237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0787 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0787  threonine synthase  100 
 
 
485 aa  999    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.456403  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2405  threonine synthase  49.79 
 
 
496 aa  482  1e-135  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.943619  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1545  threonine synthase  50.2 
 
 
487 aa  484  1e-135  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0055  threonine synthase  50.41 
 
 
496 aa  481  1e-134  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0196788  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1857  threonine synthase  50.5 
 
 
494 aa  481  1e-134  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.228698  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3511  threonine synthase  45.47 
 
 
499 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000229411  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1076  threonine synthase  50.98 
 
 
495 aa  448  1.0000000000000001e-124  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000688351  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1450  threonine synthase  45.69 
 
 
507 aa  435  1e-121  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.628266  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0568  threonine synthase  48.23 
 
 
500 aa  433  1e-120  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0958  threonine synthase  44.27 
 
 
499 aa  421  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0625228  normal  0.0974389 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0539  threonine synthase  47.08 
 
 
502 aa  421  1e-116  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0259397  unclonable  0.0000000259641 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1379  threonine synthase  46.11 
 
 
499 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00539056  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1381  threonine synthase  44.02 
 
 
499 aa  415  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1302  threonine synthase  45.9 
 
 
500 aa  412  1e-114  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3053  threonine synthase  44.72 
 
 
494 aa  410  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0281  threonine synthase  44.18 
 
 
498 aa  407  1.0000000000000001e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000457965  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0655  threonine synthase  44.98 
 
 
493 aa  398  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000123828  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0786  threonine synthase  47.2 
 
 
496 aa  394  1e-108  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16070  threonine synthase  45.37 
 
 
490 aa  388  1e-106  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0278928  hitchhiker  0.000000294032 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2268  threonine synthase  41.7 
 
 
497 aa  388  1e-106  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1019  threonine synthase  43.7 
 
 
508 aa  381  1e-104  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13040  threonine synthase  43.67 
 
 
516 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0950909  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0567  threonine synthase  43.5 
 
 
522 aa  355  6.999999999999999e-97  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.167411  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14820  threonine synthase  38.9 
 
 
504 aa  351  2e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.312507  normal  0.0904942 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1249  threonine synthase  40.52 
 
 
491 aa  326  7e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0878389  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2052  threonine synthase  39.45 
 
 
487 aa  322  8e-87  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00798394  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0789  threonine synthase  39.96 
 
 
490 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1020  threonine synthase  39.47 
 
 
476 aa  316  5e-85  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1352  threonine synthase  37.68 
 
 
498 aa  311  2e-83  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0536  threonine synthase  37.53 
 
 
465 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.376888  normal  0.520587 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0130  threonine synthase  38.32 
 
 
487 aa  299  7e-80  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0635  threonine synthase  38.44 
 
 
471 aa  299  7e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.05572  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0599  threonine synthase  38.64 
 
 
468 aa  298  1e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0907  threonine synthase  38.69 
 
 
472 aa  298  2e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0692  threonine synthase  38.44 
 
 
474 aa  297  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1384  threonine synthase  37.71 
 
 
469 aa  297  4e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0019152  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1082  threonine synthase  38.7 
 
 
580 aa  296  4e-79  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000183977  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16090  threonine synthase  37.71 
 
 
469 aa  296  7e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0484  threonine synthase  37.53 
 
 
463 aa  295  1e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.632525  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0822  threonine synthase  37.78 
 
 
472 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.214669 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0489  threonine synthase  37.53 
 
 
463 aa  295  1e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.513608  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1028  threonine synthase  38.09 
 
 
469 aa  294  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4148  threonine synthase  38.58 
 
 
469 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.707815  normal  0.707599 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1471  threonine synthase  36.92 
 
 
469 aa  294  3e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466033  normal  0.368442 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4250  threonine synthase  36.92 
 
 
469 aa  293  6e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1076  threonine synthase  36.92 
 
 
469 aa  292  7e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.184051  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4578  threonine synthase  37.64 
 
 
472 aa  292  1e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4795  threonine synthase  37.76 
 
 
476 aa  290  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.420552  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1210  threonine synthase  36.66 
 
 
465 aa  290  4e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3393  threonine synthase  38.44 
 
