More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2228 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2228  hypothetical protein  100 
 
 		 306 aa  613  9.999999999999999e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.581502  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3930  protein of unknown function Met10  34.12 
 
 		 479 aa  117  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0051  hypothetical protein  31.12 
 
 		 397 aa  116  6e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1764  PUA domain-containing protein  30.04 
 
 		 396 aa  116  6e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0181071  hitchhiker  0.000729336 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1479  SAM-dependent methyltransferase  29.34 
 
 		 396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.41969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4037  PUA domain-containing protein  30.62 
 
 		 397 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.663766  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2348  hypothetical protein  29.07 
 
 		 396 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00971  predicted methyltransferase  27.52 
 
 		 367 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.406744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2676  Protein of unknown function methylase putative  27.52 
 
 		 391 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00640456  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00978  hypothetical protein  27.52 
 
 		 367 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.536136  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2620  PUA domain-containing protein  28.52 
 
 		 396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.925241  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1082  hypothetical protein  28.68 
 
 		 396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305834  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2629  hypothetical protein  27.52 
 
 		 396 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3209  PUA domain-containing protein  28.52 
 
 		 396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310372  hitchhiker  0.00624197 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2531  PUA domain-containing protein  28.52 
 
 		 396 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149563  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1076  hypothetical protein  27.52 
 
 		 396 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1132  hypothetical protein  28.68 
 
 		 396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.250632 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2151  hypothetical protein  27.52 
 
 		 396 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111749  normal  0.201335 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1143  protein YccW  29.34 
 
 		 403 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1121  SAM-dependent methyltransferase  29.34 
 
 		 403 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.50041e-16 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1189  hypothetical protein  29.34 
 
 		 403 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.887543 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1038  protein YccW  29.34 
 
 		 403 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.677771  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1155  hypothetical protein  29.34 
 
 		 403 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.282182  normal  0.900174 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0070  hypothetical protein  33.02 
 
 		 338 aa  108  8.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3155  SAM-dependent methyltransferase  30.23 
 
 		 411 aa  108  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1049  hypothetical protein  32.24 
 
 		 399 aa  107  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.157301  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3390  PUA domain-containing protein  27.95 
 
 		 396 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2932  PUA domain-containing protein  28.47 
 
 		 396 aa  106  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0650  putative SAM-dependent methyltransferase  26.97 
 
 		 400 aa  105  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1011  SAM-dependent methyltransferase  28.11 
 
 		 396 aa  105  9e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.719099 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1063  PUA domain containing protein  28.47 
 
 		 396 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504036 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3515  PUA domain-containing protein  28.47 
 
 		 396 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3799  SAM-dependent methyltransferase  30.95 
 
 		 395 aa  104  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.220774 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3294  PUA domain-containing protein  28.47 
 
 		 396 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0973  SAM-dependent methyltransferase  28.11 
 
 		 396 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.510915 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0977  SAM-dependent methyltransferase  28.11 
 
 		 396 aa  105  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2332  hypothetical protein  27.3 
 
 		 335 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.946528  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3698  PUA domain containing protein  29.29 
 
 		 400 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3375  PUA domain containing protein  29.37 
 
 		 397 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4073  SAM-dependent methyltransferase  30.07 
 
 		 402 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.910073  normal  0.355186 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1149  SAM-dependent methyltransferase  27.76 
 
 		 396 aa  103  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2332  hypothetical protein  27.3 
 
 		 335 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.97863  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2014  hypothetical protein  27.3 
 
 		 335 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622676 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2449  hypothetical protein  27.3 
 
 		 335 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.861715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2965  putative SAM-dependent methyltransferase  29.07 
 
 		 396 aa  103  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1709  hypothetical protein  26.55 
 
 		 396 aa  102  6e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.44914  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003801  methyltransferase  35.62 
 
 		 310 aa  102  9e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2998  hypothetical protein  29.28 
 
 		 397 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3540  hypothetical protein  29.11 
 
 		 409 aa  100  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1662  putative oxidoreductase  30.04 
 
