More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0073 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_0073  ABC transporter related  100 
 
 
223 aa  424  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.606283 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2240  ABC transporter related  74.37 
 
 
206 aa  257  8e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.748351  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7996  ABC transporter related  74.87 
 
 
206 aa  243  2e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0883006  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0768  ABC transporter related  57.92 
 
 
199 aa  189  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0166  ABC transporter related  54.75 
 
 
225 aa  157  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0701  ABC transporter related  46.19 
 
 
197 aa  152  3e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3634  ABC transporter related  45.5 
 
 
212 aa  147  1e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0129  ABC transporter related  40.51 
 
 
202 aa  144  1e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00335673  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0122  ABC transporter related protein  46.63 
 
 
205 aa  136  3e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.60914  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1836  ABC transporter, ATPase subunit  49.21 
 
 
209 aa  135  5e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2409  ABC transporter related  45.5 
 
 
201 aa  132  3e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0197  ABC transporter related protein  44.61 
 
 
206 aa  131  8e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.994247 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2103  ABC transporter related  40.1 
 
 
213 aa  130  1e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.71434  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0077  ABC transporter related  44.81 
 
 
216 aa  124  9e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0734436  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3121  ABC transporter related  45.64 
 
 
207 aa  124  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.522166  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0688  ABC transporter, ATP-binding protein  30.96 
 
 
218 aa  101  8e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.580982  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2267  ABC transporter, ATP-binding protein  39.9 
 
 
276 aa  100  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.600879  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1728  ABC transporter related  37.88 
 
 
277 aa  99.4  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03591  ABC transporter ATP-binding protein  39.8 
 
 
260 aa  94.7  9e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.183875  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2481  ABC transporter related  30.37 
 
 
220 aa  94  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000539797  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2530  ABC transporter related  30.37 
 
 
220 aa  94  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00573558  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1442  ABC transporter related  38.78 
 
 
315 aa  92.8  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4070  ABC transporter related protein  37 
 
 
360 aa  93.2  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.522742  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5942  ABC transporter related protein  36.55 
 
 
227 aa  92  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2038  ABC transporter, ATP-binding protein  28.57 
 
 
220 aa  92  6e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436914  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4667  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  34.32 
 
 
225 aa  90.9  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1778  ABC transporter related  31.09 
 
 
271 aa  90.9  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00372314 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0933  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  31.58 
 
 
212 aa  90.9  1e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  4.01651e-08  normal  0.238349 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1894  ABC transporter-related protein  39.78 
 
 
365 aa  90.1  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5449  ABC transporter related  34.83 
 
 
622 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.89957  normal  0.0448259 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1797  ABC transporter, ATP-binding protein  39.29 
 
 
231 aa  90.1  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.515092  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1808  ABC transporter related  35.26 
 
 
213 aa  89.7  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0422599  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0098  ABC transporter, ATP-binding protein  39.29 
 
 
231 aa  90.1  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.432018  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2189  ABC transporter, ATP-binding protein  39.29 
 
 
231 aa  89.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1068  ABC transporter, ATP-binding protein  39.29 
 
 
231 aa  90.1  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.393113  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4212  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  35.68 
 
 
234 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.869401  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6373  ABC transporter related  34.78 
 
 
254 aa  89.7  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535484  normal  0.530942 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1310  ABC transporter, ATP-binding protein  39.29 
 
 
231 aa  90.1  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2320  ABC transporter, ATP-binding protein  39.29 
 
 
276 aa  89.4  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2152  ABC transporter, ATP-binding protein  39.29 
 
 
264 aa  89.4  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0987  ABC transporter related  37.95 
 
 
246 aa  89  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3621  thiamine transporter ATP-binding subunit  39.36 
 
 
236 aa  89  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.802335  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2671  ABC transporter related  36.63 
 
 
314 aa  88.6  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452313  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0316  ABC transporter related protein  34.97 
 
 
244 aa  88.6  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.815133 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3810  thiamine transporter ATP-binding subunit  38.3 
 
 
234 aa  88.6  8e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0733  ABC transporter related  36.55 
 
 
260 aa  88.6  8e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3636  ABC transporter related protein  32.97 
 
 
288 aa  88.2  8e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.90014  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3157  ABC transporter related protein  37.79 
 
 
240 aa  88.2  8e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2821  ABC transporter, ATPase subunit  36.61 
 
