224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1678 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_1678  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
145 aa  292  1e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.71411 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0966  thioesterase superfamily protein  90.21 
 
 
145 aa  265  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3395  thioesterase superfamily protein  75 
 
 
153 aa  216  6e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3704  thioesterase superfamily protein  77.54 
 
 
153 aa  216  6e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3586  thioesterase superfamily protein  76.81 
 
 
153 aa  216  7.999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4557  thioesterase superfamily protein  68.28 
 
 
145 aa  202  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.215777  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1202  thioesterase superfamily protein  67.83 
 
 
175 aa  201  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000375293  normal  0.571615 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0931  thioesterase superfamily protein  67.59 
 
 
145 aa  201  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1391  thioesterase superfamily protein  67.59 
 
 
145 aa  201  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.243667 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1413  thioesterase superfamily protein  67.59 
 
 
145 aa  201  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236272  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1293  thioesterase superfamily protein  67.13 
 
 
145 aa  200  6e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263092  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2654  thioesterase family protein  69.01 
 
 
203 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1332  thioesterase superfamily protein  66.43 
 
 
145 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0269982  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1769  thioesterase superfamily protein  66.2 
 
 
147 aa  196  7e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201031  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1317  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  65.25 
 
 
149 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1611  thioesterase superfamily protein  68.84 
 
 
147 aa  193  8.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal  0.904244 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1902  thioesterase superfamily protein  66.9 
 
 
163 aa  192  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.119468 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1939  thioesterase superfamily protein  68.84 
 
 
147 aa  192  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  hitchhiker  0.00402541 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1824  thioesterase family protein  68.38 
 
 
181 aa  192  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.814646  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0719  thioesterase family protein  68.38 
 
 
149 aa  192  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1437  thioesterase family protein  68.38 
 
 
181 aa  192  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0443  thioesterase family protein  68.38 
 
 
149 aa  192  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1648  thioesterase family protein  68.38 
 
 
149 aa  192  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129475  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1670  thioesterase family protein  69.4 
 
 
149 aa  191  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.895942  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4741  thioesterase superfamily protein  68.09 
 
 
153 aa  190  5e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0117203  normal  0.418796 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1614  thioesterase superfamily protein  66.21 
 
 
155 aa  189  9e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000153197  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3086  thioesterase superfamily protein  66.9 
 
 
147 aa  187  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000791205  normal  0.0550819 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2835  thioesterase superfamily protein  67.16 
 
 
142 aa  186  7e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2141  thioesterase superfamily protein  62.68 
 
 
164 aa  185  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000226869  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1608  thioesterase superfamily protein  64.54 
 
 
150 aa  186  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1882  thioesterase superfamily protein  64.54 
 
 
144 aa  186  1e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1644  thioesterase superfamily protein  59.29 
 
 
148 aa  183  7e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2819  thioesterase superfamily protein  62.41 
 
 
149 aa  180  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.453856  normal  0.118463 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1508  putative thioesterase  68.94 
 
 
153 aa  178  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0888126  normal  0.372254 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1367  thioesterase superfamily protein  64.29 
 
 
162 aa  177  4e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000075245  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3281  hypothetical protein  63.19 
 
 
150 aa  177  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.704366  normal  0.549682 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2066  thioesterase superfamily protein  66.92 
 
 
160 aa  177  4.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  hitchhiker  0.00365834 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2493  thioesterase superfamily protein  63.57 
 
 
162 aa  176  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808355  normal  0.025023 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0382  thioesterase superfamily protein  57.86 
 
 
143 aa  173  6e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3262  putative thioesterase  62.5 
 
 
143 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.849103  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3994  thioesterase superfamily protein  62.5 
 
 
143 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3106  thioesterase superfamily protein  59.85 
 
 
156 aa  169  9e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346336  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0277  thioesterase superfamily protein  57.97 
 
 
143 aa  169  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0872113 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3308  thioesterase superfamily protein  63.24 
 
 
188 aa  169  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.362677  normal  0.831787 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37230  predicted thioesterase  58.33 
 
 
136 aa  169  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0929724 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2340  thioesterase superfamily protein  55.71 
 
