31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1903 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_1903  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 182 aa  352  2e-96  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0604  transcriptional regulator, XRE family  85.25 
 
 		 183 aa  244  4e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.196411  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0360  transcriptional regulator, XRE family  61.54 
 
 		 181 aa  206  2e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2372  transcriptional regulator, XRE family  65.93 
 
 		 173 aa  191  6e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.128544  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0686  transcriptional regulator, XRE family  63.74 
 
 		 177 aa  185  3e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1462  helix-turn-helix domain-containing protein  41.01 
 
 		 170 aa  127  7.000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.217714  normal  0.212223 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1037  XRE family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 172 aa  122  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.223775  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1304  helix-turn-helix domain-containing protein  39.66 
 
 		 163 aa  118  6e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1032  helix-turn-helix domain-containing protein  36.11 
 
 		 162 aa  103  9e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0621  XRE family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 161 aa  100  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0938  transcriptional regulator, XRE family  32.78 
 
 		 162 aa  100  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.117119  normal  0.710013 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2112  XRE family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 164 aa  97.8  8e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.79317  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1762  XRE family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 159 aa  92  4e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1025  XRE family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 158 aa  91.3  7e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0919  helix-turn-helix domain-containing protein  29.83 
 
 		 158 aa  90.5  1e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.960971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1419  transcriptional regulator, XRE family  31.49 
 
 		 178 aa  89.7  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0459  XRE family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 165 aa  81.3  0.000000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0951  helix-turn-helix domain-containing protein  28.33 
 
 		 159 aa  80.1  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1173  XRE family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 177 aa  79.7  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.359549 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0112  helix-turn-helix domain-containing protein  27.42 
 
 		 182 aa  64.3  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.1301  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1247  transcriptional regulator, XRE family  26.11 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.797623  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0037  helix-turn-helix domain-containing protein  25.56 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2081  DNA binding domain-containing protein  28.29 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2145  XRE family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1157  DNA binding domain-containing protein  32.84 
 
 		 174 aa  52.8  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0872862  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0034  XRE family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 160 aa  52.4  0.000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00826547 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2656  transcription factor of MBF1-like protein  27.01 
 
 		 186 aa  50.4  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14374  predicted protein  30 
 
 		 104 aa  47  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.123267  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1076  XRE family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 161 aa  47  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0707  helix-turn-helix domain-containing protein  29.69 
 
 		 134 aa  47  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.866911  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69049  predicted protein  34.62 
 
 		 150 aa  42  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>