 
469 aa  290  4e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.955662  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0229  threonine synthase  37.9 
 
 
472 aa  289  6e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1481  threonine synthase  37.9 
 
 
469 aa  288  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.77093  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0760  threonine synthase  35.49 
 
 
465 aa  288  2e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3518  threonine synthase  37.56 
 
 
453 aa  288  2e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.116965  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0262  threonine synthase  36.43 
 
 
472 aa  287  4e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0839  threonine synthase  37.3 
 
 
471 aa  285  9e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1291  threonine synthase  36.21 
 
 
469 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0226346  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3524  threonine synthase  36.04 
 
 
470 aa  285  2.0000000000000002e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.970017  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39480  threonine synthase  37 
 
 
469 aa  283  6.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.104033  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2341  threonine synthase  35.14 
 
 
471 aa  278  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0902  threonine synthase  36.53 
 
 
469 aa  278  1e-73  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0582732  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3009  threonine synthase  37.36 
 
 
462 aa  278  2e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.923826  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3764  threonine synthase  37.67 
 
 
461 aa  275  9e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.106362  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1695  threonine synthase  36.17 
 
 
461 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0677  threonine synthase  38.46 
 
 
467 aa  275  1.0000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0874999  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1251  threonine synthase  35.62 
 
 
473 aa  274  3e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1631  threonine synthase  36.99 
 
 
461 aa  274  3e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000000988233  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2273  threonine synthase  35.1 
 
 
466 aa  274  3e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.593832  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0268  threonine synthase  35.15 
 
 
471 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.964457  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4498  threonine synthase  35.39 
 
 
465 aa  273  5.000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.395589  normal  0.347683 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1892  threonine synthase  38.66 
 
 
460 aa  273  6e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3233  threonine synthase  35.5 
 
 
470 aa  271  2e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2985  threonine synthase  38.06 
 
 
458 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.17832e-26 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1298  threonine synthase  37.82 
 
 
458 aa  270  4e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000609388  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0722  threonine synthase  36.22 
 
 
471 aa  269  8e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.259471 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3578  threonine synthase  34.22 
 
 
470 aa  268  2e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0859  threonine synthase  37.01 
 
 
460 aa  268  2e-70  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00125642  hitchhiker  0.0000000245714 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1146  threonine synthase  36.38 
 
 
463 aa  267  4e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0833  threonine synthase  35.11 
 
 
470 aa  267  4e-70  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.159029  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3254  threonine synthase  34.02 
 
 
470 aa  265  1e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0242603 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1502  threonine synthase  37.1 
 
 
463 aa  265  2e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.06587e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0903  threonine synthase  34.91 
 
 
470 aa  264  3e-69  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1831  threonine synthase  34.39 
 
 
461 aa  264  3e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1398  threonine synthase  35.64 
 
 
465 aa  264  3e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3450  threonine synthase  35.4 
 
 
470 aa  263  4e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182634  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0480  threonine synthase  34.18 
 
 
461 aa  263  6.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.475299  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0308  threonine synthase  35.1 
 
 
465 aa  262  1e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00604196 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2137  threonine synthase  36.49 
 
 
473 aa  261  2e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0606467 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1588  threonine synthase  33.12 
 
 
470 aa  261  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742925  normal  0.0416146 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2330  threonine synthase  33.82 
 
 
463 aa  261  3e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.351518  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0459  threonine synthase  35.99 
 
 
459 aa  260  4e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1075  threonine synthase  37.25 
 
 
435 aa  260  5.0000000000000005e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.515489  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0921  threonine synthase  34.68 
 
 
473 aa  259  8e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.400205  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2379  threonine synthase  36.55 
 
 
476 aa  258  1e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.499285 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0620  threonine synthase  33.62 
 
 
461 aa  259  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2465  threonine synthase  35.29 
 
 
473 aa  257  3e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.191399 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1198  threonine synthase  34.43 
 
 
470 aa  257  4e-67  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.823792  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3149  threonine synthase  33.19 
 
 
462 aa  255  1.0000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211768  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49056  predicted protein  35.7 
 
 
504 aa  254  2.0000000000000002e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.3635  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1542  threonine synthase  35.97 
 
 
470 aa  254  3e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>