More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1042 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1042  cation transport ATPase  100 
 
 
620 aa  1235    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0059101  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0348  cation transport ATPase  55.27 
 
 
634 aa  667    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00293849  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A03  cation transport ATPase  52.17 
 
 
616 aa  629  1e-179  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0981  cation transport ATPase  46.73 
 
 
633 aa  558  1e-157  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3295  heavy metal translocating P-type ATPase  41.87 
 
 
639 aa  469  1.0000000000000001e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.853609  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2339  heavy metal translocating P-type ATPase  42.63 
 
 
643 aa  458  1e-127  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20140  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  42.69 
 
 
628 aa  444  1e-123  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0159818  normal  0.023133 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09580  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  40.74 
 
 
639 aa  435  1e-120  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.477007  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0912  heavy metal translocating P-type ATPase  41.36 
 
 
679 aa  426  1e-118  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1662  heavy metal translocating P-type ATPase  43.25 
 
 
656 aa  426  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.805882  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24490  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  41.58 
 
 
667 aa  412  1e-114  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1801  heavy metal translocating P-type ATPase  39.09 
 
 
639 aa  405  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0762097  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1527  heavy metal translocating P-type ATPase  38.03 
 
 
783 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00585098  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2204  heavy metal translocating P-type ATPase  36.34 
 
 
833 aa  394  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.149675  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1548  heavy metal translocating P-type ATPase  37.95 
 
 
707 aa  392  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7259  lead, cadmium, zinc and mercury-transporting ATPase  36.99 
 
 
678 aa  385  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.482594 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0721  cadmium-translocating P-type ATPase  39.71 
 
 
646 aa  385  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000381193 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1718  heavy metal translocating P-type ATPase  35.27 
 
 
712 aa  373  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3336  heavy metal translocating P-type ATPase  35.7 
 
 
744 aa  375  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.812406 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  35.39 
 
 
712 aa  375  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0549  heavy metal translocating P-type ATPase  35.43 
 
 
712 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3643  heavy metal translocating P-type ATPase  36.36 
 
 
726 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.545825 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2698  heavy metal translocating P-type ATPase  34.99 
 
 
734 aa  367  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.810739 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1049  hypothetical protein  35.49 
 
 
713 aa  364  3e-99  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2370  hypothetical protein  36.36 
 
 
711 aa  363  7.0000000000000005e-99  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0209  heavy metal translocating P-type ATPase  35.77 
 
 
635 aa  362  1e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.454108  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1257  cation transporter E1-E2 family ATPase  35.24 
 
 
709 aa  362  1e-98  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1690  heavy metal translocating P-type ATPase  36.15 
 
 
767 aa  362  1e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0453  heavy metal translocating P-type ATPase  35.18 
 
 
630 aa  360  4e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.153075 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0921  heavy metal translocating P-type ATPase  35.89 
 
 
844 aa  359  7e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1627  heavy metal translocating P-type ATPase  36.93 
 
 
718 aa  359  7e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1125  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  36.66 
 
 
751 aa  359  8e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.228678  normal  0.104561 
 
 
-
 
NC_004310  BR2018  cadmium-translocating P-type ATPase  35.44 
 
 
814 aa  358  9.999999999999999e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2849  heavy metal translocating P-type ATPase  35.53 
 
 
734 aa  357  3.9999999999999996e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7421  lead, cadmium, zinc and mercury-transporting ATPase  35.77 
 
 
764 aa  353  5.9999999999999994e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.396456 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1942  cadmium-translocating P-type ATPase  35.13 
 
 
704 aa  352  1e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  35.85 
 
 
797 aa  351  2e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4535  heavy metal translocating P-type ATPase  36.72 
 
 
734 aa  352  2e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3773  heavy metal translocating P-type ATPase  32.92 
 
 
737 aa  350  5e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.364819  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2147  cadmium-translocating P-type ATPase  35.45 
 
 
713 aa  350  6e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1151  heavy metal translocating P-type ATPase  35.14 
 
 
904 aa  348  1e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0071597  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2086  cadmium-transporting ATPase  34.6 
 
 
735 aa  349  1e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2581  heavy metal translocating P-type ATPase  35.92 
 
 
793 aa  348  2e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2450  heavy metal translocating P-type ATPase  35.2 
 
 
738 aa  347  3e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0805426  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1505  heavy metal translocating P-type ATPase  35.24 
 
 
716 aa  347  3e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.724781  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1873  heavy metal translocating P-type ATPase  39 
 
 
821 aa  347  3e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1347  heavy metal translocating P-type ATPase  32.92 
 
 
738 aa  347  4e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.174649 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2322  heavy metal translocating P-type ATPase  34.52 
 
 
637 aa  346  8e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.512408  normal  0.580673 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5561  P type cation (metal) transporter ATPase component  35.82 
 
