236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_14820 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_14820  threonine synthase  100 
 
 
504 aa  993    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.312507  normal  0.0904942 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3511  threonine synthase  42.72 
 
 
499 aa  398  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000229411  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1857  threonine synthase  43.76 
 
 
494 aa  386  1e-106  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.228698  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1379  threonine synthase  42.19 
 
 
499 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00539056  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2268  threonine synthase  43.01 
 
 
497 aa  383  1e-105  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1545  threonine synthase  40.99 
 
 
487 aa  379  1e-104  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1381  threonine synthase  40.9 
 
 
499 aa  382  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0958  threonine synthase  41.52 
 
 
499 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0625228  normal  0.0974389 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1302  threonine synthase  41.52 
 
 
500 aa  377  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0568  threonine synthase  42.91 
 
 
500 aa  377  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0055  threonine synthase  40.59 
 
 
496 aa  374  1e-102  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0196788  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2405  threonine synthase  40.04 
 
 
496 aa  371  1e-101  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.943619  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1450  threonine synthase  40.51 
 
 
507 aa  372  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.628266  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0281  threonine synthase  43.44 
 
 
498 aa  367  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000457965  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0787  threonine synthase  39.49 
 
 
485 aa  355  1e-96  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.456403  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3053  threonine synthase  40.24 
 
 
494 aa  348  2e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0655  threonine synthase  41.11 
 
 
493 aa  347  3e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000123828  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0539  threonine synthase  40.47 
 
 
502 aa  338  9.999999999999999e-92  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0259397  unclonable  0.0000000259641 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0786  threonine synthase  40.87 
 
 
496 aa  326  8.000000000000001e-88  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0567  threonine synthase  41.3 
 
 
522 aa  314  1.9999999999999998e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.167411  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13040  threonine synthase  39.62 
 
 
516 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0950909  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16070  threonine synthase  40.56 
 
 
490 aa  310  5e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0278928  hitchhiker  0.000000294032 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1076  threonine synthase  38.55 
 
 
495 aa  308  1.0000000000000001e-82  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000688351  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1019  threonine synthase  35.5 
 
 
508 aa  290  4e-77  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0599  threonine synthase  39.29 
 
 
468 aa  277  3e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0635  threonine synthase  38.33 
 
 
471 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.05572  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2052  threonine synthase  32.16 
 
 
487 aa  274  3e-72  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00798394  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1352  threonine synthase  34.16 
 
 
498 aa  268  1e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0692  threonine synthase  37.83 
 
 
474 aa  269  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0459  threonine synthase  38.27 
 
 
459 aa  264  3e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0489  threonine synthase  38.19 
 
 
463 aa  258  2e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.513608  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1020  threonine synthase  33.33 
 
 
476 aa  257  4e-67  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0839  threonine synthase  41.05 
 
 
471 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0484  threonine synthase  37.97 
 
 
463 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.632525  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1251  threonine synthase  39.69 
 
 
473 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0907  threonine synthase  39.87 
 
 
472 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1502  threonine synthase  37.01 
 
 
463 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.06587e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0262  threonine synthase  39.05 
 
 
472 aa  252  9.000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0822  threonine synthase  39.43 
 
 
472 aa  252  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.214669 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4578  threonine synthase  38.99 
 
 
472 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1210  threonine synthase  34.93 
 
 
465 aa  251  3e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1082  threonine synthase  31.31 
 
 
580 aa  251  3e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000183977  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0536  threonine synthase  36.59 
 
 
465 aa  249  9e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.376888  normal  0.520587 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0130  threonine synthase  31.19 
 
 
487 aa  248  2e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1695  threonine synthase  38.16 
 
 
461 aa  248  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4795  threonine synthase  39.14 
 
 
476 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.420552  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3518  threonine synthase  36.03 
 
 
453 aa  248  2e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.116965  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3009  threonine synthase  38.11 
 
 
462 aa  247  3e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.923826  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0229  threonine synthase  39.25 
 
 
472 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1631  threonine synthase  37.75 
 
 
461 aa  244  3e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000000988233  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2465  threonine synthase  36.32 
 
