165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3290 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_3290  hypothetical protein  100 
 
 
367 aa  703    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5254  protein of unknown function DUF185  79.51 
 
 
367 aa  533  1e-150  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3007  protein of unknown function DUF185  63.82 
 
 
362 aa  357  9.999999999999999e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2549  hypothetical protein  60.29 
 
 
368 aa  358  9.999999999999999e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.569612  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5412  hypothetical protein  62.85 
 
 
356 aa  354  2e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3876  hypothetical protein  52.19 
 
 
376 aa  352  5e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.234317  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2884  hypothetical protein  61.84 
 
 
361 aa  351  8.999999999999999e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.43196  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3110  protein of unknown function DUF185  62.75 
 
 
361 aa  345  5e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.922104  normal  0.232642 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2503  hypothetical protein  51.79 
 
 
390 aa  345  5e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.156222  normal  0.549612 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4165  hypothetical protein  51.52 
 
 
376 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.576249  normal  0.0725771 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3094  hypothetical protein  50 
 
 
375 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1764  hypothetical protein  48.47 
 
 
375 aa  330  2e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526416  normal  0.881912 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4843  protein of unknown function DUF185  49.86 
 
 
379 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1412  hypothetical protein  47.55 
 
 
375 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00525557  normal  0.308753 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3534  hypothetical protein  50.27 
 
 
386 aa  315  6e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.196392  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2261  hypothetical protein  52.25 
 
 
356 aa  306  4.0000000000000004e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1134  protein of unknown function DUF185  51.7 
 
 
369 aa  294  2e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0347191 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2759  protein of unknown function DUF185  45.03 
 
 
366 aa  288  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.511112  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3022  protein of unknown function DUF185  43.92 
 
 
366 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.838138  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2253  hypothetical protein  44.35 
 
 
367 aa  271  1e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.262355  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0642  hypothetical protein  51.52 
 
 
364 aa  268  8e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.175347  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1638  hypothetical protein  43.09 
 
 
363 aa  267  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3172  hypothetical protein  43.92 
 
 
377 aa  259  4e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0778857  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2151  hypothetical protein  43.52 
 
 
358 aa  259  6e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0956088  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0619  hypothetical protein  46.05 
 
 
357 aa  256  3e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.770562  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2212  hypothetical protein  49.28 
 
 
355 aa  257  3e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2650  hypothetical protein  48.85 
 
 
363 aa  256  6e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1529  hypothetical protein  41.8 
 
 
365 aa  253  5.000000000000001e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0760  hypothetical protein  42.94 
 
 
366 aa  252  6e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.562403 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0995  hypothetical protein  37.39 
 
 
366 aa  252  9.000000000000001e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.199095  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1478  hypothetical protein  41.53 
 
 
365 aa  251  2e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00590219  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0259  hypothetical protein  51.75 
 
 
353 aa  243  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.655158 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0231  hypothetical protein  53.98 
 
 
353 aa  242  9e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0717  hypothetical protein  34.55 
 
 
349 aa  240  2.9999999999999997e-62  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0679  hypothetical protein  46.86 
 
 
351 aa  234  1.0000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0424  hypothetical protein  45.06 
 
 
324 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0313  hypothetical protein  35.78 
 
 
335 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.368023  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0487  hypothetical protein  47.08 
 
 
356 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0673  hypothetical protein  44.42 
 
 
402 aa  234  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1230  hypothetical protein  45 
 
 
351 aa  232  7.000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.369365  normal  0.219943 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1579  hypothetical protein  54.51 
 
 
351 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1092  protein of unknown function DUF185  46.76 
 
 
339 aa  228  1e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.192418  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0762  hypothetical protein  35.14 
 
 
335 aa  228  1e-58  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.244362  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41366  predicted protein  40.16 
 
 
461 aa  226  4e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.151662  normal  0.0721349 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3334  hypothetical protein  46.54 
 
 
371 aa  226  5.0000000000000005e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.47011 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00510  conserved hypothetical protein  36.04 
 
 
449 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0601  hypothetical protein  35 
 
 
323 aa  220  3e-56  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.434393  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68115  predicted protein  30.51 
 
