More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1071 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1451  Alkyl hydroperoxide reductase, large subunit  57.47 
 
 
569 aa  665  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1071  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 
555 aa  1144  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  5.332e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0477  alkyl hydroperoxide reductase F subunit  44.68 
 
 
555 aa  488  1e-137  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000501172  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0785  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  42.73 
 
 
556 aa  435  1e-121  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.182954  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0907  Thioredoxin-disulfide reductase  39.78 
 
 
547 aa  421  1e-116  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  6.75051e-05  normal  0.496773 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25100  thioredoxin reductase  39.05 
 
 
552 aa  400  1e-110  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.19765  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1406  thioredoxin reductase  40.87 
 
 
638 aa  301  2e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  44.77 
 
 
304 aa  272  1e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2721  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  44.23 
 
 
319 aa  272  1e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00682943  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1946  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.44 
 
 
427 aa  259  7e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  6.21838e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0470  thioredoxin reductase  42.01 
 
 
409 aa  257  3e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  44.63 
 
 
304 aa  256  8e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  2.90803e-08  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0764  thioredoxin reductase  44.95 
 
 
308 aa  255  1e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.080052  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0058  thioredoxin reductase  42.76 
 
 
317 aa  254  2e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992397  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  42.68 
 
 
315 aa  254  3e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  4.88903e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0765  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.69 
 
 
316 aa  253  5e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.40354  normal  0.494294 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0058  thioredoxin reductase  42.11 
 
 
317 aa  253  7e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0360012  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3149  thioredoxin reductase  43.08 
 
 
318 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  43.51 
 
 
308 aa  250  5e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.98339e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0376  thioredoxin reductase  41.99 
 
 
310 aa  250  5e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  2.65637e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0855  thioredoxin reductase  43.04 
 
 
316 aa  249  6e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0186179  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  42.01 
 
 
306 aa  245  2e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3701  thioredoxin reductase  41.53 
 
 
318 aa  244  3e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.600246  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  40.32 
 
 
312 aa  243  5e-63  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  42.49 
 
 
332 aa  243  8e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5243  thioredoxin-disulfide reductase  41.21 
 
 
318 aa  242  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5387  thioredoxin reductase  41.21 
 
 
318 aa  242  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  40.78 
 
 
323 aa  242  1e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4951  thioredoxin reductase  41.53 
 
 
318 aa  242  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.414255  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5262  thioredoxin reductase  41.21 
 
 
318 aa  242  1e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5319  thioredoxin-disulfide reductase  41.21 
 
 
318 aa  242  1e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5277  thioredoxin-disulfide reductase  41.21 
 
 
318 aa  242  2e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450322  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2750  thioredoxin-disulfide reductase  42.77 
 
 
312 aa  241  3e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2436  thioredoxin-disulfide reductase  42.77 
 
 
312 aa  241  3e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5007  thioredoxin reductase  40.89 
 
 
321 aa  240  5e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4836  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  40.89 
 
 
321 aa  240  5e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4851  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  40.89 
 
 
321 aa  240  5e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.881258  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0553  thioredoxin reductase  43.69 
 
 
316 aa  240  6e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.860182  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2361  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.04 
 
 
306 aa  240  6e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244772  hitchhiker  0.000649797 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  41.99 
 
 
359 aa  239  9e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5680  thioredoxin-disulfide reductase  40.89 
 
 
318 aa  239  1e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  39.51 
 
 
320 aa  238  2e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3988  thioredoxin reductase  42.44 
 
 
325 aa  237  4e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.717161 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20410  thioredoxin reductase  41.03 
 
 
311 aa  236  6e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  42.07 
 
 
310 aa  234  2e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0860  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.97 
 
 
403 aa  233  5e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  8.28046e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  42.21 
 
 
310 aa  232  1e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  39.35 
 
 
330 aa  232  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  39.3 
 
 
334 aa  231  2e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0823  thioredoxin reductase  36.6 
 
 
396 aa  231  2e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0135  thioredoxin reductase (NADPH)  40.97 
 
 
309 aa  231  4e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  1.36193e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  39.49 
 
 
336 aa  230  5e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2670  thioredoxin reductase  42.64 
 
 
410 aa  228  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.373166  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25220  thioredoxin-disulfide reductase  46.15 
 
 
313 aa  228  2e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  4.19952e-06  normal  0.16334 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0056  thioredoxin reductase  41.85 
 
 
326 aa  228  2e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0432  thioredoxin-disulfide reductase  39.55 
 
 
310 aa  228  3e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  39.43 
 
 
330 aa  227  5e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0788  thioredoxin reductase  39.22 
 
 
311 aa  226  8e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0805  thioredoxin reductase  39.22 
 
 
311 aa  226  8e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  40.71 
 
 
311 aa  226  9e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  37.74 
 
 
331 aa  224  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4637  thioredoxin reductase  36.04 
 
 
456 aa  224  3e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  2.31293e-05  normal  0.140967 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23380  thioredoxin-disulfide reductase  37.84 
 
 
333 aa  223  5e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4232  thioredoxin reductase  38.34 
 
 
318 aa  223  5e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7622  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  41.37 
 
 
319 aa  223  6e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14640  thioredoxin-disulfide reductase  39.94 
 
 
332 aa  223  6e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1197  thioredoxin reductase  39.74 
 
 
311 aa  222  1e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.711369  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0600  thioredoxin reductase  39.54 
 
 
317 aa  222  1e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00298127  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  36.42 
 
 
346 aa  222  1e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  39.56 
 
 
361 aa  221  2e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2879  thioredoxin reductase  43.45 
 
 
312 aa  221  2e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0294  thioredoxin reductase  38.31 
 
 
304 aa  221  2e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3717  thioredoxin reductase  38.83 
 
 
340 aa  222  2e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.00183833 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  40.82 
 
 
334 aa  222  2e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  38.14 
 
 
335 aa  221  2e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0680  thioredoxin reductase  40.12 
 
 
320 aa  221  2e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0359349  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0923  thioredoxin reductase  40.26 
 
 
311 aa  221  3e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  39.74 
 
 
311 aa  220  4e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  7.93818e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0048  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.62 
 
 
407 aa  221  4e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.282171  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4061  thioredoxin reductase  36.52 
 
 
453 aa  220  5e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5401  thioredoxin reductase  35.91 
 
 
361 aa  220  5e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4853  thioredoxin reductase  37.96 
 
 
330 aa  219  7e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0566  thioredoxin reductase  38.19 
 
 
313 aa  219  8e-56  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.302989  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31890  thioredoxin-disulfide reductase  37.86 
 
 
353 aa  219  9e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0254  thioredoxin reductase  38.76 
 
 
308 aa  219  1e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0385075  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4212  thioredoxin reductase  41.03 
 
 
344 aa  219  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.740781  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  39.41 
 
 
310 aa  219  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1013  thioredoxin reductase  36.69 
 
 
308 aa  219  1e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  38.8 
 
 
319 aa  219  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  39.74 
 
 
311 aa  219  1e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  38.19 
 
 
333 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3812  thioredoxin reductase  38.56 
 
 
460 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  41.85 
 
 
325 aa  218  2e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1512  thioredoxin reductase  38.98 
 
 
309 aa  218  2e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  7.15153e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  38.19 
 
 
333 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  38.19 
 
 
333 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1325  thioredoxin reductase  38.91 
 
 
311 aa  218  3e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  5.061e-10  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2685  thioredoxin reductase  40.89 
 
 
318 aa  217  4e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0567  thioredoxin reductase  37.18 
 
 
340 aa  217  4e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  38.51 
 
 
311 aa  217  5e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>