85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01121 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01121  putative lipoprotein  100 
 
 		 190 aa  383  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4149  putative lipoprotein  52.27 
 
 		 190 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1839  putative lipoprotein  33.85 
 
 		 193 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1996  putative lipoprotein  41.61 
 
 		 197 aa  107  1e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.150044  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1057  putative lipoprotein  34.04 
 
 		 197 aa  102  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06518  hypothetical protein  35.76 
 
 		 259 aa  88.6  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1395  putative lipoprotein  31.61 
 
 		 228 aa  85.1  5e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.483754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000649  hypothetical protein  33.94 
 
 		 259 aa  85.1  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2686  putative lipoprotein  32.97 
 
 		 195 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.298289 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0436  putative lipoprotein  32.62 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2706  putative lipoprotein  30.6 
 
 		 192 aa  79  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118422  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1531  putative lipoprotein  30.11 
 
 		 214 aa  78.2  0.00000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.009595  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1218  putative lipoprotein  32.62 
 
 		 194 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2685  putative lipoprotein  29.67 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.29359 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3808  hypothetical protein  37.18 
 
 		 194 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4555  hypothetical protein  37.18 
 
 		 194 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.162066  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3716  hypothetical protein  37.18 
 
 		 194 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.663624  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2288  hypothetical protein  34.86 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.805561  normal  0.288664 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1705  hypothetical protein  31.35 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.255734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2123  putative lipoprotein  29.17 
 
 		 194 aa  64.7  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0746601 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3709  hypothetical protein  33.9 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.145903 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5534  hypothetical protein  33.9 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4930  hypothetical protein  34.29 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.171389 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0255  putative lipoprotein  32.11 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2501  putative lipoprotein  32.11 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.309797  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2640  putative lipoprotein  32.11 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00196399  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1437  putative lipoprotein  32.11 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0936  putative lipoprotein  32.11 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1634  putative lipoprotein  32.45 
 
 		 188 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0290  putative lipoprotein  32.45 
 
 		 188 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79417  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1794  hypothetical protein  31.61 
 
 		 195 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1822  hypothetical protein  32.18 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.134902  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2163  putative lipoprotein  31.61 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1341  putative lipoprotein  32.12 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00268947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1389  hypothetical protein  32.76 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.730417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5337  putative lipoprotein  31.55 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665264  normal  0.0273099 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5185  hypothetical protein  32.18 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2167  hypothetical protein  30.11 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0530  putative lipoprotein  33.52 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1692  hypothetical protein  29.63 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2253  putative lipoprotein  31.03 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.176921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1908  hypothetical protein  31.03 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000419973 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1885  hypothetical protein  31.03 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6194  hypothetical protein  31.03 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1757  putative lipoprotein  31.46 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0708212  normal  0.314425 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2432  putative lipoprotein  31.61 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1416  putative lipoprotein  31.61 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.388983  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1878  putative lipoprotein  30.51 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1907  putative lipoprotein  31.61 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.96714  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3397  putative lipoprotein  31.61 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.692423  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1180  putative lipoprotein  31.61 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374226  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2310  putative lipoprotein  31.61 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.539087  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2270  putative lipoprotein  31.61 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.581117  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2079  putative lipoprotein  32.43 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.983785 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3821  hypothetical protein  30.52 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.370045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3834  protein of unknown function DUF500  23.71 
 
 		 229 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1949  putative lipoprotein  31.61 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.234759 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4203  putative lipoprotein  33.12 
 
 		 195 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1051  putative lipoprotein  30.46 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.670756  normal  0.850413 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1352  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  25.54 
 
 		 190 aa  51.6  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2882  putative lipoprotein  27.49 
 
 		 192 aa  51.6  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0772  putative lipoprotein  30.56 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.661854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1450  protein of unknown function DUF500  24.54 
 
 		 230 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.552801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4453  putative lipoprotein  29.49 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00120805  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1078  protein of unknown function DUF500  26.67 
 
 		 231 aa  49.7  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64686e-30 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3102  putative lipoprotein  29.38 
 
 		 198 aa  48.5  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0926165  normal  0.0477167 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6449  putative lipoprotein  32.03 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.202926 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3437  hypothetical protein  24.14 
 
 		 182 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0392  hypothetical protein  24.26 
 
 		 187 aa  46.2  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0481  putative lipoprotein  29.03 
 
 		 194 aa  45.8  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4205  hypothetical protein  25.12 
 
 		 188 aa  44.7  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2847  hypothetical protein  29.11 
 
 		 189 aa  44.3  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1446  hypothetical protein  29.11 
 
 		 185 aa  44.3  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.173409  normal  0.115639 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0010  hypothetical protein  27.08 
 
 		 186 aa  43.9  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.019528  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1170  hypothetical protein  28.46 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.215934  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3083  hypothetical protein  26.55 
 
 		 231 aa  43.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0421  hypothetical protein  26.34 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0256  hypothetical protein  26.04 
 
 		 192 aa  43.1  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.140165  normal  0.0986563 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4192  protein of unknown function DUF500  26.87 
 
 		 236 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2146  protein of unknown function DUF500  27.57 
 
 		 222 aa  42.4  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0013338  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3182  protein of unknown function DUF500  25.79 
 
 		 231 aa  42.4  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00271235  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2073  protein of unknown function DUF500  30.94 
 
 		 222 aa  42  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000191857 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5219  hypothetical protein  26.11 
 
 		 188 aa  42  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.307666 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15731  hypothetical protein  27.07 
 
 		 203 aa  41.6  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.448321 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1564  hypothetical protein  25.84 
 
 		 189 aa  41.2  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00127888  normal  0.0974108 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>