 		 392 aa  100  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338862  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46093  predicted protein  28.4 
 
 		 839 aa  100  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02370  methyltransferase  28.29 
 
 		 397 aa  100  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0073  PUA domain-containing protein  31.43 
 
 		 400 aa  100  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4815  hypothetical protein  29.69 
 
 		 338 aa  100  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195224  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0968  hypothetical protein  28.68 
 
 		 418 aa  100  4e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000850762  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1977  hypothetical protein  28.93 
 
 		 297 aa  99.4  7e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.257048  hitchhiker  0.000740302 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02689  methyltransferase  34.86 
 
 		 310 aa  99.4  7e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4030  protein of unknown function Met10  26.78 
 
 		 552 aa  97.8  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2168  PUA domain-containing protein  27.84 
 
 		 395 aa  97.4  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2105  hypothetical protein  27.22 
 
 		 335 aa  98.2  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0346  PUA domain containing protein  29.76 
 
 		 400 aa  97.4  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.734176 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4260  hypothetical protein  27.11 
 
 		 335 aa  96.3  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00951955 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3633  hypothetical protein  26.76 
 
 		 350 aa  96.3  6e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6438  SAM-dependent methyltransferase  27.93 
 
 		 404 aa  95.9  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1912  hypothetical protein  26.9 
 
 		 321 aa  95.9  8e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1143  hypothetical protein  28.62 
 
 		 321 aa  95.1  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4665  hypothetical protein  24.34 
 
 		 399 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2451  hypothetical protein  27.92 
 
 		 380 aa  95.1  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  30.47 
 
 		 392 aa  95.1  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003408  hypothetical protein  27.56 
 
 		 397 aa  95.1  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000270562  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2247  hypothetical protein  25.97 
 
 		 396 aa  94.7  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4650  hypothetical protein  24.34 
 
 		 399 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4435  hypothetical protein  24.34 
 
 		 399 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4666  hypothetical protein  24.34 
 
 		 399 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4780  hypothetical protein  24.34 
 
 		 399 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4368  PUA domain-containing protein  25.22 
 
 		 399 aa  94.4  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4653  hypothetical protein  24.34 
 
 		 399 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3105  PUA domain-containing protein  28.62 
 
 		 404 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.281212 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2968  SAM-dependent methyltransferase  34.56 
 
 		 396 aa  94.4  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.343918  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2474  PUA domain-containing protein  28.62 
 
 		 404 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78499  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3598  hypothetical protein  37.88 
 
 		 338 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1873  hypothetical protein  26.92 
 
 		 335 aa  94.7  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3088  PUA domain-containing protein  28.62 
 
 		 404 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4274  methyltransferase  24.34 
 
 		 399 aa  94  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.314948  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0587  hypothetical protein  24.34 
 
 		 399 aa  94  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4285  methyltransferase  24.34 
 
 		 399 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3595  hypothetical protein  26.95 
 
 		 335 aa  93.6  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.222828  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1918  hypothetical protein  29.41 
 
 		 318 aa  93.6  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453837  normal  0.204639 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1491  hypothetical protein  32.69 
 
 		 308 aa  92.8  6e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000879827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1607  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  26.69 
 
 		 713 aa  92.8  7e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00710463  normal  0.246745 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1540  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  26.69 
 
 		 713 aa  92.4  8e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2997  PUA domain-containing protein  27.93 
 
 		 404 aa  92.4  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0717099 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2527  hypothetical protein  30.63 
 
 		 320 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166496  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2626  hypothetical protein  30.15 
 
 		 396 aa  91.7  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316622  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1946  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  27.5 
 
 		 711 aa  92  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.478167  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4172  hypothetical protein  38.29 
 
 		 338 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3083  PUA domain-containing protein  28.28 
 
 		 404 aa  91.7  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0506746 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2556  hypothetical protein  28.33 
 
 		 302 aa  91.7  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3134  PUA domain-containing protein  27.59 
 
 		 404 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312464  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1601  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  27.4 
 
 		 713 aa  92  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0419159  normal  0.867514 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>