More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3330 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3330  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 398 aa  741    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0149067  normal  0.138525 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2525  histidine kinase  39.49 
 
 		 434 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0362104  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09220  signal transduction histidine kinase  39.72 
 
 		 492 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.253701 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0204  histidine kinase  36.99 
 
 		 446 aa  186  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0609  histidine kinase  37.38 
 
 		 442 aa  182  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2507  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.03 
 
 		 405 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401085  normal  0.727575 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4456  histidine kinase  37.03 
 
 		 410 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1961  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.7 
 
 		 444 aa  173  5e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000367534  hitchhiker  0.000000631341 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0262  putative signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 		 465 aa  173  5e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186103 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4728  histidine kinase  35.96 
 
 		 429 aa  172  9e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3200  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.73 
 
 		 395 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1360  histidine kinase  46.4 
 
 		 476 aa  169  6e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.388977 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5647  histidine kinase  33.33 
 
 		 433 aa  168  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.559873  normal  0.146404 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3546  histidine kinase  42.81 
 
 		 489 aa  167  4e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.871685 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0386  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.52 
 
 		 418 aa  166  5e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4415  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.49 
 
 		 386 aa  163  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0384972 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2927  histidine kinase  35.34 
 
 		 383 aa  160  4e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000936268  hitchhiker  0.0000101948 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9331  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.68 
 
 		 508 aa  160  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.542521 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0635  histidine kinase  42.24 
 
 		 430 aa  157  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.181904 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4606  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.51 
 
 		 417 aa  156  5.0000000000000005e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0890367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3934  histidine kinase  34.23 
 
 		 442 aa  155  8e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.32 
 
 		 405 aa  155  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.130128 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2700  histidine kinase  37.06 
 
 		 429 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000394923  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0199  histidine kinase  36.92 
 
 		 452 aa  153  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3718  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.12 
 
 		 586 aa  150  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6138  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.6 
 
 		 403 aa  150  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278868  normal  0.229544 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1255  histidine kinase  40.08 
 
 		 463 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0949  histidine kinase  42.67 
 
 		 416 aa  147  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2757  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  37.5 
 
 		 433 aa  146  5e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.128423  normal  0.0502627 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0354  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 438 aa  143  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0329  signal transduction histidine kinase  40.38 
 
 		 435 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.982298  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2249  histidine kinase  42.51 
 
 		 420 aa  142  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.795375  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.1 
 
 		 428 aa  142  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1652  Histidine kinase  32.51 
 
 		 439 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal  0.680022 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2091  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.92 
 
 		 466 aa  139  6e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2298  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.31 
 
 		 432 aa  138  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317439  normal  0.783172 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4726  histidine kinase  32.6 
 
 		 405 aa  138  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6198  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.5 
 
 		 415 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.129005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0211  histidine kinase  32.04 
 
 		 463 aa  137  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0424  histidine kinase  33.89 
 
 		 438 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.680525  hitchhiker  0.00719111 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4333  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.2 
 
 		 343 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0375931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3491  putative signal transduction histidine kinase  43.48 
 
 		 624 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2433  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 		 461 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.189775  normal  0.142881 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4660  histidine kinase  44.12 
 
 		 402 aa  130  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1916  histidine kinase  38.02 
 
 		 410 aa  129  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3763  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.33 
 
 		 375 aa  129  9.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.200679  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3867  histidine kinase  34.04 
 
 		 434 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.265271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12660  signal transduction histidine kinase  41.98 
 
 		 444 aa  127  3e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.224023  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35880  signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 		 454 aa  127  5e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.263807 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3104  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.79 
 
 		 459 aa  125  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.8316  hitchhiker  0.000380562 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2301  Histidine kinase  44.33 
 
 		 412 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6699  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.65 
 
 		 621 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0531  histidine kinase  42.92 
 
 		 429 aa  118  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.005431  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4688  histidine kinase  43 
 
 		 419 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2340  histidine kinase  40.2 
 
 		 388 aa  116  7.999999999999999e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2281  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 		 445 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.67096  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.19 
 
 		 422 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3908  putative signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 		 435 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3982  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 		 435 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.335335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3923  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 		 435 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534106  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2758  histidine kinase  43 
 
 		 389 aa  113  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00845914  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2132  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 		 433 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.569038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0319  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.19 
 
 		 382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.099987 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3916  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.34 
 
 		 431 aa  111  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.257994  normal  0.0672811 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17590  signal transduction histidine kinase  40.67 
 
 		 326 aa  110  4.0000000000000004e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0109488  normal  0.353356 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0085  putative signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 		 587 aa  108  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0248  putative signal transduction histidine kinase  43.12 
 
 		 470 aa  105  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4385  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.35 
 
 		 445 aa  104  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4021  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 		 411 aa  103  7e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185539  normal  0.088504 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0811  histidine kinase  35.24 
 
 		 580 aa  100  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0967  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.25 
 
 		 408 aa  100  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.849709 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4050  Histidine kinase  40.69 
 
 		 374 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.313821  hitchhiker  0.00550271 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3516  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.54 
 
 		 388 aa  98.6  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.370817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1568  histidine kinase  35.41 
 
 		 462 aa  97.4  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.33 
 
 		 408 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.155683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3834  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 		 709 aa  95.9  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.154622  normal  0.0585187 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1533  histidine kinase  38.57 
 
 		 451 aa  94.4  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0016197  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2642  histidine kinase  35.77 
 
 		 426 aa  94  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.992033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3408  histidine kinase  35.19 
 
 		 686 aa  94  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000158036  hitchhiker  0.000062789 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003135  sensor histidine kinase  31.73 
 
 		 451 aa  93.6  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291514  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0554  Histidine kinase  36.84 
 
 		 687 aa  93.2  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 463 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3280  histidine kinase  35.94 
 
 		 664 aa  91.3  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00155771  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11900  signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 		 447 aa  90.9  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2540  putative signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 		 570 aa  91.3  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_935  sensor histidine kinase  30.13 
 
 		 1226 aa  90.5  4e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6528  histidine kinase  35.24 
 
 		 592 aa  90.9  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 564 aa  90.1  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 		 1229 aa  90.1  6e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7224  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 		 594 aa  89.7  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  32.44 
 
 		 430 aa  89.4  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1983  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.76 
 
 		 469 aa  89.4  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0971  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.27 
 
 		 417 aa  89  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4245  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.53 
 
 		 595 aa  88.6  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2605  Histidine kinase  37.98 
 
 		 650 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209527  normal  0.327771 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 		 407 aa  88.2  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2603  Histidine kinase  36.32 
 
 		 720 aa  88.2  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00739798  normal  0.140215 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6491  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 		 576 aa  87  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194722  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0895  sensor histidine kinase  34.17 
 
 		 451 aa  87  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.622783  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  28.92 
 
 		 388 aa  87  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>