More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0076 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0076  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
315 aa  622  1e-177  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.097535  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1513  cation diffusion facilitator family transporter  72.19 
 
 
302 aa  430  1e-119  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.5227 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2184  cation diffusion facilitator family transporter  42.41 
 
 
303 aa  202  4e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1199  cation diffusion facilitator family transporter  39.31 
 
 
315 aa  189  4e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000135405  hitchhiker  0.00000509926 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0374  cation diffusion facilitator family transporter  40.83 
 
 
303 aa  187  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1410  cation diffusion facilitator family transporter  36.27 
 
 
333 aa  144  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0491  cation diffusion facilitator family transporter  32.53 
 
 
354 aa  141  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0566502 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3647  cation diffusion facilitator family transporter  29.01 
 
 
395 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3150  cation diffusion facilitator family transporter  31.02 
 
 
401 aa  134  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1794  cation diffusion facilitator family transporter  31.88 
 
 
299 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1722  cation diffusion facilitator family transporter  31.91 
 
 
299 aa  127  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3583  cation diffusion facilitator family transporter  28.33 
 
 
392 aa  127  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000126728  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  30.88 
 
 
291 aa  125  7e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0858  cation efflux protein  30.07 
 
 
299 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0051  cation diffusion facilitator family transporter  28.03 
 
 
306 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2005  cation diffusion facilitator family transporter  32.03 
 
 
299 aa  125  9e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0051  cation diffusion facilitator family transporter  28.03 
 
 
306 aa  125  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1712  cation diffusion facilitator family transporter  29.71 
 
 
306 aa  124  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00125134  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0663  cation diffusion facilitator family transporter  25 
 
 
312 aa  125  1e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0132428  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2613  cation efflux family protein  31.16 
 
 
296 aa  124  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0074  cation diffusion facilitator family transporter  25.09 
 
 
313 aa  124  2e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04060  cation diffusion facilitator family transporter  29.17 
 
 
292 aa  124  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2100  cation diffusion facilitator family transporter  31.6 
 
 
310 aa  123  5e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.70845  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1531  cation diffusion facilitator family transporter  31.23 
 
 
317 aa  122  8e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2381  cation diffusion facilitator family transporter  32.55 
 
 
388 aa  122  9e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000223883  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2526  cation diffusion facilitator family transporter  33.68 
 
 
307 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0324472 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0586  cation efflux family protein  29.73 
 
 
393 aa  120  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0440871  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  30.15 
 
 
291 aa  119  6e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2941  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 
307 aa  119  9e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1675  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 
307 aa  119  9e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.282896  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6231  cation diffusion facilitator family transporter  31.65 
 
 
299 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554838  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0576  cation efflux family protein  28.38 
 
 
393 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4982  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 
307 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0279964 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2250  cation diffusion facilitator family transporter  32.77 
 
 
294 aa  118  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000133165  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1587  cation diffusion facilitator family transporter  32.98 
 
 
307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.697729  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0044  cation diffusion facilitator family transporter  27.24 
 
 
381 aa  117  3e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0936  cation diffusion facilitator family transporter  30.48 
 
 
300 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1026  cation diffusion facilitator family transporter  26.88 
 
 
323 aa  116  5e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0960  cation diffusion facilitator family transporter  30 
 
 
291 aa  116  5e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3245  cation efflux protein  30.22 
 
 
309 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1366  cation diffusion facilitator family transporter  28.79 
 
 
422 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1788  cation diffusion facilitator family transporter  29.64 
 
 
299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0431575 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2428  cation diffusion facilitator family transporter  29.64 
 
 
299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000439977  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0496  cation diffusion facilitator family transporter  29.48 
 
 
318 aa  114  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.920568  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1774  cation diffusion facilitator family transporter  26.04 
 
 
293 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000103729  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1549  cation diffusion facilitator family transporter  27.14 
 
 
290 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  28.92 
 
 
301 aa  113  5e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3548  cation diffusion facilitator family transporter  29.85 
 
 
320 aa  112  8.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.058207 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1511  cation diffusion facilitator family transporter  33.45 
 
