More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_21890 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_21890  nitrate/nitrite transporter  100 
 
 
460 aa  884    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.392682  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25470  nitrate/nitrite transporter  53.49 
 
 
442 aa  347  3e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.143823  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4127  major facilitator superfamily transporter  48.09 
 
 
418 aa  330  3e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3664  major facilitator transporter  47.54 
 
 
437 aa  318  2e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.596983 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1609  major facilitator superfamily MFS_1  47.83 
 
 
448 aa  317  3e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000329465 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1615  major facilitator transporter  46.61 
 
 
442 aa  313  2.9999999999999996e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000129753  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2149  major facilitator superfamily MFS_1  51.21 
 
 
443 aa  309  8e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00239226  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1676  major facilitator superfamily MFS_1  47.25 
 
 
423 aa  308  2.0000000000000002e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2530  major facilitator transporter  48.09 
 
 
447 aa  302  1e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.906082  normal  0.441039 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3724  major facilitator superfamily transporter  47.81 
 
 
426 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.517279 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3651  major facilitator transporter  47.81 
 
 
426 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1523  major facilitator superfamily MFS_1  44.77 
 
 
446 aa  285  1.0000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0583508 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1835  major facilitator superfamily MFS_1  45.33 
 
 
423 aa  283  5.000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.105556  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0303  major facilitator superfamily MFS_1  45.41 
 
 
447 aa  271  2e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.120358  normal  0.0623146 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3484  major facilitator superfamily MFS_1  42.47 
 
 
438 aa  261  3e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4727  major facilitator superfamily MFS_1  48.91 
 
 
441 aa  256  4e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0409  major facilitator transporter  41.99 
 
 
398 aa  256  5e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2835  major facilitator transporter  44.04 
 
 
428 aa  256  7e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14630  sugar phosphate permease  39.18 
 
 
446 aa  220  3.9999999999999997e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.145959  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2905  putative transmembrane transport protein  37.16 
 
 
430 aa  220  5e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5829  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 
439 aa  213  3.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.50819  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0829  major facilitator superfamily MFS_1  42.77 
 
 
430 aa  202  9.999999999999999e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.145147  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2212  major facilitator superfamily MFS_1  35.25 
 
 
486 aa  194  3e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.189935  hitchhiker  0.00984822 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5436  major facilitator superfamily MFS_1  37.7 
 
 
411 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3315  major facilitator family transporter  29.72 
 
 
414 aa  114  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1359  hypothetical protein  29.1 
 
 
430 aa  112  9e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1355  hypothetical protein  29.1 
 
 
430 aa  113  9e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2768  major facilitator superfamily MFS_1  28.94 
 
 
421 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.17695  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1524  major facilitator transporter  28.14 
 
 
434 aa  111  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.472365  normal  0.129065 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3345  major facilitator transporter  29.47 
 
 
417 aa  105  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.231985 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0097  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 
415 aa  103  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0178467  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2603  major facilitator superfamily MFS_1  28.11 
 
 
437 aa  103  9e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5821  major facilitator superfamily permease  28.66 
 
 
432 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.302155 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0079  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 
425 aa  102  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28688e-24 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0019  major facilitator family transporter  26.93 
 
 
452 aa  101  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0706  hypothetical protein  24.27 
 
 
430 aa  102  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2665  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 
421 aa  101  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.6609  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2159  transporter, MFS superfamily  26.93 
 
 
452 aa  101  3e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0688  hypothetical protein  24 
 
 
430 aa  98.6  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1855  hypothetical protein  27.54 
 
 
426 aa  99  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1599  major facilitator transporter  27.4 
 
 
428 aa  98.2  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0862698 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1290  major facilitator superfamily MFS_1  27.87 
 
 
441 aa  97.8  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0257  major facilitator transporter  27.1 
 
 
417 aa  97.8  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.72366 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1860  hypothetical protein  27.54 
 
 
426 aa  96.7  7e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0271  major facilitator transporter  27.7 
 
 
418 aa  96.3  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1152  transporter, MFS superfamily  29.49 
 
