More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0821 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0821  heat shock protein GrpE  100 
 
 		 192 aa  380  1e-105  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.085613  normal  0.503339 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0705  GrpE protein  59.2 
 
 		 190 aa  199  1.9999999999999998e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0594473  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1348  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  45.79 
 
 		 189 aa  152  2e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00499702  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1310  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  54.35 
 
 		 198 aa  152  4e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000765244  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1149  heat shock protein GrpE  45.66 
 
 		 210 aa  140  8e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67207  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0162  heat shock protein GrpE  49.32 
 
 		 204 aa  137  7.999999999999999e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1026  heat shock protein GrpE  49.68 
 
 		 190 aa  137  8.999999999999999e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000103235  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  46.5 
 
 		 208 aa  132  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  46.5 
 
 		 208 aa  132  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  47.3 
 
 		 213 aa  130  9e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  46.26 
 
 		 208 aa  129  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0096  heat shock protein GrpE  47.83 
 
 		 190 aa  122  3e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  44.53 
 
 		 189 aa  116  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0849  heat shock protein GrpE  39.29 
 
 		 175 aa  115  5e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  38.26 
 
 		 190 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0150  co-chaperone GrpE  41.22 
 
 		 179 aa  113  2.0000000000000002e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0073017  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1259  heat shock protein GrpE  44.2 
 
 		 176 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.481119  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0774  heat shock protein GrpE  44.37 
 
 		 176 aa  112  4.0000000000000004e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.142311  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  40.82 
 
 		 192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1359  GrpE protein  35.83 
 
 		 186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000141941  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  40.82 
 
 		 192 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  36.36 
 
 		 201 aa  109  3e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  37.37 
 
 		 217 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  40.14 
 
 		 198 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  36.78 
 
 		 189 aa  108  5e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  42.96 
 
 		 199 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000213319  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  39.46 
 
 		 188 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  39.46 
 
 		 188 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  39.46 
 
 		 188 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  39.46 
 
 		 188 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  39.46 
 
 		 188 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  39.46 
 
 		 188 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2045  co-chaperone GrpE  35.52 
 
 		 180 aa  107  8.000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00817363  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5230  heat shock protein GrpE  40.79 
 
 		 181 aa  107  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  39.46 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  39.46 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  40.76 
 
 		 212 aa  106  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2570  heat shock protein GrpE  41.06 
 
 		 178 aa  106  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1227  heat shock protein GrpE  41.06 
 
 		 189 aa  106  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.830838  hitchhiker  0.00575896 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1485  heat shock protein GrpE  39.51 
 
 		 182 aa  106  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3217  heat shock protein GrpE  41.06 
 
 		 178 aa  105  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  40.85 
 
 		 198 aa  105  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  41.48 
 
 		 188 aa  105  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1713  heat shock protein GrpE  40 
 
 		 179 aa  105  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.385192  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  39.46 
 
 		 225 aa  105  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1770  heat shock protein GrpE  39.22 
 
 		 184 aa  105  5e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0032  heat shock protein GrpE  40.74 
 
 		 200 aa  104  7e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  39.16 
 
 		 201 aa  104  9e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103997  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  38.65 
 
 		 211 aa  103  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3125  heat shock protein GrpE  42.86 
 
 		 186 aa  103  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00453853  normal  0.177698 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2473  protein GrpE (heat shock protein)  41.4 
 
 		 194 aa  103  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0736  heat shock protein GrpE  36.54 
 
 		 194 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.273487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1004  heat shock protein GrpE  37.14 
 
 		 180 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.324391 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  42.22 
 
 		 186 aa  103  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  39.38 
 
 		 198 aa  103  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  41.73 
 
 		 181 aa  102  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0980  heat shock protein GrpE  37.57 
 
 		 181 aa  102  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0936  heat shock protein GrpE  41.61 
 
 		 169 aa  101  6e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0941203  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2575  GrpE protein  41.18 
 
 		 181 aa  101  6e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000160939 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  43.07 
 
 		 210 aa  101  7e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2635  heat shock protein GrpE  39.72 
 
 		 181 aa  101  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2497  putative heat shock protein  38.96 
 
 		 182 aa  100  9e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.437332 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2499  heat shock protein GrpE  40.15 
 
 		 202 aa  100  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0710839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  37.34 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1274  heat shock protein GrpE  33.84 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125429  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1537  molecular chaperone protein GrpE  42.96 
 
 		 173 aa  100  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.818468  normal  0.071665 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2437  heat shock protein GrpE  38.97 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000045112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4391  GrpE protein  34.9 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.322098  normal  0.302959 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  38.19 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1381  heat shock protein GrpE  36.48 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00117514  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1442  heat shock protein GrpE  36.48 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.105191  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3005  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 		 206 aa  99.8  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000767299  decreased coverage  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  38.82 
 
 		 228 aa  99.8  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1342  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 		 206 aa  99.8  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000163417  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1306  heat shock protein GrpE  39.01 
 
 		 178 aa  100  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1379  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 		 206 aa  99.8  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000798826  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2772  heat shock protein GrpE  37.5 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000976111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1120  co-chaperone GrpE  35.35 
 
 		 194 aa  99.8  2e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0675757  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3963  heat shock protein GrpE  38.57 
 
 		 194 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.107722 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1356  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 		 206 aa  99.8  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000827789  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2881  GrpE protein  39.39 
 
 		 181 aa  99.4  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.274349  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3280  heat shock protein GrpE  38.3 
 
 		 185 aa  98.6  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.135957  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2328  heat shock protein GrpE  38.3 
 
 		 185 aa  98.6  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3313  heat shock protein GrpE  38.3 
 
 		 185 aa  98.6  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3324  heat shock protein GrpE  38.3 
 
 		 185 aa  98.6  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1101  heat shock protein GrpE  38.3 
 
 		 185 aa  98.6  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322152  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2208  heat shock protein GrpE  38.3 
 
 		 185 aa  98.6  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1334  heat shock protein GrpE  36.84 
 
 		 222 aa  99  4e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0498  heat shock protein GrpE  38.3 
 
 		 185 aa  98.6  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.755488  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0649  heat shock protein GrpE  39.13 
 
 		 195 aa  99  4e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.127631  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1090  co-chaperone GrpE  35.07 
 
 		 173 aa  99  4e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000331967  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1167  GrpE protein  38.89 
 
 		 178 aa  98.6  5e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  39.04 
 
 		 192 aa  98.6  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  35.71 
 
 		 200 aa  98.6  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000163848  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3461  GrpE protein  34.95 
 
 		 204 aa  98.2  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.704807  normal  0.0101104 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1527  heat shock protein GrpE  38.46 
 
 		 189 aa  98.2  7e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1053  GrpE protein  36.55 
 
 		 207 aa  97.8  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0002  GrpE protein  35.44 
 
 		 206 aa  97.8  8e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.531723  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1970  GrpE protein  39.07 
 
 		 187 aa  97.8  9e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000003831  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0644  heat shock protein GrpE  38.3 
 
 		 181 aa  97.8  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>