  1.19753e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1922  biotin biosynthesis protein BioC  28.73 
 
 
279 aa  103  4e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152258  decreased coverage  0.00125244 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2575  biotin biosynthesis protein BioC  30.12 
 
 
251 aa  103  4e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  8.03036e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  29.55 
 
 
558 aa  103  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0395  biotin biosynthesis protein BioC  34.15 
 
 
272 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0883344  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0840  biotin biosynthesis protein BioC  30.12 
 
 
251 aa  102  9e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  1.58566e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0391  biotin biosynthesis protein BioC  33.74 
 
 
276 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0248  biotin biosynthesis protein BioC  28.51 
 
 
253 aa  101  2e-20  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.996866  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00744  predicted methltransferase, enzyme of biotin synthesis  29.72 
 
 
251 aa  101  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  7.40427e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0844  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.02 
 
 
269 aa  101  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00761  hypothetical protein  29.72 
 
 
251 aa  101  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  8.73779e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2866  biotin biosynthesis protein BioC  29.72 
 
 
251 aa  101  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  5.76262e-06  normal  0.0541364 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0831  biotin biosynthesis protein BioC  29.72 
 
 
251 aa  101  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.07707e-14  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2865  biotin biosynthesis protein BioC  29.72 
 
 
251 aa  101  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  1.34794e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0365  biotin biosynthesis protein BioC  33.74 
 
 
272 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380868  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2738  biotin synthesis protein BioC  31.37 
 
 
275 aa  100  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2357  biotin biosynthesis protein BioC  31.34 
 
 
275 aa  100  5e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  2.0473e-06 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1268  biotin biosynthesis protein BioC  27.13 
 
 
251 aa  99  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00543221  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  32.86 
 
 
267 aa  96.7  5e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2343  biotin biosynthesis protein BioC  29.89 
 
 
269 aa  96.3  6e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2517  biotin biosynthesis protein BioC  30.6 
 
 
275 aa  96.3  7e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  2.57486e-08 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2429  biotin biosynthesis protein BioC  30.77 
 
 
275 aa  95.9  8e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0131748 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1803  methyltransferase type 11  30.31 
 
 
256 aa  94.7  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06010  biotin synthesis protein BioC  30.49 
 
 
267 aa  95.1  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.746653  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0946  biotin biosynthesis protein BioC  28.92 
 
 
251 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000915647  normal  0.885447 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0832  biotin biosynthesis protein BioC  28.92 
 
 
251 aa  93.6  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  1.89171e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1753  methyltransferase type 11  33.18 
 
 
367 aa  93.6  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.757271  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1132  biotin biosynthesis protein BioC  27.27 
 
 
307 aa  93.2  5e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4837  biotin biosynthesis protein BioC  32.52 
 
 
272 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.672386 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1663  biotin biosynthesis protein  26.85 
 
 
268 aa  92.8  7e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.63598e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0891  biotin biosynthesis protein BioC  28.92 
 
 
251 aa  92.4  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0441055  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0860  biotin biosynthesis protein BioC  28.92 
 
 
251 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00894914  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  26.79 
 
 
291 aa  90.9  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0923  biotin biosynthesis protein BioC  28.51 
 
 
251 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00600636  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1760  methyltransferase type 11  32.73 
 
 
320 aa  89.7  5e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  30.36 
 
 
291 aa  89.7  7e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  27.07 
 
 
292 aa  89.4  7e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  8.94072e-06 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2440  Methyltransferase type 11  31.16 
 
 
216 aa  89  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0165065  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  27.07 
 
 
292 aa  89  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  28.72 
 
 
272 aa  87.8  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  25.61 
 
 
265 aa  87.8  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  28.41 
 
 
271 aa  87.8  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1128  biotin synthesis protein BioC  30.12 
 
 
275 aa  88.2  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1660  methyltransferase type 11  30.55 
 
 
309 aa  87.4  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2774  biotin biosynthesis protein BioC  32.87 
 
 
266 aa  85.1  1e-15  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0014139  hitchhiker  0.00911196 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2899  biotin biosynthesis protein BioC  29.32 
 
 
262 aa  85.5  1e-15  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.785116  normal  0.0952013 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2161  biotin biosynthesis protein BioC  27.84 
 
 
291 aa  84  3e-15  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3856  methyltransferase type 11  31.13 
 
 
264 aa  84  3e-15  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1868  methyltransferase type 11  29.06 
 
 
263 aa  83.2  5e-15  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00760268  decreased coverage  3.22294e-07 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1440  biotin synthesis protein BioC  31.13 
 
 
248 aa  82  1e-14  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00159982  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2525  Methyltransferase type 11  29.79 
 
 
383 aa  81.6  1e-14  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.991475  normal  0.34904 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2091  methyltransferase type 11  31.28 
 
 
278 aa  80.5  3e-14  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00620726  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  40.95 
 
 
238 aa  80.5  3e-14  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3244  methyltransferase type 11  28.25 
 
 
280 aa  79.7  6e-14  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2929  biotin biosynthesis protein BioC  28.21 
 
 
267 aa  79.7  6e-14  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1797  methyltransferase type 11  29.87 
 
 
374 aa  79.7  6e-14  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.105535  normal  0.766979 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1427  biotin synthesis protein BioC  28.21 
 
 
267 aa  79.3  7e-14  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0014  putative methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis  27.36 
 
 
253 aa  79  1e-13  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0157  biotin biosynthesis protein BioC  29.28 
 
 
290 aa  79  1e-13  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0822  biotin biosynthesis protein BioC  28.29 
 
 
295 aa  77.8  2e-13  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  33.04 
 
 
243 aa  78.2  2e-13  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0960  biotin biosynthesis protein BioC  31.21 
 
 
295 aa  77.8  2e-13  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131557  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2842  biotin biosynthesis protein BioC  28.21 
 
 
267 aa  78.2  2e-13  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2098  biotin biosynthesis protein BioC  25.96 
 
 
309 aa  77.4  3e-13  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3454  methyltransferase type 11  29.3 
 
 
270 aa  77  4e-13  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0833  Methyltransferase type 11  28.63 
 
 
267 aa  77  4e-13  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741572  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  36.8 
 
 
268 aa  76.3  7e-13  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  31.21 
 
 
233 aa  76.3  8e-13  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  1.56795e-05 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  28.29 
 
 
295 aa  75.1  1e-12  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  33.58 
 
 
240 aa  75.9  1e-12  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  25.99 
 
 
309 aa  75.5  1e-12  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2627  biotin synthesis protein, putative  26.79 
 
 
267 aa  73.9  3e-12  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3428  Methyltransferase type 11  29 
 
 
267 aa  73.6  4e-12  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.512533 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.86 
 
 
233 aa  73.2  5e-12  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.62 
 
 
252 aa  73.6  5e-12  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.83 
 
 
237 aa  73.6  5e-12  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0035  putative biotin synthesis protein BioC  27.14 
 
 
249 aa  73.2  5e-12  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.194452  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  36.44 
 
 
247 aa  73.6  5e-12  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.62 
 
 
235 aa  73.2  6e-12  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2279  hypothetical protein  26.98 
 
 
284 aa  72  1e-11  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1913  methyltransferase  35.64 
 
 
236 aa  71.6  2e-11  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>