 
314 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00242761  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3406  cation diffusion facilitator family transporter  27.97 
 
 
337 aa  112  8.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3764  cation efflux protein  29.93 
 
 
389 aa  112  9e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0837533 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2239  cation diffusion facilitator family transporter  31.21 
 
 
302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0407082  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0577  cation diffusion facilitator family transporter  30.71 
 
 
308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.215169 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0974  cation diffusion facilitator family transporter  30.88 
 
 
320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0634  cation efflux family protein  28.57 
 
 
314 aa  110  3e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0023  cation diffusion facilitator family transporter  32.53 
 
 
295 aa  110  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08140  cation diffusion facilitator family transporter  30.07 
 
 
369 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.150714  normal  0.172071 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0339  cation diffusion facilitator family transporter  30.24 
 
 
293 aa  109  8.000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000143188  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0858  cation efflux system protein  27.27 
 
 
331 aa  108  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1741  cation diffusion facilitator family transporter  32.75 
 
 
307 aa  107  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00244826  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1450  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  30.56 
 
 
378 aa  107  2e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.59644  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2889  cation diffusion facilitator family transporter  30.19 
 
 
388 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000320508  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1517  cation diffusion facilitator family transporter  30.56 
 
 
378 aa  107  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0069  cation efflux family protein  29.86 
 
 
318 aa  106  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3537  cation diffusion facilitator family transporter  28.47 
 
 
294 aa  106  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0970  cation diffusion facilitator family transporter  28.51 
 
 
390 aa  106  7e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000558459  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5170  cation efflux protein  29.89 
 
 
303 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1051  putative cation efflux system protein  26.09 
 
 
319 aa  105  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2628  cation efflux protein  30.56 
 
 
325 aa  104  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11850  cation diffusion facilitator family transporter  27.93 
 
 
312 aa  103  3e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1437  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  25 
 
 
303 aa  103  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.929913 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  28.72 
 
 
305 aa  103  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0570  cation diffusion facilitator family transporter  27.94 
 
 
298 aa  103  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.712384  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  27.4 
 
 
297 aa  103  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2576  cation diffusion facilitator family transporter  29.72 
 
 
423 aa  102  6e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00102277 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0706  cation efflux family protein  27.05 
 
 
297 aa  102  8e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3126  cation diffusion facilitator family transporter  27.4 
 
 
297 aa  102  8e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2017  hypothetical protein  28.32 
 
 
380 aa  102  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  29.96 
 
 
314 aa  101  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33926  CDF family transporter: cation efflux  28.62 
 
 
378 aa  102  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.119133  normal  0.083968 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4544  cation efflux family protein  27.05 
 
 
297 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4808  ferrous iron efflux protein F  30.07 
 
 
300 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4305  cation efflux family protein  27.05 
 
 
298 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.901101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4143  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  27.05 
 
 
297 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4154  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  27.05 
 
 
298 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4640  cation efflux family protein  27.05 
 
 
298 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4490  cation efflux family protein  27.05 
 
 
297 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013867 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1036  cation diffusion facilitator family transporter  26.52 
 
 
387 aa  101  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.246594  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0465  cation efflux family protein  28.87 
 
 
391 aa  100  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.326406  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0625  cation diffusion facilitator family transporter  28.87 
 
 
391 aa  100  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3813  ferrous iron efflux protein F  28.57 
 
 
298 aa  100  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.70191  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0399  cation diffusion facilitator family transporter  26.48 
 
 
418 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.329701  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4494  cation efflux family protein  27.05 
 
 
298 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2012  hypothetical protein  27.62 
 
 
380 aa  100  4e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5513  cation diffusion facilitator family transporter  30.94 
 
 
295 aa  99.8  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281094  normal  0.363198 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4307  ferrous iron efflux protein F  29.04 
 
 
300 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1731  cation diffusion facilitator family transporter  30.32 
 
 
315 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.560975  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4333  cation efflux protein  28.78 
 
 
297 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3258  cation diffusion facilitator family transporter  30.66 
 
 
390 aa  98.2  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3300  iron and zinc efflux system protein  27.18 
 
 
318 aa  99  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.831799  normal  0.0946092 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>