More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4336 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4336  50S ribosomal protein L9  100 
 
 		 150 aa  296  5e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3697  ribosomal protein L9  66.67 
 
 		 149 aa  205  1e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37780  LSU ribosomal protein L9P  65.99 
 
 		 149 aa  200  6e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.236654  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  64.38 
 
 		 148 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  62.42 
 
 		 149 aa  191  3e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  60.14 
 
 		 148 aa  187  5.999999999999999e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3352  ribosomal protein L9  65.31 
 
 		 151 aa  183  8e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.600621  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0130  50S ribosomal protein L9  56.76 
 
 		 149 aa  180  6e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0311991 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  57.43 
 
 		 148 aa  177  4e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4178  ribosomal protein L9  64.14 
 
 		 151 aa  177  5.999999999999999e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0334  50S ribosomal protein L9  62.59 
 
 		 151 aa  177  5.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.801723 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31750  LSU ribosomal protein L9P  57.82 
 
 		 157 aa  176  8e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26560  LSU ribosomal protein L9P  64.19 
 
 		 148 aa  176  1e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.199017 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3092  50S ribosomal protein L9  59.59 
 
 		 148 aa  175  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370883  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3888  50S ribosomal protein L9  60.69 
 
 		 150 aa  174  5e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00361277 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4553  50S ribosomal protein L9  56.46 
 
 		 148 aa  171  2.9999999999999996e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156994  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9354  50S ribosomal protein L9P  56.76 
 
 		 148 aa  171  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5065  50S ribosomal protein L9  55.78 
 
 		 148 aa  169  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.972236  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4661  50S ribosomal protein L9P  56.76 
 
 		 148 aa  169  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7309  50S ribosomal protein L9  54.05 
 
 		 148 aa  165  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  0.0304173 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4117  50S ribosomal protein L9  59.31 
 
 		 150 aa  165  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2522  ribosomal protein L9  56.55 
 
 		 150 aa  164  2.9999999999999998e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.559663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  54.73 
 
 		 148 aa  164  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23230  LSU ribosomal protein L9P  59.73 
 
 		 153 aa  162  1.0000000000000001e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5065  ribosomal protein L9  58.22 
 
 		 151 aa  159  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.366091  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7042  ribosomal protein L9  55.78 
 
 		 151 aa  155  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4737  ribosomal protein L9  54.05 
 
 		 150 aa  147  6e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4166  ribosomal protein L9  53.06 
 
 		 150 aa  146  9e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6031  50S ribosomal protein L9  49.66 
 
 		 151 aa  142  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.827335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0877  50S ribosomal protein L9  49.66 
 
 		 151 aa  141  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5743  50S ribosomal protein L9  51.01 
 
 		 152 aa  139  9e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.245852 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5367  50S ribosomal protein L9  51.01 
 
 		 152 aa  139  9e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5456  50S ribosomal protein L9  51.01 
 
 		 152 aa  139  9e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166119  normal  0.0135281 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5366  ribosomal protein L9  49.32 
 
 		 151 aa  137  6e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39420  LSU ribosomal protein L9P  46.62 
 
 		 152 aa  134  4e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10055  50S ribosomal protein L9  47.65 
 
 		 152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.95125e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  43.54 
 
 		 147 aa  124  6e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2535  ribosomal protein L9  40.69 
 
 		 148 aa  120  5e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000849852  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1216  50S ribosomal protein L9  43.45 
 
 		 148 aa  119  9.999999999999999e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0311  ribosomal protein L9  42.76 
 
 		 148 aa  118  1.9999999999999998e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0979697 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2332  ribosomal protein L9  38.62 
 
 		 170 aa  113  6.9999999999999995e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.640711  hitchhiker  0.00706783 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0448  50S ribosomal protein L9  38.93 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  43.45 
 
 		 146 aa  110  6e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  38.36 
 
 		 150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3121  ribosomal protein L9  41.38 
 
 		 193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3303  ribosomal protein L9  37.24 
 
 		 149 aa  108  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204917  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  37.93 
 
 		 148 aa  108  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108464  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2212  50S ribosomal protein L9  41.48 
 