 
437 aa  95.9  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.309541  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1022  intraphagosomal amino acid transporter (Pht) family protein  29.49 
 
 
437 aa  96.3  1e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0604  hypothetical protein  27.76 
 
 
422 aa  95.5  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0585  hypothetical protein  27.76 
 
 
427 aa  95.9  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0383  major facilitator superfamily MFS_1  25.5 
 
 
439 aa  95.1  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000153779  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1288  hypothetical protein  22.74 
 
 
432 aa  93.6  7e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1289  hypothetical protein  22.74 
 
 
432 aa  93.2  8e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1497  transporter, MFS superfamily  27.17 
 
 
443 aa  93.2  8e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0680  major facilitator family transporter  26.61 
 
 
443 aa  90.9  4e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  25.89 
 
 
434 aa  89  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  28.67 
 
 
443 aa  87  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  25.48 
 
 
434 aa  86.3  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  26.67 
 
 
432 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0056  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
411 aa  84  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1564  transporter, MFS superfamily  22.51 
 
 
426 aa  83.6  0.000000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0101  major facilitator transporter  26.07 
 
 
434 aa  82.8  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.467477  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  23.03 
 
 
445 aa  83.2  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1641  transporter, MFS superfamily  27.01 
 
 
428 aa  82.4  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00499002  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0113  major facilitator superfamily transporter  28.21 
 
 
407 aa  82  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.378923 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0691  hypothetical protein  24.51 
 
 
423 aa  81.6  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0130  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 
407 aa  81.6  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.879042  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0707  hypothetical protein  24.55 
 
 
425 aa  80.9  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0689  hypothetical protein  24.55 
 
 
425 aa  80.9  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1989  major facilitator transporter  26.89 
 
 
418 aa  79.3  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0539  major facilitator family transporter  26.64 
 
 
428 aa  79.7  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000373012  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0674  hypothetical protein  24.23 
 
 
423 aa  79  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2516  major facilitator superfamily MFS_1  23.89 
 
 
446 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000164401  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0018  major facilitator family transporter  23.02 
 
 
446 aa  77.4  0.0000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2160  transporter, MFS superfamily  23.02 
 
 
446 aa  77.4  0.0000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0645  hypothetical protein  28.05 
 
 
431 aa  75.5  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1416  hypothetical protein  25.86 
 
 
429 aa  75.1  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1139  major facilitator superfamily MFS_1  26.74 
 
 
395 aa  74.7  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388877  normal  0.0189112 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0661  hypothetical protein  26.82 
 
 
431 aa  74.3  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1892  major facilitator superfamily MFS_1  31.28 
 
 
431 aa  73.6  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  29.71 
 
 
439 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  30.33 
 
 
439 aa  72  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0203  major facilitator transporter  24.85 
 
 
432 aa  71.6  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2630  major facilitator transporter  27.76 
 
 
425 aa  70.5  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1068  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 
420 aa  70.1  0.00000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.27901  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0627  major facilitator family transporter  25.45 
 
 
439 aa  70.1  0.00000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  29.45 
 
 
439 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  29.45 
 
 
439 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1147  major facilitator superfamily transporter  27.25 
 
 
420 aa  69.7  0.00000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.428295  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1559b  transporter, MFS superfamily  25.45 
 
 
384 aa  69.3  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.423299  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1836  major facilitator transporter  28.51 
 
 
412 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  31.98 
 
 
423 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  31.98 
 
 
423 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1780  hypothetical protein  24.83 
 
 
366 aa  68.2  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2425  major facilitator transporter  33.09 
 
 
427 aa  68.2  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410851  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2103  hypothetical protein  29.23 
 
 
420 aa  67.4  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.36255  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1779  hypothetical protein  24.49 
 
 
366 aa  67.4  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0675  hypothetical protein  23.49 
 
 
427 aa  67  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5154  major facilitator transporter  27.87 
 
 
428 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379393  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0779  permease, putative  25.75 
 
 
411 aa  67  0.0000000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.759724  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2438  hypothetical protein  20.69 
 
 
410 aa  66.6  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>