 
148 aa  167  4e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.280619  normal  0.0595669 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68490  hypothetical protein  60.58 
 
 
147 aa  166  8e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.222508 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5927  hypothetical protein  61.03 
 
 
147 aa  166  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.266343  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4906  thioesterase superfamily protein  60.29 
 
 
142 aa  165  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.825665  normal  0.173535 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0906  thioesterase family protein  71.68 
 
 
125 aa  164  5e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.661315  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5015  thioesterase superfamily protein  60.45 
 
 
137 aa  161  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.168597  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2050  hypothetical protein  56.62 
 
 
150 aa  160  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00110893  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3691  thioesterase superfamily protein  56.62 
 
 
150 aa  158  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0426  thioesterase superfamily protein  54.29 
 
 
155 aa  157  4e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5810  thioesterase superfamily protein  56.12 
 
 
143 aa  157  4e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6680  thioesterase  54.96 
 
 
142 aa  155  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0588358  normal  0.343275 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4685  thioesterase superfamily protein  53.38 
 
 
138 aa  149  8.999999999999999e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1213  thioesterase superfamily protein  59.09 
 
 
150 aa  148  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00301171  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10164  hypothetical protein  46.9 
 
 
151 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0112  thioesterase superfamily protein  50 
 
 
147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0121  thioesterase superfamily protein  50 
 
 
147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.750457  normal  0.0163891 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0102  thioesterase superfamily protein  50 
 
 
147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.208156 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1026  thioesterase superfamily protein  54.14 
 
 
137 aa  145  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3146  thioesterase superfamily protein  52.24 
 
 
143 aa  141  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433869  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04031  thioesterase family protein domain protein  47.55 
 
 
145 aa  140  5e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3272  thioesterase superfamily protein  48.95 
 
 
149 aa  123  9e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.96014  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1058  putative thioesterase  44.06 
 
 
151 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4956  thioesterase superfamily protein  38.19 
 
 
146 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000294278 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0254  thioesterase superfamily protein  37.76 
 
 
146 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0152562 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0279  thioesterase superfamily protein  37.76 
 
 
146 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0269  thioesterase superfamily protein  37.76 
 
 
146 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07356  thioesterase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G16350)  36.23 
 
 
169 aa  100  7e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.374208 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1657  thioesterase superfamily protein  30.15 
 
 
139 aa  73.2  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0815  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 
139 aa  72.8  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.545456  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2261  thioesterase superfamily protein  29.32 
 
 
161 aa  72  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1590  thioesterase superfamily protein  33.86 
 
 
135 aa  72  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.359349  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1937  thioesterase superfamily protein  31.34 
 
 
136 aa  72  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00538677  normal  0.170289 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1238  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.546619  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1167  acyl-CoA thioesterase  27.42 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2356  hypothetical protein  33.82 
 
 
134 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2611  thioesterase family protein  37.5 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27910  hypothetical protein  33.09 
 
 
134 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1693  thioesterase family protein  32.37 
 
 
159 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2836  thioesterase superfamily protein  35 
 
 
146 aa  67.4  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3287  thioesterase superfamily protein  28.26 
 
 
140 aa  67.4  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0335707  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  33.87 
 
 
134 aa  67  0.00000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  32.56 
 
 
139 aa  66.6  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1926  thioesterase superfamily protein  36 
 
 
136 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1114  thioesterase family protein  33.6 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0224064  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2925  hypothetical protein  33.61 
 
 
130 aa  65.5  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1871  thioesterase family protein  33.6 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0652374  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1364  putative thioesterase  32.81 
 
 
134 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1556  thioesterase family protein  33.6 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000380649  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0944  thioesterase family protein  33.6 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0217  thioesterase family protein  33.6 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0748592  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1717  thioesterase family protein  33.6 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1565  thioesterase superfamily protein  32.03 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4608  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
143 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00844353  normal  0.865959 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0981  thioesterase superfamily protein  33.59 
 
 
146 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1117  thioesterase superfamily protein  31.45 
 
 
135 aa  62.8  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235483  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>