 
757 aa  345  1e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.85793  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1461  heavy metal translocating P-type ATPase  36.85 
 
 
768 aa  343  4e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1481  heavy metal translocating P-type ATPase  36.85 
 
 
768 aa  343  4e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0180195  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  35.34 
 
 
798 aa  342  8e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0186  heavy metal translocating P-type ATPase  36.05 
 
 
670 aa  342  1e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  33.28 
 
 
785 aa  341  2e-92  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.27574  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3134  heavy metal translocating P-type ATPase  34.01 
 
 
712 aa  341  2e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  36.29 
 
 
796 aa  342  2e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3501  heavy metal translocating P-type ATPase  36.12 
 
 
758 aa  342  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.968413 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0290  heavy metal translocating P-type ATPase  36.11 
 
 
734 aa  342  2e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106474  normal  0.0243366 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  34.12 
 
 
711 aa  338  9.999999999999999e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  36.53 
 
 
889 aa  339  9.999999999999999e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13299  metal cation transporter P-type ATPase C ctpC  35.81 
 
 
718 aa  338  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.685827  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3281  heavy metal translocating P-type ATPase  34.54 
 
 
699 aa  338  1.9999999999999998e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  37.21 
 
 
818 aa  337  5e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1465  heavy metal translocating P-type ATPase  34.19 
 
 
825 aa  336  5.999999999999999e-91  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.338501  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3220  copper exporting ATPase  35.3 
 
 
907 aa  336  7e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0244  heavy metal translocating P-type ATPase  37.05 
 
 
707 aa  336  7.999999999999999e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.787519  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3854  heavy metal translocating P-type ATPase  36.47 
 
 
747 aa  336  9e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000610178  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1097  copper exporting ATPase  32.58 
 
 
907 aa  336  9e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3796  heavy metal translocating P-type ATPase  35.43 
 
 
756 aa  336  9e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.304079  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3067  heavy metal translocating P-type ATPase  36.05 
 
 
824 aa  336  9e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4451  heavy metal translocating P-type ATPase  33.81 
 
 
673 aa  335  1e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3420  heavy metal translocating P-type ATPase  36.15 
 
 
815 aa  335  1e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0264  heavy metal translocating P-type ATPase  36.15 
 
 
815 aa  335  1e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  38.24 
 
 
889 aa  335  1e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2242  heavy metal translocating P-type ATPase  33.94 
 
 
750 aa  335  1e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00781921 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1777  heavy metal translocating P-type ATPase  34.34 
 
 
814 aa  335  2e-90  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0428003 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4302  heavy metal translocating P-type ATPase  36.15 
 
 
815 aa  335  2e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  36.67 
 
 
894 aa  334  3e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6773  heavy metal translocating P-type ATPase  32.76 
 
 
850 aa  334  3e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2481  heavy metal translocating P-type ATPase  35.8 
 
 
802 aa  334  3e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.429438  normal  0.100941 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1448  cadmium-translocating P-type ATPase  34.28 
 
 
748 aa  334  3e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0212  heavy metal translocating P-type ATPase  33.7 
 
 
758 aa  334  3e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3877  copper-translocating P-type ATPase  36.98 
 
 
760 aa  333  4e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00336349  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1815  heavy metal translocating P-type ATPase  35.5 
 
 
800 aa  333  4e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.451181 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3411  hypothetical protein  33.75 
 
 
803 aa  333  4e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5853  heavy metal translocating P-type ATPase  36.14 
 
 
767 aa  334  4e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5352  heavy metal translocating P-type ATPase  34.83 
 
 
799 aa  333  6e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448816  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1042  copper-translocating P-type ATPase  36.27 
 
 
813 aa  333  6e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0876  heavy metal translocating P-type ATPase  34.41 
 
 
750 aa  333  7.000000000000001e-90  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2203  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  34.64 
 
 
700 aa  333  7.000000000000001e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.588592 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4212  heavy metal translocating P-type ATPase  34.51 
 
 
1022 aa  333  7.000000000000001e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4225  heavy metal translocating P-type ATPase  35.3 
 
 
734 aa  332  9e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  36.73 
 
 
795 aa  332  1e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1587  copper/silver efflux P-type ATPase  33.49 
 
 
814 aa  332  1e-89  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.602341  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5313  copper-translocating P-type ATPase  35.96 
 
 
795 aa  332  1e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.620833 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  37.39 
 
 
797 aa  332  1e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2691  heavy metal translocating P-type ATPase  33.85 
 
 
677 aa  331  2e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000392572  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5696  copper-translocating P-type ATPase  35.78 
 
 
795 aa  331  2e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.698051  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2084  heavy metal translocating P-type ATPase  34.35 
 
 
812 aa  330  6e-89  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.155382 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0438  heavy metal translocating P-type ATPase  31.7 
 
 
740 aa  329  7e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>