More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0270 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0270  peptidyl-tRNA hydrolase  100 
 
 		 185 aa  382  1e-105  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0261  peptidyl-tRNA hydrolase  45.7 
 
 		 186 aa  175  3e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0329582  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0537  peptidyl-tRNA hydrolase  40.86 
 
 		 190 aa  174  7e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0524  peptidyl-tRNA hydrolase  40.86 
 
 		 190 aa  174  7e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0105  peptidyl-tRNA hydrolase  45.7 
 
 		 186 aa  174  8e-43  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  46.24 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000476771  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1502  peptidyl-tRNA hydrolase  45.7 
 
 		 365 aa  171  3.9999999999999995e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0140  peptidyl-tRNA hydrolase  40.86 
 
 		 190 aa  171  7.999999999999999e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.290971  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  43.55 
 
 		 186 aa  167  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0050  peptidyl-tRNA hydrolase  43.01 
 
 		 186 aa  164  9e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  43.01 
 
 		 186 aa  164  9e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0050  peptidyl-tRNA hydrolase  43.01 
 
 		 186 aa  164  9e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl077  peptidyl-tRNA hydrolase  42.47 
 
 		 186 aa  163  1.0000000000000001e-39  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.464797  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0049  peptidyl-tRNA hydrolase  42.47 
 
 		 210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0060  peptidyl-tRNA hydrolase  42.47 
 
 		 207 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0046  peptidyl-tRNA hydrolase  42.47 
 
 		 186 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0056  peptidyl-tRNA hydrolase  42.47 
 
 		 207 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0057  peptidyl-tRNA hydrolase  42.47 
 
 		 207 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0591  peptidyl-tRNA hydrolase  43.78 
 
 		 184 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00307137  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5260  peptidyl-tRNA hydrolase  42.47 
 
 		 207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  41.94 
 
 		 207 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2808  peptidyl-tRNA hydrolase  42.16 
 
 		 188 aa  161  5.0000000000000005e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0180  peptidyl-tRNA hydrolase  40.64 
 
 		 191 aa  160  8.000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3122  peptidyl-tRNA hydrolase  40.1 
 
 		 201 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.984207  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0090  peptidyl-tRNA hydrolase  40.1 
 
 		 201 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.971877  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  41.4 
 
 		 186 aa  160  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0097  peptidyl-tRNA hydrolase  44.97 
 
 		 190 aa  159  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000012965  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2494  peptidyl-tRNA hydrolase  41.08 
 
 		 188 aa  157  9e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0007  peptidyl-tRNA hydrolase  40.11 
 
 		 191 aa  156  1e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0637  peptidyl-tRNA hydrolase  45.73 
 
 		 189 aa  156  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.205248  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0070  aminoacyl-tRNA hydrolase  39.25 
 
 		 183 aa  156  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0010  peptidyl-tRNA hydrolase  41.4 
 
 		 188 aa  156  2e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0006  peptidyl-tRNA hydrolase  41.94 
 
 		 189 aa  155  3e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0048  peptidyl-tRNA hydrolase  38.74 
 
 		 186 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0822  peptidyl-tRNA hydrolase  45.62 
 
 		 211 aa  151  5e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.750534  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0893  peptidyl-tRNA hydrolase  45.62 
 
 		 211 aa  151  5e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.741302  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4347  peptidyl-tRNA hydrolase  44.44 
 
 		 210 aa  150  7e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3516  Aminoacyl-tRNA hydrolase  38.3 
 
 		 213 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0111  aminoacyl-tRNA hydrolase  39.47 
 
 		 191 aa  150  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.212396  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21210  Aminoacyl-tRNA hydrolase  37.97 
 
 		 187 aa  150  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000292391  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0394  peptidyl-tRNA hydrolase  42.53 
 
 		 192 aa  150  1e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000248474  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0227  peptidyl-tRNA hydrolase  39.27 
 
 		 208 aa  150  1e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.353061 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2819  aminoacyl-tRNA hydrolase  38.59 
 
 		 193 aa  150  1e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112866  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0583  peptidyl-tRNA hydrolase  41.62 
 
 		 200 aa  149  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.258134  normal  0.0303401 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2079  peptidyl-tRNA hydrolase  41.18 
 
 		 206 aa  149  2e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4135  peptidyl-tRNA hydrolase  40.61 
 
 		 200 aa  149  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5435  peptidyl-tRNA hydrolase  44.44 
 
 		 207 aa  149  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1632  peptidyl-tRNA hydrolase  43.12 
 
 		 196 aa  149  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00924241 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1510  Aminoacyl-tRNA hydrolase  45.03 
 
 		 193 aa  149  3e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1688  peptidyl-tRNA hydrolase  44 
 
 		 189 aa  148  4e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0591  peptidyl-tRNA hydrolase  40.11 
 
 		 191 aa  147  9e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0472  peptidyl-tRNA hydrolase  40.61 
 