 
473 aa  243  3.9999999999999997e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.191399 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2379  threonine synthase  34.57 
 
 
476 aa  243  7.999999999999999e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.499285 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3393  threonine synthase  36 
 
 
469 aa  242  1e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.955662  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1146  threonine synthase  36.83 
 
 
463 aa  241  2e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2137  threonine synthase  35.75 
 
 
473 aa  241  2.9999999999999997e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0606467 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1550  threonine synthase  35.31 
 
 
477 aa  241  2.9999999999999997e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0677  threonine synthase  37.8 
 
 
467 aa  241  2.9999999999999997e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0874999  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1542  threonine synthase  38.23 
 
 
470 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1249  threonine synthase  33.27 
 
 
491 aa  239  1e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0878389  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0760  threonine synthase  36.81 
 
 
465 aa  239  1e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0859  threonine synthase  33.55 
 
 
460 aa  238  2e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00125642  hitchhiker  0.0000000245714 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39480  threonine synthase  36.3 
 
 
469 aa  237  3e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.104033  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1892  threonine synthase  36.32 
 
 
460 aa  237  4e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0722  threonine synthase  36.73 
 
 
471 aa  236  6e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.259471 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0789  threonine synthase  32.94 
 
 
490 aa  236  9e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1384  threonine synthase  35.37 
 
 
469 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0019152  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16090  threonine synthase  35.37 
 
 
469 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1832  threonine synthase  38.4 
 
 
471 aa  235  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1203  threonine synthase  35.55 
 
 
481 aa  234  3e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.053417 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0903  threonine synthase  31.91 
 
 
470 aa  233  4.0000000000000004e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0833  threonine synthase  31.91 
 
 
470 aa  233  4.0000000000000004e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.159029  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1264  threonine synthase  35.55 
 
 
481 aa  233  6e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.974615 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1471  threonine synthase  34.95 
 
 
469 aa  233  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466033  normal  0.368442 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4148  threonine synthase  35.15 
 
 
469 aa  233  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.707815  normal  0.707599 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4250  threonine synthase  34.95 
 
 
469 aa  233  9e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1481  threonine synthase  34.32 
 
 
469 aa  232  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.77093  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1328  threonine synthase  35.55 
 
 
481 aa  231  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.377271  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1076  threonine synthase  34.95 
 
 
469 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.184051  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1913  threonine synthase  35.86 
 
 
475 aa  231  2e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.142116  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4498  threonine synthase  38.19 
 
 
465 aa  231  3e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.395589  normal  0.347683 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1028  threonine synthase  33.83 
 
 
469 aa  231  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3254  threonine synthase  36.87 
 
 
470 aa  231  3e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0242603 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2395  threonine synthase  37.28 
 
 
461 aa  231  3e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000411335  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1291  threonine synthase  34.53 
 
 
469 aa  230  4e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0226346  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2985  threonine synthase  35.24 
 
 
458 aa  229  7e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.17832e-26 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2330  threonine synthase  37.25 
 
 
463 aa  229  7e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.351518  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2558  threonine synthase  35.87 
 
 
476 aa  229  1e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1298  threonine synthase  36.04 
 
 
458 aa  229  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000609388  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0268  threonine synthase  38.24 
 
 
471 aa  228  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.964457  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3205  threonine synthase  35.87 
 
 
476 aa  229  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.87945  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2664  threonine synthase  36.83 
 
 
516 aa  228  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1198  threonine synthase  31.69 
 
 
470 aa  228  2e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.823792  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1831  threonine synthase  37.67 
 
 
461 aa  228  2e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1413  threonine synthase  38.16 
 
 
466 aa  228  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.778378  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2341  threonine synthase  38.05 
 
 
471 aa  228  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0480  threonine synthase  37.69 
 
 
461 aa  228  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.475299  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3524  threonine synthase  37.86 
 
 
470 aa  227  4e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.970017  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2273  threonine synthase  34.22 
 
 
466 aa  227  4e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.593832  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3578  threonine synthase  36.64 
 
 
470 aa  227  4e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2024  threonine synthase  35.66 
 
 
472 aa  227  4e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>