 
515 aa  188  1e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06041  DUF185 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G09740)  30.13 
 
 
504 aa  176  8e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.115857  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2755  hypothetical protein  32.79 
 
 
370 aa  150  4e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0626  protein of unknown function DUF185  27.18 
 
 
384 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.925683  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2597  protein of unknown function DUF185  38.04 
 
 
384 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3621  hypothetical protein  32.87 
 
 
393 aa  135  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385343  normal  0.0821404 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3044  protein of unknown function DUF185  29.95 
 
 
387 aa  132  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4813  hypothetical protein  29.21 
 
 
397 aa  129  8.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15641  predicted protein  31.41 
 
 
349 aa  129  1.0000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0510  protein of unknown function DUF185  34.07 
 
 
362 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1649  protein of unknown function DUF185  28.27 
 
 
386 aa  126  7e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0325386  hitchhiker  0.0000000752417 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1091  hypothetical protein  33.33 
 
 
387 aa  125  1e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.25042  decreased coverage  0.00000118713 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0104  hypothetical protein  33.8 
 
 
404 aa  125  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0497  hypothetical protein  33.81 
 
 
366 aa  124  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0818401 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3205  hypothetical protein  30.66 
 
 
404 aa  123  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2351  protein of unknown function DUF185  29.84 
 
 
410 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1815  hypothetical protein  30.08 
 
 
394 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.520553  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0045  protein of unknown function DUF185  34.11 
 
 
397 aa  119  6e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3886  hypothetical protein  30.6 
 
 
394 aa  119  7.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.643173  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3084  hypothetical protein  31.37 
 
 
385 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0230  hypothetical protein  34.49 
 
 
386 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.885139 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1418  protein of unknown function DUF185  30.29 
 
 
385 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2793  protein of unknown function DUF185  29.91 
 
 
386 aa  116  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.425322  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0943  hypothetical protein  31.61 
 
 
385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000189258  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0048  protein of unknown function DUF185  33.42 
 
 
397 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.244588 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2895  hypothetical protein  33.16 
 
 
397 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0689127 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0203  hypothetical protein  34.88 
 
 
396 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0037  hypothetical protein  32.59 
 
 
393 aa  108  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1451  hypothetical protein  32.62 
 
 
410 aa  108  2e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0695553 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1251  hypothetical protein  31.5 
 
 
337 aa  108  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0057  hypothetical protein  30.64 
 
 
417 aa  107  4e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0155  hypothetical protein  33.6 
 
 
397 aa  106  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.621796  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0697  protein of unknown function DUF185  36.54 
 
 
391 aa  107  5e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3870  protein of unknown function DUF185  29.31 
 
 
377 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.774483 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3820  protein of unknown function DUF185  27.44 
 
 
377 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2027  hypothetical protein  30.36 
 
 
388 aa  105  9e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3429  protein of unknown function DUF185  32.45 
 
 
394 aa  105  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0192039 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0476  hypothetical protein  31.14 
 
 
386 aa  104  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07541  hypothetical protein  26.02 
 
 
396 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07341  hypothetical protein  25.14 
 
 
396 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1711  protein of unknown function DUF185  29.28 
 
 
395 aa  103  7e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.676361  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0153  protein of unknown function DUF185  35.29 
 
 
398 aa  102  8e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.850011  normal  0.50101 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0681  hypothetical protein  26.23 
 
 
396 aa  102  9e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.954033  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0294  hypothetical protein  35.14 
 
 
410 aa  102  9e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1049  hypothetical protein  30.97 
 
 
392 aa  101  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0950573  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0329  protein of unknown function DUF185  34.77 
 
 
393 aa  101  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0602  protein of unknown function DUF185  32.71 
 
 
398 aa  101  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.758537  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4224  hypothetical protein  33.52 
 
 
376 aa  101  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.203293 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3733  protein of unknown function DUF185  34.32 
 
 
396 aa  101  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0278081  normal  0.709484 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2887  hypothetical protein  34.88 
 
 
396 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1996  hypothetical protein  28.34 
 
 
395 aa  100  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07361  hypothetical protein  26.2 
 
 
396 aa  100  5e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1466  hypothetical protein  30.94 
 
 
369 aa  100  6e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>