 		 201 aa  147  9e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0595  peptidyl-tRNA hydrolase  43.03 
 
 		 189 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1662  peptidyl-tRNA hydrolase  42.05 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.107221  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2870  peptidyl-tRNA hydrolase  39.38 
 
 		 219 aa  146  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_535  peptidyl-tRNA hydrolase  43.03 
 
 		 189 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0398  peptidyl-tRNA hydrolase  44.39 
 
 		 188 aa  146  1.0000000000000001e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24601  peptidyl-tRNA hydrolase  39.38 
 
 		 206 aa  145  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2256  aminoacyl-tRNA hydrolase  37.02 
 
 		 205 aa  144  5e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.281218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0109  aminoacyl-tRNA hydrolase  37.21 
 
 		 206 aa  144  6e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000213906  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0954  peptidyl-tRNA hydrolase  42.78 
 
 		 188 aa  144  6e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000191784  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0313  peptidyl-tRNA hydrolase  40.61 
 
 		 200 aa  144  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2928  peptidyl-tRNA hydrolase  40.61 
 
 		 201 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132435  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0567  peptidyl-tRNA hydrolase  40.61 
 
 		 201 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00595812  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0583  peptidyl-tRNA hydrolase  40.61 
 
 		 201 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0751  peptidyl-tRNA hydrolase  40.61 
 
 		 201 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.497669  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0265  peptidyl-tRNA hydrolase  41.18 
 
 		 205 aa  144  7.0000000000000006e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1500  peptidyl-tRNA hydrolase  40.61 
 
 		 201 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.494558  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4490  Aminoacyl-tRNA hydrolase  40.64 
 
 		 210 aa  144  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1170  peptidyl-tRNA hydrolase  44.83 
 
 		 194 aa  144  9e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0511  peptidyl-tRNA hydrolase  42.25 
 
 		 199 aa  144  9e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3654  peptidyl-tRNA hydrolase  37.16 
 
 		 201 aa  144  9e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000443892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0949  peptidyl-tRNA hydrolase  42.5 
 
 		 216 aa  143  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.803923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1560  peptidyl-tRNA hydrolase  39.44 
 
 		 201 aa  144  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0200988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2722  peptidyl-tRNA hydrolase  41.71 
 
 		 199 aa  143  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.016718  normal  0.312318 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6134  peptidyl-tRNA hydrolase  41.71 
 
 		 199 aa  144  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.014975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3227  peptidyl-tRNA hydrolase  39.77 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.783936 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2815  peptidyl-tRNA hydrolase  41.71 
 
 		 199 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490887  normal  0.867617 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0897  peptidyl-tRNA hydrolase  40.54 
 
 		 230 aa  143  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2190  peptidyl-tRNA hydrolase  41.71 
 
 		 199 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0999239  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2864  peptidyl-tRNA hydrolase  41.71 
 
 		 199 aa  143  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00616861  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2804  peptidyl-tRNA hydrolase  41.71 
 
 		 199 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236272  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1379  peptidyl-tRNA hydrolase  39.04 
 
 		 192 aa  143  2e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1291  peptidyl-tRNA hydrolase  38.25 
 
 		 204 aa  143  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1159  peptidyl-tRNA hydrolase  40.43 
 
 		 190 aa  142  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2414  peptidyl-tRNA hydrolase  37.5 
 
 		 194 aa  142  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.294546  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0676  peptidyl-tRNA hydrolase  40.62 
 
 		 213 aa  142  3e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0310  aminoacyl-tRNA hydrolase  41.01 
 
 		 206 aa  142  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2121  Aminoacyl-tRNA hydrolase  39.05 
 
 		 190 aa  142  3e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.062679 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0489  peptidyl-tRNA hydrolase  37.78 
 
 		 202 aa  142  3e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00415538 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1099  peptidyl-tRNA hydrolase  41.05 
 
 		 189 aa  142  4e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.745166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4448  peptidyl-tRNA hydrolase  39.58 
 
 		 213 aa  141  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.727457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1290  aminoacyl-tRNA hydrolase  37.89 
 
 		 187 aa  142  4e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1919  peptidyl-tRNA hydrolase  44.38 
 
 		 209 aa  142  4e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.245056  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1089  peptidyl-tRNA hydrolase  43.37 
 
 		 217 aa  141  5e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3612  peptidyl-tRNA hydrolase  43.75 
 
 		 213 aa  141  5e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821004 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0570  peptidyl-tRNA hydrolase  40.49 
 
 		 189 aa  141  5e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0122304  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf853  peptidyl-tRNA hydrolase  39.25 
 
 		 181 aa  141  6e-33  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0770  peptidyl-tRNA hydrolase  41.67 
 
 		 205 aa  141  6e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3091  peptidyl-tRNA hydrolase  39.13 
 
 		 189 aa  140  7e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>