 		 150 aa  107  5e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  39.73 
 
 		 147 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  39.31 
 
 		 151 aa  105  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157053  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1205  ribosomal protein L9  36.73 
 
 		 151 aa  105  2e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  39.31 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0901  50S ribosomal protein L9  38.67 
 
 		 189 aa  105  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0476125 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4535  50S ribosomal protein L9  37.93 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4351  ribosomal protein L9  36.3 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3757  50S ribosomal protein L9  37.16 
 
 		 148 aa  105  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1814  ribosomal protein L9  38 
 
 		 149 aa  103  6e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1150  50S ribosomal protein L9  36.73 
 
 		 165 aa  103  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292661  hitchhiker  0.00494207 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11530  ribosomal protein L9  40.41 
 
 		 191 aa  103  6e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0446546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4931  50S ribosomal protein L9  37.24 
 
 		 148 aa  103  8e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.108353  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2306  50S ribosomal protein L9  39.31 
 
 		 189 aa  102  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.891012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  40.69 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2022  50S ribosomal protein L9  43.15 
 
 		 168 aa  103  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  39.04 
 
 		 171 aa  102  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000225617  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3528  50S ribosomal protein L9  42.54 
 
 		 168 aa  102  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.156676  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  41.1 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1479  50S ribosomal protein L9  38.51 
 
 		 147 aa  101  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00653221 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  39.73 
 
 		 148 aa  101  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  37.93 
 
 		 151 aa  101  3e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  36.49 
 
 		 148 aa  101  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  hitchhiker  0.000000000000102152 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0881  50S ribosomal protein L9  37.24 
 
 		 148 aa  101  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00774862  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0023  ribosomal protein L9  39.16 
 
 		 174 aa  101  3e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.725827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0397  hypothetical protein  32.19 
 
 		 149 aa  101  4e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2510  50S ribosomal protein L9  39.31 
 
 		 194 aa  101  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.531472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0566  50S ribosomal protein L9  35.57 
 
 		 189 aa  101  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0491  ribosomal protein L9  35.17 
 
 		 179 aa  101  4e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  37.24 
 
 		 147 aa  100  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0458  50S ribosomal protein L9  36.24 
 
 		 189 aa  100  5e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0452  50S ribosomal protein L9  36.24 
 
 		 189 aa  100  6e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.206752  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0011  50S ribosomal protein L9  35.57 
 
 		 150 aa  100  7e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.557694  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0851  50S ribosomal protein L9P  37.16 
 
 		 149 aa  100  9e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0110  50S ribosomal protein L9  37.93 
 
 		 151 aa  99.8  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000508651  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0025  ribosomal protein L9  38.62 
 
 		 178 aa  99.8  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00173008  normal  0.984167 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2761  50S ribosomal protein L9  37.16 
 
 		 147 aa  99  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  34.46 
 
 		 148 aa  99.4  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3363  ribosomal protein L9  39.31 
 
 		 201 aa  99.4  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5913  ribosomal protein L9  43.06 
 
 		 150 aa  98.6  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2559  50S ribosomal protein L9  43.54 
 
 		 152 aa  99  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1996  50S ribosomal protein L9  37.93 
 
 		 148 aa  97.8  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3412  50S ribosomal protein L9  37.41 
 
 		 149 aa  97.8  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  36.55 
 
 		 151 aa  97.4  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1692  50S ribosomal protein L9  36.73 
 
 		 149 aa  97.1  7e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  33.79 
 
 		 148 aa  97.1  7e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3991  50S ribosomal protein L9  39.46 
 
 		 165 aa  97.1  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00054476 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23320  ribosomal protein L9  41.22 
 
 		 147 aa  97.1  8e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.507738  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  38.41 
 
 		 159 aa  96.7  9e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1675  50S ribosomal protein L9  35.62 
 
 		 199 aa  96.3  1e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000107335  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  34.46 
 
 		 147 aa  95.5  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09988  ribosomal protein L9  37.41 
 
 		 149 aa  95.9  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536224  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5657  50S ribosomal protein L9  39.46 
 
 		 148 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000227696  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>