 
237 aa  88.2  8e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.341071  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4546  ABC transporter related  35.52 
 
 
254 aa  87.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.141129 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2294  ABC transporter related protein  33.17 
 
 
255 aa  87.8  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2730  ABC transporter related  36.67 
 
 
225 aa  86.7  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1773  ABC transporter related  37.13 
 
 
233 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.057555  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3077  ABC transporter related  40.43 
 
 
238 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.296256  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  34.69 
 
 
249 aa  86.7  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6306  ABC transporter related  37.13 
 
 
233 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.846899  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8181  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (proline/glycine/betaine)  33.85 
 
 
367 aa  87  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.543085  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0549  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  32.42 
 
 
225 aa  86.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1467  ABC transporter related protein  36.32 
 
 
222 aa  86.7  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2222  putative ATP-binding component of ABC transporter  40.5 
 
 
238 aa  86.3  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.746837  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0556  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  32.42 
 
 
225 aa  86.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2837  ABC transporter related  36.41 
 
 
309 aa  86.3  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.140237  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3236  ABC transporter, ATP-binding protein, NodI family  36.41 
 
 
309 aa  86.3  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0326  ABC transporter related  35.23 
 
 
372 aa  86.3  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0749  ABC transporter ATP-binding protein  37.69 
 
 
230 aa  85.9  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2322  ABC transporter, ATPase subunit  37.62 
 
 
242 aa  85.9  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0551  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  31.87 
 
 
225 aa  85.9  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.522757  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2530  ABC transporter related  33.51 
 
 
326 aa  85.9  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  hitchhiker  0.00171141 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0519  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  33.02 
 
 
364 aa  85.9  5e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  0.744926 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2342  ABC transporter related protein  33.96 
 
 
274 aa  85.5  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.477655  normal  0.561455 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00793  hypothetical protein  33.51 
 
 
240 aa  85.5  7e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0833  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  33.51 
 
 
240 aa  85.1  7e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  1.42512e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0969  ABC transporter related  34.85 
 
 
362 aa  85.1  7e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0177973  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2834  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  33.51 
 
 
240 aa  85.5  7e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.651413  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0865  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  33.51 
 
 
240 aa  85.5  7e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.43659e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1081  ABC transporter related protein  36.82 
 
 
323 aa  85.5  7e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.136277  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0878  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  33.51 
 
 
240 aa  85.1  7e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  3.03797e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  35.2 
 
 
245 aa  85.1  7e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0958  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  33.51 
 
 
240 aa  85.1  7e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00478408  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2539  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  33.51 
 
 
240 aa  85.5  7e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  6.50247e-05  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2833  ABC transporter related protein  33.51 
 
 
240 aa  85.5  7e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0462198  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0610  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  31.87 
 
 
225 aa  85.1  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0566  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  31.87 
 
 
225 aa  85.1  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5204  ABC transporter related protein  35.71 
 
 
270 aa  85.1  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.213509  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2880  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  30.81 
 
 
240 aa  85.1  7e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.37937  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  34.03 
 
 
241 aa  85.1  7e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00776  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  33.51 
 
 
240 aa  85.5  7e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1493  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  31.63 
 
 
240 aa  85.1  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.228694  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4941  ABC transporter related  34.27 
 
 
604 aa  85.1  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.690923  normal  0.361162 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2002  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.08 
 
 
574 aa  85.1  8e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393049  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1582  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  30.81 
 
 
240 aa  85.1  8e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.42936  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2051  ABC transporter related protein  34.78 
 
 
262 aa  85.1  8e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1296  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  32.02 
 
 
240 aa  84.7  9e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.484197  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3967  ABC transporter related protein  33.65 
 
 
255 aa  84.7  9e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0735  thiamine transporter ATP-binding subunit  36.08 
 
 
234 aa  84.7  9e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2397  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.08 
 
 
574 aa  85.1  9e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.894313  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1598  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  31.63 
 
 
240 aa  85.1  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.842708  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21300  ABC transporter, ATP binding component  37.69 
 
 
352 aa  84.7  1e-15  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1815  ABC transporter related  34.85 
 
 
326 aa  84.3  1e-15  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0121521 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26260  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  32.22 
 
 
384 aa  84.3  1e-15  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.560056  normal  0.199017 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>